临床样本及患者PBMC中ZBP1表达分析
评估ZBP1在脓毒症患者中的表达水平及其与疾病严重程度的关系。
从17名脓毒症患者和6名健康对照中采集外周血,分离PBMC,通过Western blot和RT-qPCR检测ZBP1表达,并与SOFA评分进行相关性分析。
ZBP1 activated by mitochondrial damage binds to STAT3 to suppress Legumain production and exacerbate macrophage inflammation in Klebsiella pneumoniae-induced sepsis
结合人类脓毒症队列转录组、小鼠KP感染与CLP模型、基因敲除小鼠、单细胞RNA测序、免疫共沉淀、质谱、ChIP及体内AAV过表达等多层级验证,具备功能与机制验证。
小鼠KP感染模型 小鼠CLP脓毒症模型 骨髓来源巨噬细胞(BMDM) THP-1巨噬细胞 HEK-293T细胞
ZBP1在脓毒症患者PBMC中的表达及与SOFA评分的相关性 KP感染及CLP模型中ZBP1的诱导及细胞定位 Zbp1敲除对小鼠存活率及炎症因子水平的影响 ZBP1与STAT3的相互作用及对STAT3磷酸化与核转位的影响 LGMN对巨噬细胞极化及上皮屏障功能的作用
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估ZBP1在脓毒症患者中的表达水平及其与疾病严重程度的关系。
从17名脓毒症患者和6名健康对照中采集外周血,分离PBMC,通过Western blot和RT-qPCR检测ZBP1表达,并与SOFA评分进行相关性分析。
在KP感染和CLP模型中验证ZBP1的作用及其对存活、炎症和器官损伤的影响。
对WT、Zbp1-/-、Ripk3-/-、Mlkl-/-等基因型小鼠进行KP腹腔注射或CLP手术,记录生存率,检测血清TAT、ALT、AST、CK水平,进行组织病理学评估。
确定ZBP1在巨噬细胞中的功能及可能的下游机制。
使用髓系特异性Zbp1敲除小鼠,通过免疫荧光检测组织巨噬细胞浸润和表型,评估肠道屏障损伤和组织转录组,寻找差异表达基因。
明确KP感染中ZBP1激活的上游信号。
利用WT、Sting-/-、Ifnar1-/-、Ripk3-/-小鼠来源的BMDM,检测KP感染后ZBP1表达;通过透射电镜、Seahorse等评估线粒体损伤;检测Z-DNA积累和线粒体ROS。
揭示ZBP1下游效应分子LGMN的表达调节及对巨噬细胞炎症和屏障功能的作用。
通过转录组鉴定Lgmn为ZBP1下游上调基因。使用重组LGMN、抑制剂RR-11a、Lgmn敲除小鼠和AAV9过表达,检测巨噬细胞极化、TEER和体内炎症及器官损伤。
确定ZBP1调控LGMN表达的分子机制。
通过免疫共沉淀、LC-MS/MS鉴定ZBP1相互作用蛋白,验证ZBP1与STAT3结合。检测STAT3磷酸化和核转位,以及STAT3对Lgmn启动子的调控。
在体内证实LGMN在KP脓毒症中的保护作用。
使用LgmnCKO小鼠和AAV9过表达LGMN的小鼠,评估KP感染后生存率、血清损伤标志物、组织病理和肠道屏障完整性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 蛋白提取与免疫印迹 | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| 蛋白酶抑制剂 | Med Chem Express | HY-K0010 | |
| 磷酸酶抑制剂 | Med Chem Express | HY-K0021 | |
| 免疫印迹 | PVDF膜 | Millipore | -- |
| 二抗 (7074或7076) | Cell Signaling Technology | 7074/7076 | |
| 免疫印迹检测 | TANON 5200化学发光成像系统 | TANON | -- |
| 细胞转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | L3000150 |
| Neon转染系统 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 质粒构建 | pCMV3-GFP-Puro-c6×His-Lgmn质粒 | Corues Biotechnology | -- |
| ZBP1-Flag等质粒 | General Biosystems | -- | |
| AAV介导的过表达 | AAV9-F4/80-MCS-3Flag-T2A-ZsGreen | General Biol | VA063-AAV9-F4/80-MCS-3Flag-T2A-ZsGreen |
| PBMC分离 | Lymphoprep™分离液 | STEMCELL Technologies | 07801 |
| SepMate™管 | STEMCELL Technologies | 85415 | |
| 动物模型 | NTUH-K2044菌株 | -- | -- |
| ATCC-700603菌株 | -- | -- | |
| 体外细胞实验 | Stattic | -- | -- |
| 重组LGMN蛋白 | -- | -- | |
| RR-11a | -- | -- | |
| 线粒体ROS检测 | MitoSOX | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本分析 | 脓毒症患者与健康对照的样本量、采集时间、ZBP1表达检测方法 阅读提示:Methods 2.1 Human blood samples and human peripheral blood mononuclear cells isolation |
| 小鼠脓毒症模型 | 小鼠品系、周龄、性别、KP菌株、感染剂量、给药方式、观察时间 阅读提示:Methods 2.2 Animals and treatments; 2.3 Bacteria preparation |
| ZBP1激活机制 | BMDM感染MOI、时间、IFN信号通路相关基因敲除小鼠品系、线粒体损伤检测方法 阅读提示:Methods 2.5, 3.3节 |
| ZBP1与STAT3相互作用 | 免疫共沉淀条件、STAT3抑制剂浓度、转染细胞类型、ZBP1截短突变体 阅读提示:Methods 2.6, 3.6节 |
| LGMN功能验证 | 重组LGMN浓度、RR-11a浓度、AAV9注射剂量、LgmnCKO小鼠来源、TEER测量细节 阅读提示:Methods 2.7, 3.5节 |