临床队列与长期生存随访
评估OV联合PD-1阻断在肢端黑色素瘤中的长期临床获益。
30例可切除肢端黑色素瘤患者接受Orienx010联合特瑞普利单抗新辅助治疗,随访5年,记录RFS、DMFS、EFS和OS。
Long-term survival benefit of neoadjuvant oncolytic virus plus PD-1 blockade in acral melanoma: implications of STING in resistance and potential therapy
含临床试验、多组学分析及小鼠模型验证,具备体外与体内证据层级,并进行功能与机制验证。
B16黑色素瘤小鼠足垫模型 肢端黑色素瘤患者队列
患者入组标准为可切除的肢端黑色素瘤(30例) 按病理反应将患者分为应答者(≤50%残余存活肿瘤细胞)和无应答者(>50%) 治疗包括Orienx010(溶瘤病毒)联合Toripalimab(抗PD-1) STING激动剂KL340399的剂量:4 mg溶于1000 µL DMSO,稀释至0.4 mg/mL,每只鼠静脉注射50 µL(2 mg/mL) B16细胞接种剂量:5×10^5细胞/25 µL PBS,注射于小鼠足垫
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估OV联合PD-1阻断在肢端黑色素瘤中的长期临床获益。
30例可切除肢端黑色素瘤患者接受Orienx010联合特瑞普利单抗新辅助治疗,随访5年,记录RFS、DMFS、EFS和OS。
比较无应答者与应答者的基线基因组、表观基因组和转录组特征,以识别耐药相关的内在特征。
对30例治疗前活检样本进行WES、WTS和TBS分析,以及16例患者的Olink蛋白质组学,比较无应答者和应答者的突变、甲基化和基因表达。
揭示应答者和无应答者在治疗诱导的肿瘤微环境和系统免疫重塑中的差异。
分析治疗前后配对的肿瘤和血液样本,包括WES、WTS、TBS和Olink蛋白质组学,评估免疫浸润、基因表达和甲基化变化。
在免疫功能正常的小鼠模型中验证STING通路激活是否能增强OV联合PD-1阻断的抗肿瘤疗效。
使用B16黑色素瘤足垫模型,随机分组接受OV+抗PD-1或联合STING激动剂KL340399,监测肿瘤生长,并通过免疫组化和流式细胞术分析免疫微环境。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | KL340399(STING激动剂) | -- | -- |
| Orienx010(溶瘤病毒) | -- | -- | |
| 抗小鼠PD-1抗体 | InVivoMAb | BE0146 | |
| DNA提取与片段化 | Covaris S220超声破碎仪 | Covaris | S220 |
| DNA定量 | Qubit双链DNA高灵敏度检测试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| NanoDrop 2000分光光度计 | Thermo Fisher Scientific | 2000 | |
| 测序文库构建 | DNBSEQ-T7RS测序平台 | BGI | DNBSEQ-T7RS |
| 靶向甲基化富集 | EZ DNA甲基化-闪电™试剂盒 | Zymo Research | -- |
| 靶向甲基化捕获 | SeqCap Epi CpGiant 4 M panel | Roche | -- |
| RNA-seq | NuGEN Ribo-SPIA扩增技术 | NuGEN | -- |
| 免疫组化 | 抗p-STING抗体 | Affinity | AF7416 |
| 抗p-IRF3抗体 | HuaBio | HA722772 | |
| 抗p-TBK1抗体 | CST | 5483 | |
| 二抗检测试剂 | ZSGB-BIO | PV6001 | |
| AEC底物试剂盒 | ZSGB-BIO | ZLI-9036 | |
| 流式细胞术 | Zombie Aqua™可固定活力试剂盒 | BioLegend | 423101 |
| 细胞染色缓冲液 | BioLegend | 420201 | |
| BD LSRFortessa™ X-20流式细胞仪 | BD | LSRFortessa | |
| 细胞处理 | gentleMACS组织解离器 | Miltenyi Biotec | -- |
| 免疫组化 | 柠檬酸盐缓冲液 | Beyotime | P0081 |
| 山羊血清 | Beyotime | C0265 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者入组与分组 | 入组标准:可切除的肢端黑色素瘤;分组依据病理反应(≤50%残余存活肿瘤细胞为应答者,>50%为无应答者);影像学进展患者归为无应答者 阅读提示:Methods - Tumor specimens and profiling |
| 治疗与剂量 | Orienx010用药剂量和方案;特瑞普利单抗剂量和给药时间;STING激动剂KL340399的剂量和给药途径(静脉注射50 µL,2 mg/mL) 阅读提示:Methods - Animal studies and drug formulation |
| 多组学分析 | WES、WTS、TBS的样本量、测序平台和参数;Olink蛋白质组学的时间点和分析方法 阅读提示:Methods - Tumor specimens and profiling, WES data processing, RNA-Seq data processing, DNA methylation profiling, Olink proteomics |
| 体内实验 | B16细胞接种剂量(5×10^5细胞/25 µL PBS)和部位;小鼠品系(C57BL/6J);治疗分组和样本量(每组5只);给药方案 阅读提示:Methods - Animal studies and drug formulation |
| 统计分析 | 统计方法:卡方检验、Fisher精确检验、Wilcoxon秩和检验、Kaplan-Meier分析、log-rank检验、Pearson相关、t检验 阅读提示:Methods - Statistics |