患者队列筛选与样本收集
纳入符合条件的非鳞状NSCLC患者并收集纵向配对FFPE样本。
从CHU Lille的医疗记录中筛选2007-2023年间诊断的非鳞状NSCLC患者,要求至少有一个治疗前和一个治疗后的FFPE样本。共纳入160例患者,收集临床数据和样本。
Consistency of c-Met protein overexpression over time in patients with non-squamous non-small cell lung cancer
研究为回顾性队列分析,包含患者样本的免疫组化、MET扩增检测和NGS分析,但未包含功能验证或机制验证实验。
非鳞状非小细胞肺癌患者的纵向FFPE活检样本(配对样本)
患者纳入标准:非鳞状NSCLC,2007-2023年诊断,至少两个纵向FFPE样本(一个治疗前,一个治疗后) c-Met蛋白过表达定义:≥25%肿瘤细胞3+膜染色;c-Met高过表达定义:≥50%肿瘤细胞3+膜染色 EGFR突变状态:通过NGS检测,38/158(24%)患者检出EGFR突变 样本分析优先级:c-Met IHC、MET扩增、PD-L1表达、NGS 对14例高度不一致(阴性转阳性)患者进行亚组分析
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
纳入符合条件的非鳞状NSCLC患者并收集纵向配对FFPE样本。
从CHU Lille的医疗记录中筛选2007-2023年间诊断的非鳞状NSCLC患者,要求至少有一个治疗前和一个治疗后的FFPE样本。共纳入160例患者,收集临床数据和样本。
评估治疗前后样本中c-Met蛋白过表达状态及其一致性。
对新鲜切片的FFPE样本进行c-Met免疫组化(IHC)染色,由两名独立观察者评估。定义c-Met过表达为≥25%肿瘤细胞3+膜染色,高过表达为≥50%。计算一致率和Kappa系数。
检测MET扩增、PD-L1表达及驱动基因突变状态。
对样本进行MET扩增检测(FISH)、PD-L1表达检测(IHC)及NGS检测驱动基因突变(包括EGFR、KRAS等)。
探讨c-Met表达状态变化与临床特征和分子改变的关系。
根据EGFR突变状态、治疗类型等分组分析c-Met过表达的一致性,并对14例高度不一致(阴性转阳性)的患者进行详细分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者筛选 | 纳入标准:非鳞状NSCLC,至少两个纵向FFPE样本(一个治疗前,一个治疗后) 阅读提示:见Materials and Methods 的 Study Design 部分 |
| c-Met IHC评估 | c-Met蛋白过表达定义:≥25%肿瘤细胞3+膜染色;c-Met高过表达定义:≥50% 阅读提示:见Materials and Methods 的 Assessments 部分 |
| 分子检测 | MET扩增检测方法、PD-L1表达检测方法、NGS检测的基因panel 阅读提示:见Materials and Methods 的 Assessments 部分及补充材料 Data S1 |
| 统计方法 | 一致率计算、Kappa系数、亚组分析统计方法 阅读提示:见补充材料 Data S1 中的 Statistical methods |