空间转录组学揭示了导管内癌与邻近浸润性前列腺癌之间的克隆关系

目的：导管内癌（IDC）的发病机制仍存在争议。与目前认为IDC代表浸润性前列腺癌（PCa）逆行播散的观点相反，我们最近提出了一个替代性的统一假说，名为“重复侵袭、前体进展”（RIPP）。关于高级别前列腺上皮内瘤变（HGPIN）、IDC和邻近浸润性PCa的基因组改变知之甚少。我们的目标是利用空间转录组学阐明HGPIN、IDC和邻近PCa之间的相互克隆关系。方法和结果：从6例Gleason评分3+4=7的前列腺癌根治术标本中选取包含HGPIN、IDC和邻近浸润性PCa的兴趣区域。根据Visium工作流程执行空间转录组分析和文库制备。利用病理学家指导的人工注释来描绘兴趣区域，用于染色体拷贝数变异（CNV）和时空轨迹的整合分析。在所有样本中，邻近的HGPIN、IDC和浸润性PCa共享相同的CNV特征，并伴有各种亚克隆事件。无监督克隆分析显示，在三个样本中，邻近的浸润性亚克隆获得了额外的基因组改变。在两个样本中，HGPIN、IDC和邻近浸润性PCa具有相同的CNV。最后，在一个样本中，与HGPIN和浸润性腺体相比，IDC具有额外的CNV。有监督的轨迹分析一致地将邻近的浸润性PCa置于HGPIN和/或IDC之后的轨迹最后一步。结论：空间转录组学揭示了邻近HGPIN、IDC和浸润性PCa之间的强克隆关系。有监督的轨迹分析不支持在这些有限数量的样本中存在逆行播散，而无监督分析则揭示了HGPIN、IDC和邻近PCa之间复杂的相互关系。