原发性胶质肉瘤的临床和分子特征及胶质与间充质成分的数字空间全转录组分析

胶质肉瘤是IDH野生型胶质母细胞瘤的一种罕见亚型，以恶性胶质和高分级肉瘤样组织学成分混合为特征。胶质肉瘤的临床管理与胶质母细胞瘤相似，预后较差。胶质肉瘤的肉瘤样区域被认为是肿瘤性胶质细胞极端间充质化生的表现。导致该现象的因素尚未完全阐明。在此，我们报告了一个单机构37例胶质肉瘤的系列研究，包括25例的下一代测序数据和4例的数字空间全转录组分析，以表征胶质和间充质成分之间的差异基因表达。将胶质肉瘤的人口学和遗传学特征与75例原发性成人大脑半球IDH野生型非肉瘤样胶质母细胞瘤队列进行比较。胶质肉瘤患者的年龄、肿瘤位置、性别和总生存期与胶质母细胞瘤相似。在下一代测序分析中，胶质肉瘤显示EGFR扩增率显著降低，NF1突变率显著高于胶质母细胞瘤。数字空间全转录组分析显示，肉瘤区域具有独特的转录组谱，参与细胞外基质发育和重塑的基因过度表达。选定的差异表达转录本通过免疫组织化学进一步检测。胶质肉瘤的胶质成分对几丁质酶-3样蛋白1（CHI3L1）的免疫反应性高于胶质母细胞瘤，而肉瘤成分的免疫反应性低至缺失。在胶质肉瘤的肉瘤区域检测到淋巴增强子结合因子1（LEF1）免疫反应性，而未检测到核β-连环蛋白，提示β-连环蛋白独立的无翼（WNT）效应器信号在肉瘤转化中发挥作用。这项研究为越来越多的证明胶质肉瘤和胶质母细胞瘤遗传基础差异的文献增加了内容，确立了空间转录组方法在胶质肉瘤中的可行性，并基于数字空间分析结果作为发现平台，以确定值得进一步研究的通路和免疫组化标记。