基因敲除细胞系的建立
建立缺乏SNX10、OSTM1或CLC-7的细胞系以研究其功能。
在RAW264.7细胞中使用CRISPR/Cas9敲除Clcn7和Ostm1,并已有Snx10敲除细胞;通过测序验证敲除。
The molecular and functional interplay between the osteopetrosis-associated proteins SNX10, OSTM1, and CLC-7 during mouse osteoclastogenesis
包含体外培养RAW264.7细胞和原代脾细胞衍生的破骨细胞模型,并进行功能验证(细胞融合动力学、骨吸收坑实验)和机制验证(免疫荧光、免疫共沉淀、蛋白印迹、定量PCR)。
RAW264.7细胞系(野生型及Snx10、Ostm1、Clcn7基因敲除) 小鼠原代脾细胞来源的破骨细胞(WT、SKO、OKO、CKO) 小鼠模型(SNX10、OSTM1、CLC-7基因敲除小鼠)
细胞类型:RAW264.7细胞或原代脾细胞来源的破骨细胞 基因敲除方法:CRISPR/Cas9(针对Clcn7和Ostm1)或已有敲除小鼠(SNX10、OSTM1、CLC-7) 破骨细胞分化条件:M-CSF(20 ng/mL)和RANKL(20 ng/mL)处理 融合动力学测量:使用相位对比活细胞成像,记录从接触到融合的时间 蛋白相互作用的验证:免疫共沉淀(Co-IP)检测SNX10与CLC-7相互作用
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立缺乏SNX10、OSTM1或CLC-7的细胞系以研究其功能。
在RAW264.7细胞中使用CRISPR/Cas9敲除Clcn7和Ostm1,并已有Snx10敲除细胞;通过测序验证敲除。
比较野生型和突变型破骨细胞的分化、形态和大小。
从脾细胞(WT、SKO、OKO、CKO小鼠)或RAW264.7细胞诱导分化,用M-CSF和RANKL处理,然后进行TRAP染色、肌动蛋白染色,并测量细胞面积。
量化野生型和突变型成熟破骨细胞之间的融合行为。
使用相位对比活细胞成像,记录从细胞接触到融合的时间。
检测SNX10、OSTM1和CLC-7的蛋白水平及物理相互作用。
通过蛋白印迹检测各蛋白的表达,通过免疫共沉淀检测SNX10与CLC-7、OSTM1与CLC-7的相互作用。
确定SNX10、OSTM1和CLC-7在破骨细胞中的亚细胞分布及SNX10对CLC-7/OSTM1外周定位的影响。
使用免疫荧光显微镜观察蛋白与溶酶体标记物LAMP1的共定位,并在WT和SNX10-KO细胞中比较CLC-7和OSTM1的外周分布。
评估突变破骨细胞的骨吸收功能。
将原代脾细胞接种于牛骨片上进行培养,使用TRAcP染色和骨吸收坑分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Sigma-Aldrich | -- |
| α-MEM培养基 | Sigma | -- | |
| 巨噬细胞集落刺激因子 | Peprotech | -- | |
| 核因子κB受体激活因子配体 | R&D Systems | -- | |
| 胎牛血清 | 文中未明确说明 | -- | |
| 谷氨酰胺 | 文中未明确说明 | -- | |
| 青霉素 | 文中未明确说明 | -- | |
| 链霉素 | 文中未明确说明 | -- | |
| 基因编辑 | JetPEI转染试剂 | Polyplus Transfection | -- |
| 杀稻瘟菌素 | BIOPrep | -- | |
| pU6-(BsaI)_CBh-Cas9-T2A-mCherry质粒 | Addgene | -- | |
| 免疫荧光 | TRITC标记鬼笔环肽 | Sigma-Aldrich | P1951 |
| Alexa 488标记鬼笔环肽 | Cell Signaling Technology | 8878S | |
| FITC标记鬼笔环肽 | Sigma-Aldrich | P2582 | |
| 抗Flag-M2抗体 | Sigma-Aldrich | F1804 | |
| 抗V5抗体 | ThermoFisher | R960 | |
| 抗HA抗体 | Babco/Covance | 16B12 | |
| 抗LAMP1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | SC-20011 | |
| 抗CLC7抗体 | 文中未明确说明 | -- | |
| 抗OSTM1抗体 | 文中未明确说明 | -- | |
| Hoechst 33342荧光染料 | Molecular Probes | H-3570 | |
| TRAP染色 | 白细胞酸性磷酸酶试剂盒 | Sigma-Aldrich | -- |
| 转染 | NEB HiFi DNA组装预混液 | New England Biolabs | -- |
| 蛋白检测 | 蛋白质组学 | 文中未明确说明 | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 破骨细胞分化 | 细胞密度(WT为2×10^6细胞/孔,突变体为1×10^6细胞/孔于24孔板)、细胞来源(脾细胞)、刺激因子浓度(M-CSF和RANKL均为20 ng/mL)、培养时间(5-7天) 阅读提示:Methods: Culture of primary mouse OCLs from spleens |
| 基因敲除 | 使用的CRISPR-Cas9质粒(Addgene #135012)、转染试剂(JetPEI)、筛选抗生素浓度(blasticidin 10 μg/mL处理24小时) 阅读提示:Methods: Knocking out Snx10, Ostm1, and Clcn7 in RAW264.7 cells |
| 融合动力学 | 活细胞成像的时间间隔和持续时间,用于测量touch-to-fusion时间;细胞状态(成熟/不成熟)的定义 阅读提示:Methods: Phase-contrast live cell imaging and determination of “touch-to-fusion” time |
| 蛋白定位分析 | 抗体(抗HA、抗V5、抗FLAG、抗LAMP1、抗CLC7、抗OSTM1)以及共定位分析方法 阅读提示:Methods: OCL immunofluorescence and TRAP staining |
| 骨吸收功能 | 骨片类型(牛骨)、培养条件(M-CSF和RANKL浓度)以及吸收坑实验的具体步骤 阅读提示:Supplementary Methods |