高灵敏度ctDNA分析揭示NGS在胰腺癌中遗漏的相关信号

目的：尽管采用多模式治疗，胰腺导管腺癌（PDAC）的死亡率仍然很高，需要改进的生物标志物来指导围手术期护理。本研究评估了在局部PDAC中，通过新一代测序（NGS）和数字液滴PCR（ddPCR）检测到的KRAS突变循环肿瘤DNA（ctDNA）的预后意义。实验设计：在这项前瞻性队列研究（2020-2024年）中，在西北医学中心多个站点纳入了接受新辅助化疗（NAC）的局部PDAC患者。在诊断时、NAC后和切除后，使用肿瘤非依赖性NGS和针对KRAS G12D/V/R突变的ddPCR评估ctDNA血液样本。使用Kaplan-Meier分析评估总生存期（OS）。结果：队列包括106名患者。诊断时，NGS检测到KRAS ctDNA的比例为17.2%（17/99），ddPCR为64.9%（63/97）。两种平台的检测均与较短的OS相关，其中灵敏度更高的ddPCR检测提供了更大的预后区分能力，识别出了NGS未捕获的更多预后不良患者（NGS中位OS 11.2 vs 30.5个月，p<0.001；ddPCR中位OS 24.7 vs 70.9个月，p=0.004）。按检测方法分层，NGS和ddPCR均检测到ctDNA的患者中位OS最短（10.9个月），两种平台均未检测到的患者最长（40.7个月），仅ddPCR检测到的患者处于中间水平（26.9个月；p<0.001）。结论：在局部PDAC中，通过NGS或ddPCR检测到的KRAS突变ctDNA与较差的生存率相关。ddPCR识别出了NGS遗漏的额外患者。将ddPCR与NGS ctDNA测量相结合可能会改善围手术期风险分层，但临床实施前需要验证。