TLSs的鉴定与特征分析
验证牙周炎组织中是否存在TLSs及其与疾病严重程度的关系
利用多重免疫荧光(mIHC)染色检测健康及不同阶段/等级牙周炎患者牙龈组织中的CD20+ B细胞、CD3+CD4+ T细胞、CXCL13及PNAd+ HEVs,并进行量化分析。
Targeting IFN-I driven tertiary lymphoid structures halts B cell-mediated bone loss in periodontitis
包含多重免疫组化、单细胞RNA测序、体外成纤维细胞实验、小鼠牙周炎模型及体内抗体干预等多个独立证据层级,并进行了功能与机制验证。
人牙龈组织样本(健康与牙周炎) 原代人牙龈成纤维细胞(HGFs) P. gingivalis接种结扎诱导牙周炎小鼠模型(LIP)
TLS定义标准:CD20+ B细胞、CD3+CD4+ T细胞和PNAd+ HEVs的聚集体 P. gingivalis LPS或IFNβ刺激HGFs的浓度与时间点 LIP小鼠模型中P. gingivalis接种剂量(109 CFU)及结扎持续时间(8天/16天) 抗IFNAR1抗体(Selleck A2121)的给药剂量与频率(1 μg,隔天一次) 骨吸收量化方法:CEJ至ABC距离测量,5个位点(μCT50)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证牙周炎组织中是否存在TLSs及其与疾病严重程度的关系
利用多重免疫荧光(mIHC)染色检测健康及不同阶段/等级牙周炎患者牙龈组织中的CD20+ B细胞、CD3+CD4+ T细胞、CXCL13及PNAd+ HEVs,并进行量化分析。
评估TLSs与临床参数及手术预后的关系
对45例接受牙周翻瓣手术的重度牙周炎患者牙龈组织进行IHC染色,量化TLS内淋巴细胞密度,并与临床指标(PD, CAL, RBL)及术后无进展生存期进行相关性分析。
探索成纤维细胞异质性及其在TLS形成中的潜在作用
分析公共单细胞RNA测序数据(GSE164241,健康n=13,牙周炎n=8),鉴定成纤维细胞亚群,并通过多重免疫荧光染色验证CXCL13+成纤维细胞的存在。
阐明IFN-I信号在驱动成纤维细胞分化为CXCL13+表型中的作用
分离原代人牙龈成纤维细胞(HGFs),用P. gingivalis LPS、IFNβ等刺激,检测CXCL13、IFNβ等表达;使用SCENIC分析转录因子活性;通过抗IFNAR1抗体和siRNA敲低IRF7/PRDM1验证机制。
在体内模型中验证TLS形成是否与骨破坏相关
建立P. gingivalis接种结扎诱导牙周炎(LIP)小鼠模型,通过流式细胞术检测外周血和牙龈中Tfh和B细胞亚群,通过H&E、TRAP和IHC染色观察TLS结构及破骨细胞,并进行相关性分析。
评估局部阻断IFN-I信号对TLS形成及骨吸收的影响
在LIP小鼠模型中,通过局部牙龈注射抗IFNAR1抗体阻断IFN-I信号,检测骨吸收(micro-CT)、破骨细胞数(TRAP染色)、TLS相关结构(免疫荧光)及B细胞亚群变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 多重免疫荧光染色 | Opal 7色手动免疫组化试剂盒 | Akoya Biosciences | -- |
| 免疫荧光染色 | 抗PNAd抗体 | Biolegend | -- |
| Western blot | 抗IRF7抗体 | Santa Cruz | -- |
| 抗Blimp-1抗体 | CST | -- | |
| ELISA | 人CXCL13 ELISA试剂盒 | MULTI SCIENCES | EK1105 |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | ExCell | -- | |
| 细胞刺激 | 牙龈卟啉单胞菌脂多糖 | InvivoGen | -- |
| IFNβ | Biolegend | -- | |
| siRNA转染 | RFectSP V2转染试剂 | BIOG | -- |
| qPCR | Hieff® qPCR SYBR Green预混液 | Yeason | -- |
| QuantStudio 5实时荧光定量PCR系统 | Thermo Fisher | -- | |
| micro-CT | μCT50显微CT | SCANCO | -- |
| 图片采集 | 尼康显微镜 (DS-Ri1) | Nikon | -- |
| 免疫荧光 | 蔡司Axioscan 7玻片扫描仪 | Zeiss | -- |
| 流式细胞术 | BD FACS Verse流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | Sigma Aldrich | -- |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Sigma Aldrich | -- | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | -- | |
| PVDF膜 | Merck Millipore | -- | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Takara | -- |
| 动物实验 | 抗IFNAR1抗体 | Selleck | A2121 |
| 同型对照抗体 | Selleck | A2106 | |
| 羧甲基纤维素 | -- | -- | |
| 5.0丝线结扎线 | -- | -- | |
| 免疫荧光 | 驴抗小鼠Alexa Fluor 488二抗 | Invitrogen | -- |
| 驴抗兔Alexa Fluor 594二抗 | Invitrogen | -- | |
| 多重免疫荧光 | 抗CD20抗体 | Proteintech | -- |
| 抗CD3抗体 | abcam | -- | |
| 抗CD4抗体 | abcam | -- | |
| 抗CXCL13抗体 | Proteintech | -- | |
| Western blot | 抗GAPDH抗体 | Proteintech | -- |
| 抗IFNβ抗体 | Proteintech | -- | |
| 染色 | H&E染色试剂盒 | Sangon Biotech | -- |
| 抗酒石酸酸性磷酸酶染色试剂盒 | Servicebio | -- | |
| 马松染色试剂盒 | Servicebio | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者样本收集与处理 | 组织来源:牙周手术或冠延长手术获取的牙龈组织;纳入/排除标准:无全身性疾病,3个月内未使用抗炎药或抗生素,非吸烟者 阅读提示:Materials and methods - Study approval |
| TLS鉴定与分类 | TLS定义:CD20+ B细胞、CD3+CD4+ T细胞、PNAd+ HEVs;成熟度分类标准;TLS(+)/TLS(−)分组 阅读提示:Materials and methods - Tertiary lymphoid structures detection and classification |
| 细胞培养与刺激 | HGFs来源(冠延长手术);代次(P3-P6);刺激物(P. gingivalis LPS或IFNβ)及时间点(2, 4, 8, 16, 24小时) 阅读提示:Materials and methods - Cell culture |
| siRNA敲低实验 | siRNA设计(靶向IRF7或PRDM1);转染试剂(RFectSP V2);转染后检测时间(48小时) 阅读提示:Materials and methods - Quantitative real-time PCR assay and siRNA Transfection |
| LIP小鼠模型 | 小鼠品系和年龄(C57BL/6,8周龄);结扎(5.0丝线,上颌第二磨牙);P. gingivalis接种剂量(109 CFU)和频率(隔天);实验终点(第8天和16天) 阅读提示:Materials and methods - Animal experiment |
| IFN-I信号阻断 | 抗IFNAR1抗体(Selleck A2121)剂量(1 μg/10 μL PBS);给药方式(局部牙龈注射);给药频率(隔天);对照组(同型对照A2106) 阅读提示:Materials and methods - Animal experiment |
| 骨吸收量化 | micro-CT扫描参数(μCT50,10 μm分辨率,200 μA,70 kV);骨丢失量化方法(CEJ至ABC距离,5个位点) 阅读提示:Materials and methods - Micro-computed tomography Analysis |
| 流式细胞术 | 单细胞悬液制备组织(外周血、牙龈、淋巴结);抗体组合(CD19, CD4, CXCR5, PD-1, CD80, IgD, Ki67, BCL6等);细胞内染色步骤(固定/透化) 阅读提示:Materials and methods - Flow cytometry |