AT/RT进展过程中的分子变化与上皮-间质转化和细胞外基质变化相关

非典型畸胎样/横纹肌样瘤（AT/RT）是婴儿期最常见的恶性脑肿瘤，预后极差。大多数患者会出现肿瘤进展或复发，但其潜在机制尚不清楚。为了解这些机制，我们对八对原发肿瘤和复发肿瘤进行了单核RNA测序（snRNAseq），并分别分析了肿瘤细胞和肿瘤微环境（TME）细胞。通过CIBERSORT比较原发和复发肿瘤细胞群的全局基因表达谱，我们识别出潜在的治疗抵抗性肿瘤细胞。我们还进行了组织病理学、体外实验、批量RNA测序和生存分析以进行验证。配对的原发和复发AT/RT在基因表达谱上显示出显著差异。潜在的治疗抵抗性AT/RT-MYC肿瘤细胞揭示了细胞外基质（ECM）的变化以及发育过程和免疫信号通路的改变。相应的基因特征与AT/RT-MYC患者较差的生存率相关。复发的AT/RT-MYC肿瘤细胞经历了部分上皮-间质转化（pEMT），这一特征通过免疫组织化学（IHC）和体外标准治疗后分析AT/RT细胞得到证实。总之，我们确定了AT/RT中肿瘤复发和治疗抵抗的潜在机制，这些机制可用于未来改进治疗。