化学药物筛选
识别能抑制Wilms肿瘤细胞生长的药物,特别是针对间变性亚型
用60种药物对多个Wilms肿瘤细胞系和原代培养进行筛选,随后用5种BET/BRD抑制剂(含AZD5153)测试3个细胞系,确定AZD5153最有效。
Bromodomain 4 inhibition leads to MYCN downregulation in Wilms tumor
包含体外细胞实验(药物筛选、Western blot、增殖、凋亡检测、微流体)、体内PDX模型,以及患者样本和TARGET数据,具备功能验证和机制验证。
Wilms肿瘤细胞系(COG-W-408、Wit49、17.94等) 患者来源异种移植(PDX)模型(MSKREN-57196、MSKREN-31827) 非间变性细胞系(IM-WT-1、IM-WT-6、IM-WT-10等) 患者原代细胞培养(PCB-00007、CF-00136、CF-00333)
AZD5153的浓度(IC50范围140 nM至2.1 μM,HEK293为4.37 μM) 细胞系来源及间变状态(如Wit49为间变性,COG-W-408为非间变性) 药物暴露时间(24小时、72小时)及蛋白水平变化 体内实验给药方案(5 mg/kg PO BID,21天) TARGET队列中MYCN表达与总生存期关联(P=0.02)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
识别能抑制Wilms肿瘤细胞生长的药物,特别是针对间变性亚型
用60种药物对多个Wilms肿瘤细胞系和原代培养进行筛选,随后用5种BET/BRD抑制剂(含AZD5153)测试3个细胞系,确定AZD5153最有效。
确定AZD5153对细胞死亡和增殖的影响
通过Annexin V/PI染色和BrdU掺入实验,观察AZD5153处理后细胞凋亡和增殖变化。
检测AZD5153处理对MYCN和MYCC蛋白水平的影响
用Western blot检测多个Wilms肿瘤细胞系在AZD5153处理后的MYCN和MYCC蛋白水平。
在体外模拟临床给药时AZD5153对细胞生长的影响
使用微流控系统,模拟人推荐II期剂量(15 mg/kg BID)的血药浓度(Cmax=110 nM, Css=58 nM),观察Wit49细胞生长。
评估AZD5153在Wilms肿瘤PDX模型中的抗肿瘤效果
在两种PDX模型中,口服AZD5153(5 mg/kg BID)或载体对照21天,监测肿瘤体积和疾病控制。
评估AZD5153与放射联合对Wilms肿瘤细胞活力的影响
将放射敏感和不敏感的Wilms肿瘤细胞系分别置于辐射、AZD5153、两者联合条件下,72小时后测定活力。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞活力测定 | CellTiter-Glo®发光细胞活力检测试剂盒 | Promega | G7573 |
| Western blot | C-MYC标签抗体 | Thermo Fisher Scientific | PA1-981 |
| N-MYC多克隆抗体 | Thermo Fisher Scientific | PA5-17403 | |
| 过氧化物酶标记的抗兔二抗 | Vector laboratories | PI-1000 | |
| Clarity Western ECL底物 | Bio-Rad | 1705061 | |
| 细胞凋亡检测 | Annexin V-FITC凋亡染色/检测试剂盒 | Abcam | ab14085 |
| 增殖检测 | BioVision BrdU增殖板读取检测试剂盒 | BioVision | 306-200 |
| 细胞培养 | RPMI-1640细胞培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素-链霉素溶液 | Gibco | -- | |
| 药物处理 | AZD5153 | Selleck Chemicals | -- |
| JQ1 | Selleck Chemicals | -- | |
| I-BET-762 | Selleck Chemicals | -- | |
| BI5352 | Selleck Chemicals | -- | |
| LY20094 | Selleck Chemicals | -- | |
| 细胞培养 | GentleMacs组织解离器 | Miltenyi Biotec GmbH | 130-093-235 |
| 药物筛选 | Nunc™ 384孔聚苯乙烯白色微孔板 | Thermo Fisher Scientific | 164610 |
| Multi-Flo液体分配器 | BioTek | -- | |
| Synergy HT酶标仪 | BioTek | -- | |
| Tecan D300e数字分配器 | Hewlett Packard | -- | |
| Western blot | SDS-PAGE凝胶 | Bio-Rad | 4561024 |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| IVIS Lumina成像系统 | PerkinElmer | -- | |
| 流式分析 | BD FACSAria II流式细胞仪 | Becton Dickinson Biosciences | -- |
| 微流控实验 | CellASIC® ONIX2微流控系统 | EMDMillipore | -- |
| CellASIC ONIX M04切换板 | -- | -- | |
| XLMulti S1培养箱 | Pecon | -- | |
| LSM800共聚焦倒置激光扫描显微镜 | Zeiss | -- | |
| 放射实验 | MX-20 X射线柜 | Faxitron | -- |
| 细胞培养 | Nunc™ 96孔白壁组织培养板 | Thermo Fisher Scientific | 136101 |
| 体内实验 | NOD SCID gamma小鼠 | Jackson Labs | 005557 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 药物筛选 | 细胞系和原代培养的类型、药物浓度范围、处理时间、检测方法 阅读提示:Methods 中的 Chemical screens |
| Western blot | 抗体稀释比例、蛋白上样量、曝光时间、处理时间和浓度 阅读提示:Methods 中的 Western blot analysis 及图3图注 |
| 细胞增殖检测 | AZD5153浓度、处理时间、BrdU掺入方法 阅读提示:Methods 中的 BrdU incorporation experiments 及图S2图注 |
| 微流控实验 | 药物浓度(Cmax 110 nM、Css 58 nM)、暴露时间、细胞密度 阅读提示:Methods 中的 Microfluidics experiments 及图4图注 |
| 体内实验 | PDX模型、给药剂量(5 mg/kg PO BID)、治疗时间、肿瘤体积测量方法 阅读提示:Methods 中的 In vivo studies 及图5图注 |