ST-FFPE-mIF：利用Stereo-seq在福尔马林固定石蜡包埋组织中整合空间转录组学和多重免疫荧光技术

虽然Stereo-seq-FFPE能够捕获福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）样本中的空间基因表达，但它仅限于转录组数据。在此，我们介绍了ST-FFPE-mIF，这是一种在同一FFPE组织切片中整合八重免疫荧光染色与空间转录组学的方案。我们的方法通过基于细胞核或细胞膜的细胞分割实现单细胞分辨率，从而将Stereo-seq-FFPE扩展至表型分析。我们展示了ST-FFPE-mIF如何在癌症样本中支持稳健的空间多组学分析，提供了从转录组到表型组的分子层次结构的全面视图。