系统探究调控胆固醇和脂质稳态的功能基因

Systematic interrogation of functional genes underlying cholesterol and lipid homeostasis

作者信息Haihuan Shan, Shuangshuang Fan, Quanrun Li, Ruipu Liang, Zhisong Chen, Shengnan Wang, Xiaofeng Wang, Yurong Li, Shuai Chen, Kun Yu, Teng Fei
PMID40098013
发布时间2025-03-17
DOI10.1186/s13059-025-03531-8

摘要

背景:血脂异常或高胆固醇血症是心血管疾病的主要风险因素之一。揭示脂质或胆固醇稳态的分子基础有助于识别新的药物靶点并开发有效的治疗方法。结果:本研究采用系统性方法,通过组合使用高通量CRISPR筛选、RNA测序、人类遗传变异关联分析以及蛋白质组学和代谢组学分析,对调控脂质和胆固醇稳态的基因进行了编目。这种综合的多组学方法鉴定出γ-谷氨酰转移酶GGT7是一个潜在且有趣的胆固醇和脂质调节因子。作为SREBP2依赖性靶点,GGT7正向调节细胞胆固醇水平并影响多个胆固醇代谢基因的表达。此外,GGT7与肌动蛋白依赖性运动蛋白MYH10相互作用,控制低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)向细胞内的摄取。在小鼠中敲除Ggt7基因会导致血清胆固醇水平降低,支持了Ggt7在体内胆固醇稳态中的作用。结论:我们的研究不仅从多个角度提供了脂质或胆固醇调控基因的目录,还揭示了γ-谷氨酰转移酶与胆固醇代谢之间的因果关系。

实验方法

产品清单

名称品牌货号
慢病毒CRISPRv2-Puro载体Addgene52961
Lipofectamine 2000转染试剂Thermo Fisher Scientific11668030
内毒素去除质粒大量提取试剂盒TianGenDP117
Q5高保真DNA聚合酶New England BiolabsM0491S
Vanquish超高效液相色谱系统Thermo Fisher Scientific--
Q-Exactive HF-X质谱仪Thermo Fisher Scientific--
液相色谱-串联质谱系统----
UNIQ-10 Trizol总RNA提取试剂盒SangonB511321
HighCapacity cDNA逆转录试剂盒Applied Biosystems4368814
QuantStudio™ 5系统Applied Biosystems--
RIPA裂解缓冲液BeyotimeP0013
BCA蛋白测定试剂盒MeilunbioMA0082
硝酸纤维素滤膜PallC05-05002
抗DYKDDDDK磁珠Thermo Fisher ScientificA36797
3×FLAG肽SangonT510060-0005
Protein G琼脂糖Thermo Fisher Scientific10004D
徕卡DM4000 B LED显微镜LEICA--
酶标仪Gene Company LimitedSynergy H1