遗传变异与microRNA靶向的A-to-I RNA编辑共同精细调控人类组织转录组

背景：A-to-I RNA编辑能够多样化转录组并产生多种下游功能效应。遗传变异导致了个体间RNA编辑的差异，并可能影响表型变异。结果：我们分析了437名个体49种组织的匹配遗传与转录组数据，以识别与遗传变异相关的RNA编辑事件。采用RNA编辑数量性状位点（edQTL）作图方法，我们发现了3117个独特的RNA编辑事件与顺式遗传多态性相关。其中14%的edQTL事件也与基因表达的遗传变异相关。部分事件与复杂性状或疾病的基因组范围关联研究（GWAS）信号相关。我们确定ADAR和ADARB1的组织特异性水平能够解释一部分组织特异性edQTL事件。我们发现某些microRNA能够区分其靶标的编辑与未编辑亚型。此外，microRNA可以通过以编辑特异性的方式进行microRNA介导的转录本降解，从而从edQTL位点产生表达数量性状位点（eQTL）信号。通过对edQTL、eQTL和microRNA表达谱进行整合分析，我们通过计算发现并通过实验验证了microRNA可能以组织特异性方式从edQTL位点产生eQTL信号的edQTL-microRNA对。结论：我们的工作提出了一种机制，即RNA编辑变异性可以通过改变关键RNA分子的稳定性和稳态水平来影响复杂性状和疾病的表型。