全外显子组测序和遗传分析
在MMAF患者队列中鉴定潜在的致病基因变异。
对90名MMAF中国男性进行全外显子组测序,并通过Sanger测序验证CFAP58变异,分析其致病性和遗传模式。
Bi-allelic Loss-of-function Variants in CFAP58 Cause Flagellar Axoneme and Mitochondrial Sheath Defects and Asthenoteratozoospermia in Humans and Mice
涵盖全外显子组测序、精子形态与超微结构分析、免疫荧光/免疫印迹验证,并通过CRISPR/Cas9小鼠模型进行体内功能验证。
90名MMAF中国男性队列 人类精子样本 Cfap58基因敲除小鼠
CFAP58双等位基因功能缺失变异,包括纯合或复合杂合突变 精子形态分析(H&E染色,至少200个精子/样本) 透射电子显微镜(TEM)观察鞭毛轴丝和线粒体鞘超微结构 免疫荧光和免疫印迹检测CFAP58、SPAG6、SPEF2、HSP60蛋白表达 Cfap58基因敲除小鼠的生育力测试和精子表型分析
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
在MMAF患者队列中鉴定潜在的致病基因变异。
对90名MMAF中国男性进行全外显子组测序,并通过Sanger测序验证CFAP58变异,分析其致病性和遗传模式。
评估CFAP58变异对精子形态和运动能力的影响。
收集患者精液,进行H&E染色和扫描电镜观察精子形态,分析精子浓度和运动力。
观察CFAP58变异导致的鞭毛轴丝和线粒体鞘的超微结构缺陷。
透射电子显微镜观察精子鞭毛横截面和纵截面,分析轴丝微管、线粒体鞘和外周致密纤维的形态。
检测CFAP58及其相关蛋白在精子中的表达和定位情况。
使用免疫荧光和免疫印迹检测CFAP58、SPAG6、SPEF2、HSP60等在患者精子中的表达和定位。
在体内验证CFAP58功能缺失对精子发生和生育力的影响。
利用CRISPR/Cas9技术生成Cfap58基因敲除小鼠,进行精子形态、运动能力、生育力测试和睾丸组织学分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 全外显子组测序 | SureSelect XT人全外显子捕获试剂盒 | Agilent | -- |
| 免疫印迹 | 抗CFAP58抗体 | Invitrogen | PA5-57714 |
| 抗HSP60抗体 | Abcam | ab13532 | |
| 抗SPEF2抗体 | Sigma | HPA040343 | |
| 免疫荧光 | 抗CFAP58抗体 | Invitrogen | PA5-65174 |
| 抗SPAG6抗体 | Sigma | HPA038440 | |
| 抗乙酰化α-微管蛋白抗体 | Sigma | T6793 | |
| 抗乙酰化α-微管蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 5335 | |
| 免疫印迹 | 增强化学发光底物 | Biosharp | BL520A |
| 透射电子显微镜 | SPI-Chem树脂 | -- | -- |
| Epon 812环氧树脂 | -- | -- | |
| 扫描电子显微镜 | Nova Nano 450场发射扫描电子显微镜 | Thermo Fisher | -- |
| 透射电子显微镜 | TecnaiG2 Spirit 120千伏冷冻电子显微镜 | -- | -- |
| 免疫荧光 | LSM 800共聚焦显微镜 | Carl Zeiss AG | -- |
| 基因表达分析 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| PrimeScript逆转录试剂盒 | Takara | -- | |
| 免疫印迹 | RIPA裂解缓冲液 | Beyotime | -- |
| 实时定量PCR | LightCycler 480 SYBR Green I Master混合物 | Roche | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 遗传分析 | 外显子组捕获试剂盒、测序平台、序列比对软件版本 阅读提示:Materials and Methods - WES, Bioinformatic Analysis, and Sanger Sequencing |
| 精子形态分析 | 精液采集前禁欲时间、精液液化时间和温度、形态学分析样本量 阅读提示:Materials and Methods - Semen Parameters and Sperm Morphological Analysis |
| 超微结构分析 | 扫描和透射电子显微镜的制样方法、观察切片数量 阅读提示:Materials and Methods - Scanning and Transmission Electron Microscopy |
| 蛋白表达检测 | 抗体类型、稀释比例、孵育条件、样本用量 阅读提示:Materials and Methods - Immunoblotting and Immunofluorescence Assays |
| 动物模型验证 | sgRNA靶向序列、小鼠品系和年龄、交配实验设计 阅读提示:Materials and Methods - Generation of the Cfap58-KO Mouse Model and Mating Test |