发现DNAH10双等位基因变异
鉴定MMAF患者中潜在的致病基因变异
对643名中国MMAF患者进行全外显子组测序,通过生信分析(ANNOVAR等)和Sanger测序验证,在5名患者中发现DNAH10双等位基因变异(纯合或复合杂合)。
Bi-allelic mutations of DNAH10 cause primary male infertility with asthenoteratozoospermia in humans and mice
包含全外显子组测序、精子形态与超微结构分析、免疫荧光验证、Dnah10敲除和敲入小鼠模型等多层级证据,并进行了功能与机制验证。
人类精子样本(来自携带DNAH10双等位基因变异的MMAF患者) Dnah10基因敲除小鼠模型 Dnah10M/M基因敲入小鼠模型(对应人c.12838G>A变异) C57BL/6小鼠(用于RT-PCR及组织表达分析)
DNAH10双等位基因变异类型及遗传模式(纯合或复合杂合) 精子形态学分析:H&E染色和扫描电镜 精子超微结构:透射电镜(TEM)观察IDAs缺失等轴丝缺陷 免疫荧光染色:DNAH10及其他IDAs组分(DNAH2、DNAH6)的表达和定位 Dnah10敲除和敲入小鼠模型的表型验证(精子运动力和形态)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定MMAF患者中潜在的致病基因变异
对643名中国MMAF患者进行全外显子组测序,通过生信分析(ANNOVAR等)和Sanger测序验证,在5名患者中发现DNAH10双等位基因变异(纯合或复合杂合)。
评估DNAH10变异对精子形态、运动力和超微结构的影响
对患者精子进行精液参数分析(WHO 2010)、H&E染色、扫描电镜和透射电镜观察,并对DNAH10及其他相关蛋白进行免疫荧光定位。
验证DNAH10缺失是否导致雄性不育和MMAF表型
使用CRISPR-Cas9技术敲除小鼠Dnah10外显子2-5,通过Sanger测序和RT-PCR验证基因敲除。评估雄性生育力、精子浓度、运动力、形态(H&E)和超微结构(TEM),以及睾丸组织学。
验证患者特异性DNAH10点突变(c.12838G>A)的致病性
使用CRISPR-Cas9技术将患者对应变异(c.13198G>A)引入小鼠,通过Sanger测序验证。评估雄性生育力、精子浓度、运动力、形态和超微结构,以及睾丸组织学。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| DNA提取 | DNA提取试剂盒 | QIAGEN | -- |
| 全外显子组测序 | 安捷伦SureSelect人全外显子V6试剂盒 | Agilent | -- |
| Illumina HiSeq 2000测序仪 | Illumina | -- | |
| 精子运动力分析 | 人输卵管液 | Millipore | MR-070-D |
| 扫描电子显微镜 | CO2临界点干燥仪 | Hitachi | -- |
| 离子溅射仪 | Hitachi | -- | |
| 扫描电子显微镜 | Hitachi | -- | |
| 透射电子显微镜 | 环氧树脂812 | -- | -- |
| 透射电子显微镜 | Philips | TECNAI-10 | |
| 透射电子显微镜 | Hitachi | HT7700 | |
| 基因敲除 | T7 RNA聚合酶 | -- | -- |
| RT-PCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | 15596026 |
| goScript逆转录系统 | Promega | A5000 | |
| 免疫荧光 | 抗DNAH10抗体 | Bioss | bs-11022R |
| 抗DNAI1抗体 | Bioworld | BS90420 | |
| 抗DNAH2抗体 | Sigma-Aldrich | HPA067103 | |
| 抗DNAH8抗体 | Bioss | bs-14367R | |
| 抗DNAH17抗体 | Sigma-Aldrich | HPA024354 | |
| 抗DNAH6抗体 | Abcam | ab122333 | |
| 抗SPAG6抗体 | Sigma-Aldrich | HPA038440 | |
| 抗AKAP4抗体 | Sigma-Aldrich | HPA020046 | |
| 抗α-微管蛋白抗体 | Sigma-Aldrich | T5168 | |
| Alexa Fluor 488标记抗小鼠IgG二抗 | Life Technologies | A21121 | |
| Alexa Fluor 555标记抗兔IgG二抗 | Life Technologies | A31572 | |
| DAPI荧光染料 | -- | -- | |
| 荧光显微镜 | Olympus | IX51 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 遗传变异鉴定 | DNAH10变异类型(纯合或复合杂合)、具体cDNA和蛋白改变、人群频率、功能预测及Sanger测序验证结果 阅读提示:参见Results中“Identification of bi-allelic DNAH10 variants”部分及Table 1,以及Methods中“Whole-exome sequencing and bioinformatics analysis” |
| 患者精子表型 | 精子浓度、活力(前向运动力)、形态异常比例、超微结构缺陷(IDA缺失等) 阅读提示:参见Results中“Asthenoteratozoospermia phenotypes in men harboring bi-allelic DNAH10 variants”及“DNAH10 variants cause MMAF with combined loss of IDAs”,以及Table S4和Table S5 |
| 免疫荧光分析 | 抗体货号及稀释比、染色条件(固定、通透、封闭时间等),以及DNAH10和IDA组分(DNAH2、DNAH6)在患者精子中的表达定位情况 阅读提示:参见Methods中“Immunofluorescence analysis”及Figure legends (Figures 3, 5) |
| 小鼠模型构建 | sgRNA序列、靶向外显子、微注射小鼠品系(C57BL/6)、基因型鉴定方法(PCR和Sanger测序) 阅读提示:参见Methods中“Mouse models”及补充图S8和S10 |
| 小鼠表型验证 | 小鼠繁殖力测试(合笼、产仔数)、精子浓度和运动力(CASA)、精子形态(H&E)和超微结构(TEM) 阅读提示:参见Results中“Dnah10-knockout male mice resemble asthenoteratozoospermia phenotypes”和“Asthenoteratozoospermia phenotypes in Dnah10M/M-knockin male mice”,以及Figure legends (Figures 6, 7) |