患者入组与样本收集
收集结肠癌患者的治疗前活检组织及手术切除组织,用于评估基线和治疗后的肿瘤微环境。
纳入42例Ⅰ-Ⅲ期结肠癌患者,随机分配至维生素D组或安慰剂组,收集治疗前活检和手术切除组织,以及治疗前后血浆样本。
Impact of vitamin D on the colon cancer immune microenvironment: results of a randomized clinical trial of preoperative vitamin D supplementation in patients with stage I-III colon cancer
该研究是随机、安慰剂对照临床试验,结合空间多重免疫荧光分析、空间转录组分析、血浆检测和临床病理数据,包含多个独立证据层级,并进行了功能验证。
Ⅰ-Ⅲ期结肠癌患者 肿瘤组织样本
患者分期为Ⅰ-Ⅲ期可切除结肠腺癌 维生素D3剂量为每日50000 IU共7天,后每日10000 IU 治疗持续时间:维生素D组中位8天,安慰剂组中位13天 关键配对样本分析:24例患者(11例维生素D,13例安慰剂)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
收集结肠癌患者的治疗前活检组织及手术切除组织,用于评估基线和治疗后的肿瘤微环境。
纳入42例Ⅰ-Ⅲ期结肠癌患者,随机分配至维生素D组或安慰剂组,收集治疗前活检和手术切除组织,以及治疗前后血浆样本。
确认维生素D补充后血浆25(OH)D水平显著升高,验证治疗依从性。
采用放射免疫法检测治疗前后血浆25(OH)D水平。
评估VDR和CYP27B1表达以及免疫细胞密度和空间分布。
构建两个mIF panel,使用Leica BOND RX自动染色,PhenoImager HT扫描,通过监督机器学习进行细胞分类。
评估治疗后肿瘤区域的转录组变化,特别是VDR转录活性。
使用GeoMx平台对手术后切除标本进行全转录组空间分析,通过CK引导的环状分割区分肿瘤上皮和基质区域。
评估维生素D对T细胞与肿瘤细胞空间关系的影响。
使用NND、Gcross、kNN和细胞邻域分析等方法,比较治疗前后及不同治疗组的免疫细胞空间分布。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 维生素D补充 | 维生素D3(胆钙化醇) | -- | -- |
| 血浆25(OH)D测量 | 放射免疫分析法 | DiaSorin, Inc. | -- |
| 免疫组化/多重免疫荧光 | 徕卡BOND RX研究染色机 | Leica Biosystems | -- |
| 多重免疫荧光成像 | PhenoImager HT | Akoya | -- |
| 图像分析 | inForm组织分析软件 | Akoya | -- |
| 空间转录组 | GeoMx数字空间分析仪 | Bruker Technologies | -- |
| 空间转录组测序 | Illumina NovaSeq X Plus 测序仪 | Illumina | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者入组 | Ⅰ-Ⅲ期可切除结肠癌患者;排除正在使用高剂量维生素D补充、慢性口服皮质类固醇等特定药物;排除高钙血症等问题;ECOG PS ≤ 1;无既往放疗或系统治疗 阅读提示:Methods (Trial design and participants) |
| 治疗与随机化 | 随机分配至维生素D3或安慰剂;维生素D组:每日5粒10000 IU胶囊(共50000 IU),共7天,之后每日1粒10000 IU胶囊;安慰剂组:相应安慰剂胶囊;手术在开始治疗后7至28天内进行 阅读提示:Methods (Randomization and Procedures) |
| 组织处理与mIF分析 | 肿瘤活检及切除标本固定包埋,切片厚度4μm;使用VDR mIF panel(CD45, CD3, CD4, CD8, CD68, CD163, FoxP3, CD45RO, DAPI, CK);免疫荧光染色步骤包括抗原修复和TSA;扫描倍数200x;每个切片随机选ROIs,切除标本选肿瘤中心和边缘各3个ROIs,并使用inForm软件进行监督机器学习分类 阅读提示:Methods (Multiplex immunofluorescence protocols, Digital image analysis) |
| 空间转录组分析 | 使用GeoMx WTA和自动化流程;ROIs基于CK引导的环状分割,分为肿瘤上皮中心、环1(1-25μm)、环2(26-50μm);并检查RNA质量(如测序饱和度等);进行质量控制标准(比对率>80%,饱和率>50%) 阅读提示:Methods (Spatial transcriptional profiling specimen processing) |
| 数据分析 | 使用线性混合效应模型评估治疗效应和交互作用,校正患者ID等随机效应;调整MSI状态、分化等级、BMI、T分期、原发部位等协变量 阅读提示:Methods (Statistical analysis) |