特定细菌联合体揭示肠道细菌对DNA甲基化和肿瘤发生的影响

Defined bacterial consortium highlights the impact of intestinal bacteria on DNA methylation and tumorigenesis

作者信息Claudia Mercado-Rodriguez, Siddhi Chitre, Pyoung Hwa Park, Ye Yang, Anthony Pompetti, Raad Z Gharaibeh, Jason O Brant, Jean-Pierre J Issa, Christian Jobin
PMID42415118
发布时间2026-07-07
DOI10.1186/s13059-026-04183-y

摘要

背景:结直肠癌(CRC)是美国癌症相关死亡的第二大原因。虽然肠道微生物群已被证明会影响CRC的发展,但细菌对DNA甲基化和致癌作用的具体贡献仍未得到充分探索。结果:我们用两种联合体分别定植两组无菌ApcMin/+小鼠,一种含有“低pks”活性的pks+大肠杆菌菌株(DSMZ),另一种含有表现出“高pks”活性的临床分离株(UM149)。这些定植小鼠暴露于DSS诱导的结肠炎,并分析其肿瘤负荷、DNA甲基化和转录变化。我们发现,与C13-DSMZ相比,C13-UM149定植导致更多肿瘤、细胞增殖增加和更高的DNA损伤(p < 0.05)。甲基化分析显示,C13-DSMZ引起广泛的启动子高甲基化和基因表达改变。在C13-DSMZ或C13-UM149定植的小鼠中,差异DNA甲基化与调控肿瘤抑制、细胞增殖、炎症和Wnt信号传导的途径变化相关。在C13-DSMZ小鼠中,高甲基化与肿瘤和正常组织中肿瘤抑制相关基因的表达有关,而低甲基化则与促进Wnt信号传导的基因表达相关。在C13-UM149小鼠中,甲基化变化与涉及上皮增殖、细胞外基质重塑和炎症反应的基因相关。结论:这些发现表明,具有不同pks活性的肠道细菌差异性地调节DNA甲基化,从而影响基因表达和肿瘤发展。这突出了细菌对表观遗传反应的调控作为CRC进展的潜在机制。

实验方法

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