定向进化紧凑型RNA引导核酸酶以增强其在哺乳动物细胞中的活性

Directed evolution of compact RNA-guided nucleases for enhanced activity in mammalian cells

作者信息Fedor Gorbenko, Irene Sala, Young-Yoon Lee, Lilly van de Venn, Charles D Yeh, András Tálas, Tautvydas Karvelis, Gytis Druteika, Luca V Bechter, Iryna Vykhlyantseva, Markus S Schröder, Ana Gvozdenovic, Gerald Schwank, Virginijus Siksnys, Jacob E Corn
PMID42304391
发布时间2026-06-16
DOI10.1186/s13059-026-04144-5

摘要

背景:RNA引导的核酸酶能够实现DNA编辑,并为治疗遗传疾病提供了希望,特别是在用于精确序列替换时。然而,许多最有效的酶(如化脓性链球菌Cas9)体积过大,无法使用腺相关病毒等载体递送。这促使人们对来自Cas12f和TnpB家族的更小替代品产生兴趣。然而,这些核酸酶在哺乳动物细胞中通常表现出较低的活性,限制了其应用。结果:我们利用在人细胞中的定向进化来筛选活性大大提高的变体。得到的变体Cas12f1Super和TnpBSuper显示出高达11倍的编辑效率提升,且未增加脱靶效应。当作为碱基编辑器进行测试时,Cas12f1Super相对于先前设计的CasMINI显示出高达十倍的改进,表明其在核酸酶相关活性之外的潜在应用价值。结论:这些紧凑而高效的基因组编辑器扩展了现有的工具包,并有望在哺乳动物系统中用于研究和治疗。

实验方法

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