关于丁香通
公司信息
个人用户
企业机构
无忧采购 轻松科研
- 移动端
成像质谱流式技术揭示人胰腺中1型糖尿病进展期间的功能与免疫学变化
Imaging mass cytometry reveals functional and immunological changes during type 1 diabetes progression in human pancreata
摘要
1型糖尿病的发病机制，尤其是在自身抗体阳性的临床前阶段，仍知之甚少，部分原因是样本获取有限。本研究展示了来自88例器官捐献者（包括28例单自身抗体阳性和10例多自身抗体阳性捐献者）胰腺样本的成像质谱流式数据。我们使用79种抗体对1600万个单细胞进行成像，以表征β细胞状态和胰岛-免疫界面，并校正了相关协变量。我们发现了促炎性巨噬细胞与耗竭样（PD1+TIM3+）T细胞之间的相互作用。这些相互作用是早期疾病和胰岛炎的特征，表明巨噬细胞在疾病发展中起关键作用。β细胞在临床前疾病中表现出IAPP的缺失、胰岛炎的干扰素特征，并且与对照组相比，疾病样本中三种测量的内质网应激标志物没有增加。多种免疫细胞亚型与年轻年龄和胰岛炎相关，可能导致了年轻患者更严重的疾病。我们的数据提供了一个描述早期1型糖尿病进展的资源，并在广泛的β细胞丢失之前揭示了潜在的临床可操作特征。
实验方法
产品清单
| 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|
| MaxPar X8多金属标记试剂盒 | Fluidigm | -- |
| steinbock软件 | -- | 0.10.2 |
| 载玻片扫描仪 | Zeiss Axio Scan.Z1 | -- |
| FiJi软件 | -- | 1.5.3p |
| ilastik软件 | -- | 1.3.3post3 |
| CellProfiler软件 | -- | 4.2.1 |
| Helios飞行时间质谱流式仪（CyTOF）与Hyperion成像系统联用 | Fluidigm | -- |
| Helios飞行时间质谱流式仪 | -- | -- |
| Hyperion成像系统 | Fluidigm | -- |
| 调谐玻片 | Fluidigm | -- |
| Mesmer模型 | -- | -- |
| Catalyst软件包 | -- | 1.26.1 |
| Rphenoannoy软件包 | -- | 0.1.0 |
| igraph软件包 | -- | 2.0.3 |
| cytomapper软件 | -- | 1.2.0 |
| cytoviewer软件 | -- | 1.14.0 |
| napari软件 | -- | 0.4.17 |
| ranger软件包 | -- | 0.16.0 |
| edgeR软件包 | -- | 4.0.16 |
| lmerTest软件包 | -- | 3.1.3 |
| slingshot软件包 | -- | 2.10.0 |
| destiny软件包 | -- | 3.16.0 |
| tradeSeq软件包 | -- | 1.16.0 |
| lmtest软件包 | -- | 0.9.40 |
| imcRtools软件包 | -- | 1.8.0 |