评估GPX4在CRC发生发展中的作用
验证经典铁死亡调控因子GPX4是否为CRC生长和进展所必需。
构建肠道特异性Gpx4敲除小鼠,在CAC模型和多种遗传工程小鼠模型中观察肿瘤发生和生存期。
Iron-addicted colorectal cancers exploit heme-complex II axis to resist oxidative cell death
包含多组学分析、CRISPR筛选、体外细胞实验、类器官、基因敲除小鼠模型、患者样本及异种移植瘤等多层级证据,并进行了功能验证和机制验证。
CRC细胞系(HCT116、SW480、HT29等) 正常肠上皮细胞及类器官 基因工程小鼠模型(GPX4敲除、SDHC敲除) 异种移植瘤模型(CT26)
GPX4和SLC7A11在CRC中的表达及功能缺失对肿瘤进程的影响 FTH1(铁蛋白重链)在维持铁稳态中的作用 UROD(尿卟啉原脱羧酶)敲低或琥珀酰丙酮(SA)处理对铁敏感性的影响 SDHC(琥珀酸脱氢酶C亚基)敲低或抑制对铁敏感性的影响 CoQ10水平变化与铁处理及CII抑制的关系
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证经典铁死亡调控因子GPX4是否为CRC生长和进展所必需。
构建肠道特异性Gpx4敲除小鼠,在CAC模型和多种遗传工程小鼠模型中观察肿瘤发生和生存期。
确定CRC细胞对高铁的耐受是否具有细胞自主性。
使用CRC细胞系、正常肠上皮细胞和非CRC癌细胞系,在含FAC的培养基中培养,检测增殖和细胞死亡。
发现CRC细胞在高铁条件下存活所需的重要代谢途径。
使用代谢CRISPR文库在FAC或FG4592处理下进行筛选,识别被显著耗竭的基因。
探究血红素是否作为保护性辅因子,缓解铁诱导的毒性。
通过基因敲低UROD或FECH,或使用琥珀酰丙酮(SA)抑制血红素合成,检测细胞对铁毒性的敏感性,并补充血红素进行救援。
确定CII是否通过调节CoQ还原来保护细胞免受铁诱导的氧化损伤。
使用CII抑制剂TTFA或敲低SDHA/SDHB/SDHC,检测铁处理下的细胞死亡、ROS水平及CoQ水平。
在体内模型中验证SDHC在CRC生长中的必要性。
使用CT26细胞异种移植模型和Sdhc敲除小鼠模型,评估SDHC缺失对肿瘤生长、ROS水平和铁敏感性的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基 | Gibco, Invitrogen | ILT11995073 |
| 胎牛血清 | Fisher Scientific | SH3039603HI | |
| 药物处理 | 柠檬酸铁铵 | Sigma | F5879 |
| 氯高铁血红素 | Millipore | 3741-5g | |
| 利普司他汀-1 | Cayman Chemical Technology | 17730 | |
| N-乙酰半胱氨酸 | Cayman Chemical Technology | 20261 | |
| 线粒体靶向泛醌 | Cayman Chemical Technology | 89950 | |
| 细胞染色 | SYTOX绿色核酸染料 | Thermo Fisher Scientific | S7020 |
| C11-BODIPY 581/591荧光探针 | Thermo Fisher | D3861 | |
| 羧基-H2DCFDA活性氧荧光探针 | Thermo Fisher | C10444 | |
| 赫斯特33342染色液 | Invitrogen | H3570 | |
| Western blot | GPX4抗体 | Proteintech | 67763-1-Ig |
| FTH1抗体 | Cell Signaling Technology | 3998S | |
| UROD抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-365297 | |
| SDHC抗体 | Proteintech | 14575-1-AP | |
| β-肌动蛋白抗体 | Proteintech | 66009-1-Ig | |
| 抗小鼠HRP二抗 | Cell Signaling Technology | 7076S | |
| 抗兔HRP二抗 | Cell Signaling Technology | 7074S | |
| 组织学 | 4-HNE抗体 | R&D Systems | MAB3249-SP |
| DAB过氧化物酶底物试剂盒 | Vector Laboratories | SK-4100 | |
| 动物实验 | 他莫昔芬 | MedChem Express | HY-13757A |
| 氧化偶氮甲烷 | Sigma Aldrich | A5486-25MG | |
| 葡聚糖硫酸钠 | Fisher Scientific | AAJ6360622 | |
| 铁含量测定 | BioTracker FerroOrange活细胞铁探针 | Sigma | SCT210-175nmol |
| 代谢组学 | 13C5 L-谷氨酰胺 | Cambridge Isotope Laboratories | CLM-1822-H-0.1MG |
| 耗氧率测定 | Resipher氧气传感器 | Lucid Lab | -- |
| 质谱分析 | 安捷伦1290 Infinity II Bio液相色谱 | Agilent | -- |
| 安捷伦6470三重四极杆质谱 | Agilent | -- | |
| 赛默飞IQX OrbiTrap液相色谱质谱联用 | Thermo Scientific | -- | |
| 串联质谱标签标记试剂盒 | Thermo Fisher | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源(ATCC)、培养基(DMEM)、血清浓度(10% FBS)、抗生素浓度(1%)、培养条件(37°C, 5% CO2) 阅读提示:STAR Methods, Cell lines部分 |
| 铁处理 | FAC浓度(0.1-5 mM)、处理时间(24-72小时)、对照处理 阅读提示:Figure legends 2, 3, 4, 5, 6 |
| 血红素合成抑制 | 琥珀酰丙酮(SA)浓度(500 μM)、处理时间(72小时)、血红素补充浓度(10 μM) 阅读提示:Figure 3 legends |
| CII抑制 | TTFA浓度(100 μM)、处理时间(24小时)、CoQ类似物(IDB, MitoQ)浓度 阅读提示:Figure 5 legends |
| 基因敲低 | shRNA序列、多西环素浓度(250 ng/mL)、诱导时间(24-72小时) 阅读提示:STAR Methods, Generation of shRNA/sgRNA stable cell lines |
| 动物模型 | 小鼠品系、他莫昔芬剂量(100 mg/kg体重)、高铁饮食(350或1000 ppm)、肿瘤植入细胞数(2×10^6) 阅读提示:STAR Methods, Mice, Tamoxifen induction, High Iron Diet, Syngeneic and Xenograft studies |