胚孔唇移植实验
测试M. leidyi胚胎胚孔唇是否具有诱导次级结构的能力。
将供体胚孔唇或侧外胚层组织移植到同期宿主胚胎的侧方,观察是否形成次级咽和口。
A blastoporal organizer in a ctenophore
包含体内移植实验、跨门移植、药理学抑制、mRNA过表达、原位杂交及统计建模等多个独立证据层级,并进行了功能验证和机制验证。
Mnemiopsis leidyi胚胎 Nematostella vectensis胚胎
移植组织的来源(胚孔唇或侧外胚层)及移植位置(宿主侧方或囊胚腔) 抑制剂浓度和处理时间(iCRT14 10 μM;SB431542 30-40 μM;A83-01 2-15 μM) mRNA注射剂量和注射时间(0.35 µg/µl,受精卵或8细胞期) 分析时间点(M. leidyi 2天,N. vectensis 58小时) 统计模型(二项广义线性混合模型)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
测试M. leidyi胚胎胚孔唇是否具有诱导次级结构的能力。
将供体胚孔唇或侧外胚层组织移植到同期宿主胚胎的侧方,观察是否形成次级咽和口。
测试M. leidyi胚孔唇是否能诱导其他动物门类的轴形成。
将M. leidyi胚孔唇移植到N. vectensis原肠胚的囊胚腔,通过原位杂交检测NvFoxA的表达。
检验β-catenin和TGFβ信号在组织者发育和诱导中的作用。
用iCRT14、CHIR99021、SB431542和A83-01处理胚胎,观察表型及Brachyury等基因表达变化。
验证TGFβ配体是否足以诱导异位口部结构。
将编码M. leidyi TGFβ配体的mRNA注射到M. leidyi受精卵或N. vectensis 8细胞期胚胎中,观察表型及NvFoxA表达。
检验M. leidyi Wnt配体是否能诱导异位轴。
在N. vectensis胚胎中过表达M. leidyi WntA、Wnt6、Wnt9和WntX,观察是否诱导异位轴。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 胚胎培养 | 红海盐 | Red Sea Fish Pharm | -- |
| RGcomplete | Reef Nutrition | -- | |
| 胚胎移植 | 羽毛无菌微型手术刀15度 | Feather Safety Razor | 72045-15 |
| 胚胎标记 | FM4-64FX | Invitrogen | F34653 |
| FM1-43FX | Invitrogen | F35355 | |
| 药理学处理 | A83-01 | MedChemExpress | HY-10432A |
| SB431542 | Sigma-Aldrich | S4317 | |
| iCRT14 | Sigma-Aldrich | SML0203 | |
| CHIR99021 | Sigma-Aldrich | SML1046 | |
| 原位杂交 | MEGAscript SP6转录试剂盒 | Invitrogen | AM1330 |
| 蛋白酶K | Thermo Fisher Scientific | AM2546 | |
| 封闭试剂 | Roche Diagnostics | 11096176001 | |
| NBT | Roche Diagnostics | 11383213001 | |
| BCIP | Roche Diagnostics | 11383221001 | |
| mRNA显微注射 | pCRII载体 | -- | -- |
| SP6 mMESSAGE mMACHINE试剂盒 | Invitrogen | AM1340 | |
| 荧光葡聚糖-Alexa594 | Invitrogen | D22913 | |
| 气动PicoPump显微注射器 | World Precision Instruments | SYS-PV830 | |
| Laboport N86 KT.18泵 | -- | -- | |
| 显微针TW100F-4 | World Precision Instruments | -- | |
| P-2000拉针仪 | Sutter Instrument | -- | |
| 4孔板 | Nunc, Thermo Fisher Scientific | 176740 | |
| Axiovert 100倒置显微镜 | Carl Zeiss | -- | |
| Wnt表达实验 | pCRII-EF1α载体 | -- | -- |
| I-SceI大范围核酸酶 | New England Biolabs | R0694S | |
| 肌动蛋白染色 | 鬼笔环肽-AlexaFluor488 | Invitrogen | A12379 |
| Vectashield封片剂 | Vector Laboratories | H-1000 | |
| 显微镜成像 | 卡尔蔡司AxioImager.M2荧光显微镜 | Carl Zeiss Microscopy | -- |
| pco.panda 4.2相机 | Excelitas PCO | -- | |
| 尼康Eclipse 80i显微镜 | Nikon | -- | |
| 尼康DS-Fi1相机 | Nikon | -- | |
| Axioscope 5显微镜 | Carl Zeiss Microscopy | -- | |
| Axiocam 503彩色相机 | Carl Zeiss Microscopy | -- | |
| 卡尔蔡司LSM 980共聚焦显微镜 | Carl Zeiss Microscopy | -- | |
| 统计分析和图像处理 | Fiji v.2.14.0软件 | -- | -- |
| R v.4.6.0软件 | R Foundation for Statistical Computing | -- | |
| readxl v.1.4.5包 | -- | -- | |
| dplyr v.1.2.1包 | -- | -- | |
| lme4 v.2.0-1包 | -- | -- | |
| broom.mixed v.0.2.9.6包 | -- | -- | |
| emmeans v.2.0.1包 | -- | -- | |
| 微软Excel (Microsoft 365) | Microsoft | -- | |
| Adobe Photoshop 2026 | Adobe | -- | |
| Adobe Illustrator 2026 | Adobe | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物培养 | M. leidyi培养温度(17-19°C)、盐度(27.5 ppt)、光周期(19-5)、喂食频率;N. vectensis培养条件(16% ASW, 18°C, 暗处) 阅读提示:Methods: Animal culture |
| 移植实验 | 移植供体组织类型(胚孔唇或侧外胚层)、供体阶段(约4小时受精后)、宿主阶段、移植位置(侧方或囊胚腔)、宿主伤口的尺寸(约30 μm深、40 μm长) 阅读提示:Methods: Transplantation experiments; Extended Data Fig. 1 |
| 药理学处理 | 抑制剂浓度和处理时间(iCRT14 10 μM至8小时;CHIR99021 2.5 μM至8或24小时;SB431542 30-40 μM;A83-01 2-15 μM)、DMSO对照、开始处理阶段(2-4细胞期) 阅读提示:Methods: Pharmacological treatments; Extended Data Figs. 4, 5 |
| 原位杂交 | 探针浓度(0.5 ng/ml)、杂交温度(58°C)、蛋白酶K消化条件(80 μg/ml, 40秒) 阅读提示:Methods: In situ hybridization |
| mRNA显微注射 | mRNA浓度(0.35 µg/µl)、注射体积(约3-5 pl)、注射阶段(受精卵或8细胞期) 阅读提示:Methods: mRNA microinjections |
| Wnt表达实验 | 质粒浓度(50 ng/µl)、I-SceI浓度(0.2 U/µl)、注射阶段(8-16细胞期) 阅读提示:Methods: WNT ligand expression in N. vectensis embryos |
| 统计设计 | 生物学重复定义(独立产卵或收集)、主要终点(M. leidyi: 完整次级咽形成;N. vectensis: 异位NvFoxA表达)、显著性水平(α=0.05)、GLMM模型设置 阅读提示:Methods: Statistical analysis |