转录组学与蛋白质组学联合分析鉴定ANCA相关性肾小球肾炎的免疫特征

目的：抗中性粒细胞胞浆抗体相关性血管炎常导致严重的肾脏损害。为了更好地理解ANCA相关性肾小球肾炎并确定潜在的新治疗靶点，我们对转录组学队列中23名患者、蛋白质组学队列中10名患者以及各比较组5名健康对照的肾活检组织进行了全面的转录组学和区室蛋白质组学分析。方法：对福尔马林固定石蜡包埋的肾活检组织进行了批量RNA测序。使用DESeq2、Ingenuity Pathway Analysis和基因集富集分析鉴定差异表达基因和通路。评估了基因表达与组织学特征之间的相关性。通过激光显微切割的肾小球和肾小管间质区室的质谱分析进行蛋白质组学分析，以鉴定差异丰度蛋白和富集通路。结果：在ANCA相关性肾小球肾炎中，与对照组相比，347个基因上调，134个下调，包括IL17D、CXCR2、IL7R和CD163。值得注意的是，多个三基序蛋白家族基因上调。基因集富集分析揭示了广泛的免疫细胞富集以及促炎性白细胞介素IL-12、IL-17和IL-18信号通路的激活。此外，特定通路与组织学特征相关（r ≥ 0.6），包括组织学正常肾小球中补体级联的富集，提示补体激活先于可见的结构损伤。相反，STAT3/TRIM25信号与肾小球硬化相关，IL-23与坏死性肾小球相关，FAT10信号与间质纤维化和肾小管萎缩相关。蛋白质组学在肾小管间质中鉴定出63种差异丰度蛋白，在肾小球中鉴定出271种，关键网络激活因子在各数据集中重叠。结论：本研究揭示了ANCA相关性肾小球肾炎中复杂的肾内免疫景观，涉及多种免疫细胞参与和与进行性损伤相关的通路。我们的发现强调了潜在的进一步研究的治疗靶点，包括IL-17、IL-8和IL-23。