细胞核内多聚腺苷酸化RNA命运决定的分子基础

真核生物基因组产生大量多聚腺苷酸化RNA，它们被包装成核糖核蛋白颗粒。为确保基因表达的忠实性，功能性pA+ RNP（包括编码蛋白质的RNP）被输出到细胞质，而非功能性pA+ RNP内的转录本则在细胞核内降解。细胞如何区分这些相反的命运仍不清楚。DExD-box ATP酶UAP56是功能性pA+ RNP的核心组分，并促进其锚定到核孔复合物锚定的TREX-2上，从而触发转录本从UAP56释放以促进输出。本文揭示，多聚腺苷酸尾巴外泌体靶向连接结合一个TREX-2样模块，该模块从UAP56释放pA+ RNA以供核外泌体降解。该模块的核心由LENG8-PCID2-SEM1三聚体组成，我们证明其在结构和生化上等同于TREX-2的核心GANP-PCID2-SEM1三聚体。诱变和转录组数据表明，pA+ RNP的核命运受核质PAXT和核孔复合物相关TREX-2的竞争作用调控，它们分别将RNA结合的UAP56解读为RNA降解或输出的信号。由于PAXT的RNA靶标通常较短且内含子贫乏，我们提出了一个pA+ RNP命运决定的整体模型，即PAXT和TREX-2的不同亚核定位调控短的非功能性pA+ RNA的降解，同时允许其更长且功能性的对应物输出。