外周血白细胞LRRK2通路检测
检测PSP患者外周血中性粒细胞和单核细胞中LRRK2总蛋白及其激酶活性标志物pRab10的水平,并与对照组比较。
从新鲜血液中分离中性粒细胞和单核细胞,用DMSO或MLi-2处理,通过多重免疫印迹定量总LRRK2、pRab10等,并归一化至内参。
Biomarkers of Leucine-Rich Repeat Kinase 2 (LRRK2) and Lysosomal Dysfunction in Progressive Supranuclear Palsy
研究包含多层级证据:外周血(中性粒细胞/单核细胞)免疫印迹、CSF质谱检测、尿液BMP检测,以及遗传分层(pQTL)和临床进展关联分析,并包含功能验证(MLi-2抑制)。
PSP患者外周血中性粒细胞和单核细胞 PSP患者脑脊液样本 PSP患者尿液样本
PSP和对照组的样本量(61例PSP,34例对照) LRRK2 rs76904798和rs2242367基因型分组 MLi-2处理验证LRRK2激酶活性依赖性 尿液BMP检测按肌酐校正(ng/mg) 1年PSPRS评分变化作为进展终点
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测PSP患者外周血中性粒细胞和单核细胞中LRRK2总蛋白及其激酶活性标志物pRab10的水平,并与对照组比较。
从新鲜血液中分离中性粒细胞和单核细胞,用DMSO或MLi-2处理,通过多重免疫印迹定量总LRRK2、pRab10等,并归一化至内参。
定量尿液BMP种类水平,评估PSP患者是否存在溶酶体功能障碍。
收集新鲜尿液,离心后储存,使用多重UPLC-MS/MS定量BMP种类,并除以尿肌酐浓度校正。
使用更灵敏的SISCAPA方法定量CSF中总LRRK2和pRab10水平,并比较PSP与对照组。
CSF样本加入稳定同位素内标,经胰蛋白酶消化,使用生物素化抗体富集,LC-MS/MS检测。
评估LRRK2基因型(rs76904798和rs2242367)是否影响血液和CSF中LRRK2及pRab10水平。
对PSP和对照组进行KASP基因分型,并分析不同基因型生物标志物水平的差异。
评估基线生物标志物水平是否能预测PSP患者1年内PSPRS评分的变化。
使用线性回归模型,调整性别、年龄和基线疾病持续时间,分析基线生物标志物与1年PSPRS评分变化的关系。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞处理 | MLi-2 | -- | -- |
| CSF处理 | RIPA裂解液 | Millipore Sigma | 20-188 |
| CSF消化 | TPCK处理的胰蛋白酶 | Millipore Sigma | T1426 |
| 抗体 | LRRK2抗体(N241A/34) | Antibodies Inc. | 75-253 |
| pRab8A抗体(MJF-R20) | Abcam | ab230260 | |
| 免疫沉淀 | AssayMAP 5微升链霉亲和素SA-W柱 | Agilent Technologies | G5496-60010 |
| LC系统 | Evosep One液相色谱系统 | Evosep | -- |
| 色谱柱 | EASY-Spray PepMap RSLC C18色谱柱 | Thermo Scientific | ES904 |
| 质谱 | Thermo Exploris 480质谱仪 | Thermo Scientific | -- |
| 数据分析 | SkyLine 24.1.0.199 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 外周血白细胞分离与处理 | 中性粒细胞和单核细胞分离方法、MLi-2浓度和处理时间、DMSO浓度、储存条件(-70°C,3小时内) 阅读提示:Methods: Neutrophil and Monocyte LRRK2 and pRab10 Detection by Quantitative Immunoblotting |
| CSF样本处理与质谱检测 | CSF样本量、RIPA体积、内标浓度、胰蛋白酶消化时间、抗体用量、色谱柱型号、质谱参数 阅读提示:Methods: CSF LRRK2 and pRab10 Detection by SISCAPA |
| 尿液样本处理与BMP检测 | 尿液离心条件、储存条件、BMP定量方法、肌酐校正 阅读提示:Methods: Urine BMP Detection |
| 基因分型 | KASP基因分型方法、WGS和NBA数据处理、变异筛选标准 阅读提示:Methods: Genetic Testing |
| 统计模型 | 协变量调整(性别、年龄、疾病持续时间)、异常值排除标准、多重检验校正方法 阅读提示:Methods: Statistical Analyses |