研究人群与样本采集
建立前瞻性队列并收集母体及脐带血样本,用于代谢组学分析。
从波士顿出生队列中纳入1,253对母子(母体代谢组学)和856对母子(脐带血代谢组学)。母体血液在产后1-3天采集,脐带血在出生时采集,样本保存于-80°C。
Metabolites Co-correlating with Maternal Obesity and Gestational Weight Gain and Offspring Childhood Obesity: A Prospective Birth Cohort Study
研究为前瞻性队列,结合代谢组学分析和统计建模,但主要基于观察性关联,缺乏功能验证。
波士顿出生队列(Boston Birth Cohort)中的1,253对母子(母体代谢组学数据) 856对母子(脐带血代谢组学数据)
母体血液样本采集时间:产后1-3天 脐带血样本采集时间:出生时 代谢组学分析方法:液相色谱-串联质谱法(两种色谱模式) COWO定义:年龄和性别BMI≥第85百分位
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立前瞻性队列并收集母体及脐带血样本,用于代谢组学分析。
从波士顿出生队列中纳入1,253对母子(母体代谢组学)和856对母子(脐带血代谢组学)。母体血液在产后1-3天采集,脐带血在出生时采集,样本保存于-80°C。
定量检测母体和脐带血中的代谢物,评估代谢组学谱。
采用液相色谱-串联质谱法(LC-MS/MS)在Broad Institute进行代谢组学分析,包括两种色谱模式:亲水相互作用色谱(正离子模式)和C8色谱(正离子模式)。检测了392种母体代谢物和377种脐带代谢物,排除变异系数>20%的代谢物后,保留约330种两者共有的代谢物。
评估ppBMI和GWG与母体和脐带血代谢物水平的关联。
采用线性回归模型分析ppBMI(连续和分类)和GWG(连续)与代谢物水平的关联,调整了多个协变量,并使用Benjamini-Hochberg程序进行多重检验校正(FDR < 0.05)。
构建反映母体肥胖表型整体代谢响应的综合评分。
采用弹性网络回归(R包glmnet v4.1.4)和10折交叉验证,基于母体和脐带血代谢物构建预测ppBMI或GWG的评分。
检验代谢物评分与出生体重和儿童超重或肥胖(COWO)的关联。
采用线性回归(出生体重)和逻辑回归(COWO)评估母体肥胖表型、代谢物评分与COWO风险的关联,并进行了中介分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 代谢组学分析 | 液相色谱-串联质谱法 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 样本采集 | 母体血液采集时间(产后1-3天)、脐带血采集时间(出生时)、样本保存条件(-80°C) 阅读提示:Methods: Study population 和 Metabolomics profiling of maternal and umbilical cord blood |
| 代谢组学方法 | 液相色谱-串联质谱法的具体设置(色谱模式、质谱条件) 阅读提示:Methods: Metabolomics profiling of maternal and umbilical cord blood(并指出详细方法见参考文献25) |
| 关联分析 | 调整的协变量列表(孕妇年龄、种族、胎次、教育、吸烟、饮酒、糖尿病、孕周、分娩方式、喂养方式、ppBMI/GWG等) 阅读提示:Methods: Statistical analysis |
| 多代谢物评分构建 | 弹性网络回归的参数(lambda.min)、交叉验证折数(10折) 阅读提示:Methods: Statistical analysis |
| 结局定义 | COWO定义(BMI≥85th percentile)、评估年龄段(2-5、6-9、10-18岁) 阅读提示:Methods: Assessment of pre-pregnancy body mass index, gestational weight gain, and childhood overweight or obesity |