诱导酒精依赖模型
建立乙醇依赖和非依赖小鼠模型,并验证饮酒量升高。
将astro-TRAP小鼠分为依赖组(CIE-2BC)、非依赖组(2BC)和naïve组,进行慢性间歇性乙醇暴露和双瓶选择,测量饮酒量和BEC。
Astrocyte reactivity by alcohol dependence in the central amygdala
包含TRAP-Seq转录组、蛋白质组、磷酸化蛋白质组及形态学重建等多个独立证据层级,并进行功能通路分析与验证。
Aldh1l1-EGFP/Rpl10a (astro-TRAP) 小鼠 慢性间歇性乙醇双瓶选择 (CIE-2BC) 模型
小鼠品系为B6;FVB-Tg(Aldh1l1-EGFP/Rpl10a) JD130Htz/J (astro-TRAP),来自Jackson Laboratory (strain # 030247) 实验分组:乙醇依赖组(Dep)接受CIE-2BC,非依赖组(Non-Dep)仅2BC,以及naïve组 行为验证:第二队列在CIE第3和第4周后显示饮酒量升高,BEC为162-211 mg/dl TRAP样本与input样本分离验证:通过qPCR确认星形胶质细胞标志物富集和神经元/小胶质细胞/少突胶质细胞标志物消耗 统计方法:两份队列,各含10-12只/性别/处理,多重比较校正p < 0.05
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立乙醇依赖和非依赖小鼠模型,并验证饮酒量升高。
将astro-TRAP小鼠分为依赖组(CIE-2BC)、非依赖组(2BC)和naïve组,进行慢性间歇性乙醇暴露和双瓶选择,测量饮酒量和BEC。
鉴定CeA星形胶质细胞中酒精依赖和饮酒引起的翻译变化。
使用TRAP技术从CeA中提取星形胶质细胞特异性翻译RNA,进行RNA-Seq,以input作为对照,并通过qRT-PCR验证富集。
检测CeA组织中蛋白质表达和磷酸化变化,并推断星形胶质细胞特异性。
对CeA样本进行LC-MS/MS蛋白质组和磷酸化蛋白质组分析,利用DIA-NN处理数据,并用limma进行统计。
验证星形胶质细胞中关键基因(Stat1、Stat3、C4b)的表达和细胞类型定位。
使用RNAscope荧光原位杂交检测CeA脑片中Stat1、Stat3和C4b的表达,与星形胶质细胞标志物Aldh1l1和神经元标志物Tubb3共定位。
评估酒精饮酒和依赖对CeA星形胶质细胞形态复杂度和空间结构的影响。
通过免疫组化增强EGFP信号,使用共聚焦显微镜采集Z栈图像,并用Neurolucida 360进行三维重建,分析分支复杂度、Sholl分析和凸包面积/体积。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物模型 | B6;FVB-Tg(Aldh1l1-EGFP/Rpl10a) JD130Htz/J 小鼠 | The Jackson Laboratory | strain # 030247 |
| qRT-PCR | Luna Universal 一步法RT-qPCR试剂盒 | NEB | -- |
| Quant-it RiboGreen试剂盒 | ThermoFisher | -- | |
| RNAscope | RNAscope 多通道荧光试剂盒 v2 | ACD Bio | Cat. # 323270 |
| 荧光显微镜 | Leica DM500b显微镜 | Leica | -- |
| 免疫组化 | 大鼠抗EGFP抗体 | Nacalai | Cat#: 04404-84, RRID: AB_10013361 |
| Alexa Fluor 驴抗大鼠488二抗 | Thermo Fisher Scientific | Cat#: A-21208, RRID: AB_2535794 | |
| 共聚焦显微镜 | Zeiss LSM 780共聚焦显微镜 | Zeiss | -- |
| 形态分析 | Neurolucida 360 | MBF Bioscience | V2024.2.2 |
| 生物信息分析 | Ingenuity通路分析 | Qiagen | -- |
| RNAscope | RNAscope Aldh1l1探针 | -- | Cat. # 405891-C2 |
| RNAscope Tubb3探针 | -- | Cat. # 423391-C3 | |
| RNAscope Stat1探针 | -- | Cat. # 479611 | |
| RNAscope Stat3探针 | -- | Cat. # 425641 | |
| RNAscope核染色 | DAPI | Molecular Instruments | -- |
| 统计 | GraphPad Prism | GraphPad Software | V10.5.0 |
| R | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型与分组 | 小鼠品系、性别、年龄、饲养条件、分组(Dep/Non-Dep/Naïve)及样本量 阅读提示:Methods 2.1 动物部分 |
| CIE-2BC模型 | 乙醇蒸气暴露方案、双瓶选择程序、乙醇浓度、BEC测定时间点、是否确认饮酒量升高 阅读提示:Methods 2.2 和 Results 3.1 |
| TRAP实验 | CeA组织取材坐标、TRAP分离方法、RNA提取方法、测序平台、reads处理参数 阅读提示:Methods 2.3 和 Supplementary Methods |
| RNA-Seq分析 | 差异分析模型、协变量(性别、TRAP批次)、显著阈值、参考基因组版本 阅读提示:Methods 2.4 和 Supplementary Methods |
| 蛋白质组/磷酸化蛋白质组 | 样品制备方法、LC-MS/MS参数、DIA-NN设置、统计分析模型(协变量)、显著阈值 阅读提示:Methods 2.8 和 Supplementary Methods |
| 星形胶质细胞形态分析 | 固定方法、切片厚度、抗体浓度、成像参数(Z栈深度、步长)、重建软件版本 阅读提示:Methods 2.9 和 Supplementary Methods |