甲状腺癌中突变特异性的去分化轨迹与肿瘤-基质相互作用动态

Mutation-specific dynamics of dedifferentiation trajectories and tumor-stromal interactions in thyroid cancer

作者信息Eun Hye Joo, Young Shin Song, Han Sai Lee, Gyeongseo Jung, Eun-Jae Chung, Su-Jin Kim, Yoo Hyung Kim, Sun Wook Cho, Hongyoon Choi, Jae-Kyung Won, Woong-Yang Park, Young Joo Park
PMID42458477
发布时间2026-07-16
DOI10.1186/s12943-026-02699-2

摘要

从分化型甲状腺癌到间变性甲状腺癌(ATC)的进展涉及显著的上皮可塑性和肿瘤微环境(TME)重塑,但BRAFV600E和RAS驱动突变如何影响这些过程尚不清楚。本研究整合了BRAFV600E和RAS驱动的甲状腺肿瘤的单核RNA测序(snRNA-seq)、空间转录组学和批量RNA测序数据,以描绘突变特异性的进展轨迹。BRAFV600E驱动的肿瘤表现出具有免疫通路激活的渐进性去分化轨迹,而RAS驱动的肿瘤则表现出以非整倍性、上皮-间质转化、缺氧和细胞外基质重塑为特征的急剧转变。癌症相关成纤维细胞(CAFs)作为关键调节因子出现,具有突变特异性的配体-受体相互作用:基于整合素的信号在BRAFV600E突变ATC中占主导,而PLAU-PLAUR、TNFSF10-TNFRSF10B和AREG-EGFR在RAS驱动的ATC中额外富集。这些CAF-上皮细胞环路在空间上得到验证,并与不良预后相关。总之,我们的研究结果揭示了与甲状腺癌去分化相关的突变依赖性上皮和TME动态,并强调了分子定制方法在晚期甲状腺癌管理中的潜在重要性。

实验方法

产品清单

名称品牌货号
Qiagen DNeasy血液和组织试剂盒QiagenDNeasy Blood & Tissue Kit
Twist NGS文库构建试剂盒Twist Bioscience CompanyTwist NGS Library Kit
NovaSeq6000平台IlluminaNovaSeq6000
Qiagen RNeasy迷你试剂盒QiagenRNeasy Mini Kit
Illumina TruSeq链特异性mRNA文库制备试剂盒IlluminaTruSeq Stranded mRNA Library Prep Kit
Illumina NovaSeq 6000平台IlluminaNovaSeq 6000
LUNA-FL自动荧光细胞计数器--LUNA-FL
10x Genomics Chromium Next GEM单细胞3'试剂盒v3.110x Genomics1000268
Chromium Next GEM Chip G单细胞试剂盒10x Genomics1000127
安捷伦生物分析仪AgilentBioanalyzer
Illumina NovaSeq 6000IlluminaNovaSeq 6000
S1试剂盒v1.5IlluminaS1 Reagent Kit v1.5