建立UVB诱导RIP1上调的体外细胞模型
确定UVB照射的最佳剂量和时间,以诱导RIP1显著上调。
体外培养HDFs和HaCaT细胞,分别用不同剂量UVB照射(HaCaT细胞20 mJ/cm2,HDFs 40 mJ/cm2),并在照射后24小时收集细胞,通过Western blot和免疫荧光检测RIP1表达。
Upregulation of Receptor Interacting Protein 1 Induced by UVB Contributes to Photodamage of the Skin Through NF-κB Pathway In Vivo and In Vitro
体外细胞模型(HDFs、HaCaT)与体内小鼠模型(Balb/c裸鼠)结合,包含RIP1抑制和siRNA敲低的功能验证,以及NF-κB通路机制验证。
人真皮成纤维细胞(HDFs) HaCaT细胞系 Balb/c裸鼠皮肤
UVB照射剂量:HaCaT细胞20 mJ/cm2,HDFs 40 mJ/cm2,小鼠皮肤600 mJ/cm2 UVB照射后细胞收集时间:24小时;小鼠皮肤取样时间:48小时 RIP1抑制剂Nec-1处理:体外25 μM,体内2.5 mg/kg皮下注射 RIP1 siRNA转染:转染后48小时进行UVB照射 基因表达检测:RT-qPCR,以β-actin为内参,使用2-ΔΔCt计算
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定UVB照射的最佳剂量和时间,以诱导RIP1显著上调。
体外培养HDFs和HaCaT细胞,分别用不同剂量UVB照射(HaCaT细胞20 mJ/cm2,HDFs 40 mJ/cm2),并在照射后24小时收集细胞,通过Western blot和免疫荧光检测RIP1表达。
探究RIP1上调是否通过NF-κB通路介导光损伤。
在UVB照射后检测NF-κB通路相关蛋白(p65、p50、p-p65、IκB)和炎症因子(IL-1β、IL-6、IL-8、TNF-α)的表达,以及p-p65的核转位情况。
验证RIP1的抑制(Nec-1和siRNA)是否能逆转UVB诱导的NF-κB通路激活和炎症因子表达。
在UVB照射前或后,使用RIP1抑制剂Nec-1处理细胞或转染RIP1 siRNA,检测RIP1表达、NF-κB通路蛋白和炎症因子的变化。
在动物模型中验证RIP1/NF-κB通路在UVB诱导皮肤光损伤中的作用。
Balb/c裸鼠背部皮肤照射600 mJ/cm2 UVB,照射后立即皮下注射Nec-1(2.5 mg/kg)或DMSO对照,48小时后取皮肤组织,通过免疫组化和Western blot检测RIP1、p65、p50的表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Hyclone | SH30021.01 |
| MEM培养基 | Genview | GM3102-500ML | |
| 胎牛血清 | Gibico | 10 | |
| 青霉素-链霉素 | Hyclone | SV30010 | |
| 含EDTA的0.25%胰蛋白酶 | Invitrogen | 25200-056 | |
| 药物处理 | 坏死抑素-1 | Selleck Chemicals | -- |
| 二甲基亚砜 | Sigma-Aldrich | D2650 | |
| RNA提取 | Trizol试剂 | Invitrogen | 15 |
| RT-PCR | Revert Aid第一链cDNA合成试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | k1622 |
| RT-qPCR | KAPA SYBR FAST qPCR试剂盒 | Kapa Biosystems | KK4610 |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| BCA蛋白浓度测定试剂盒 | Beyotime | P0012 | |
| 5×上样缓冲液 | Beyotime | P0015L | |
| SDS-PAGE凝胶试剂盒 | Applygen | -- | |
| 预染蛋白marker | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| Mini-PROTEAN Tetra电泳槽 | Bio-Rad | -- | |
| PowerPac Basic电源 | Bio-Rad | -- | |
| Trans-Blot SD半干转印槽 | Bio-Rad | -- | |
| 抗RIP抗体 | Abcam | ab72139 | |
| 抗RIP抗体 | Abcam | ab106393 | |
| 抗磷酸化RIP (Ser166)抗体 | CST | 65746S | |
| 抗NF-κB p65抗体 | Abcam | ab16502 | |
| 抗NF-κB p65磷酸化S536抗体 | Abcam | ab86299 | |
| 抗NFKB1, p105, p50抗体 | Proteintech | 15506-1-AP | |
| 抗IκB抗体 | Proteintech | 10268-1-AP | |
| 抗GAPDH抗体 | Abcam | ab8245 | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Abcam | ab8226 | |
| 抗γ-H2A.X磷酸化S139抗体 | Abcam | ab11174 | |
| 免疫荧光 | Triton X-100 | -- | -- |
| 山羊血清 | Pulilai | -- | |
| 抗磷酸化RIP (Ser166)抗体 | Cell Signaling Technology | 44590 | |
| Alexa Fluor 594二抗 | Abcam | ab150080 | |
| 抗NF-κB p65抗体 | Abcam | ab190205 | |
| Alexa Fluor 488 | -- | -- | |
| DAPI | -- | -- | |
| 封片剂 | Zhongshan Jinqiao ZSGB-BIO | ZLI-9557 | |
| Leica DFC300 FX显微镜 | Leica | -- | |
| 免疫组化 | 0.3%过氧化氢 | -- | -- |
| 柠檬酸钠缓冲液 | Solarbio Life Sciences | C1031 | |
| 正常山羊血清封闭液 | Pulilai | -- | |
| 酶标羊抗小鼠/兔IgG聚合物 | ZSGB-BIO | PV6000 | |
| DAB显色液 | ZSGB-BIO | -- | |
| 中性树胶 | -- | -- | |
| UVB照射 | Waldmann UV 208T紫外照射仪 | HerbertWaldmann GmbH&Co. | -- |
| 组织研磨 | 离心管 | Jingxin | JX-LG0101 |
| 低温组织研磨仪 | Jingxin | JXFSTPRP-CL |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞类型(HDFs、HaCaT)、培养基(DMEM/MEM)、FBS浓度、青链霉素浓度、培养条件 阅读提示:Methods 2.2 Cell Culture and siRNA Transfection |
| UVB照射 | UVB剂量(HaCaT 20 mJ/cm2,HDFs 40 mJ/cm2,小鼠600 mJ/cm2)、照射后处理(PBS洗涤、照射时PBS覆盖)、照射后收集时间(体外24h,体内48h) 阅读提示:Methods 2.3 UVB Irradiation and Nec-1 Addition; Results 3.1、3.4.1 |
| RIP1抑制 | Nec-1浓度(体外10、25、50 μM;体内2.5 mg/kg,皮下注射)、siRNA转染浓度和时间(转染后48小时) 阅读提示:Methods 2.2、2.3; Results 3.2、3.3、3.4.2 |
| 蛋白质检测 | 蛋白提取方法(RIPA裂解液+PMSF)、蛋白上样量(30-40 μg)、抗体信息(抗RIP、抗p-RIP、抗p65等) 阅读提示:Methods 2.5 Western Blot |
| 基因表达检测 | 引物序列(Table 1)、内参基因(β-actin)、qPCR试剂盒、计算方式(2-ΔΔCt) 阅读提示:Methods 2.4 PCR; Table 1 |