建立肿瘤模型和治疗方案
评估抗VEGF治疗在乳腺癌模型中的作用并诱导异质性缺氧反应
使用MMTV-PyMT转基因小鼠和4T1原位模型,给予抗VEGF抗体B20-4.1.1或对照,监测肿瘤生长和生存期,并通过pimonidazole染色评估缺氧水平,将治疗组分为高缺氧(HH)和低缺氧(LH)亚组。
Osteopontin mediates acquired resistance to hypoxia-inducing antiangiogenics and promotes anti-PD-L1 refractoriness in breast cancer models
包含小鼠乳腺癌模型(MMTV-PyMT和4T1)、细胞系体内外实验、单细胞RNA测序、遗传敲除(上皮Spp1-KO和骨髓嵌合体)以及临床试验数据分析等多个独立证据层级,并进行了功能验证和机制验证。
MMTV-PyMT转基因小鼠乳腺癌模型 4T1原位同种移植小鼠模型 BRL1468细胞系(源自PyMT肿瘤的原代细胞系) RAW264.7巨噬细胞系
缺氧程度分类:HH vs LH肿瘤,基于6周时pimonidazole缺氧分数中位数(10.4%)分类 抗VEGF治疗:B20-4.1.1抗体(5 mg/kg,每周两次,腹腔注射)或同型对照 SPP1中和:抗SPP1抗体(克隆103D6,10 mg/kg,每周两次,腹腔注射) 抗PD-L1治疗:抗PD-L1抗体(克隆10F.9G2,5 mg/kg,每周两次,腹腔注射) 巨噬细胞清除:抗CSF1R抗体(克隆AFS98,20 mg/kg,每周三次,腹腔注射)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估抗VEGF治疗在乳腺癌模型中的作用并诱导异质性缺氧反应
使用MMTV-PyMT转基因小鼠和4T1原位模型,给予抗VEGF抗体B20-4.1.1或对照,监测肿瘤生长和生存期,并通过pimonidazole染色评估缺氧水平,将治疗组分为高缺氧(HH)和低缺氧(LH)亚组。
验证缺氧诱导性抗VEGF治疗是否上调PD-L1,以及PD-L1阻断在HH肿瘤中的疗效
通过免疫组化和流式细胞术检测肿瘤细胞和浸润免疫细胞的PD-L1和PD-1表达,并比较抗PD-L1联合抗VEGF在不同缺氧亚组中的生存期。
探讨HH肿瘤中免疫抑制性髓系浸润,尤其是巨噬细胞的表型
通过流式细胞术和转录组分析(bulk RNA-seq和GSEA)比较LH和HH肿瘤的免疫细胞组成,发现HH肿瘤富含M2样巨噬细胞和免疫抑制特征。
验证M2样巨噬细胞在HH肿瘤中是否功能性地抑制T细胞并维持缺氧
通过体内抗CSF1R抗体耗竭巨噬细胞,观察肿瘤生长、缺氧和T细胞功能的变化;体外共培养实验评估HH来源的TAM对T细胞的影响。
寻找巨噬细胞积累上游的初始事件,并验证缺氧诱导SPP1产生的机制
通过单细胞RNA测序和CellChat分析鉴定了SPP1作为HH肿瘤中上皮细胞到巨噬细胞的主要通讯信号;用重组SPP1进行巨噬细胞迁移、极化和信号通路实验;检测缺氧对SPP1表达的影响。
验证SPP1在缺氧诱导免疫抑制中的因果关系,并确定其主要来源
使用抗SPP1中和抗体验证其对肿瘤生长、免疫浸润和抗PD-L1敏感性的影响;通过上皮Spp1-KO移植物和骨髓嵌合体实验确定SPP1的主要来源。
验证SPP1、缺氧、巨噬细胞和VEGF的动态关系,并将结果外推至临床样本
在小鼠模型中评估SPP1、缺氧、巨噬细胞和VEGF的时间变化;在临床试验NCT01484080中分析术前nintedanib治疗前后SPP1表达和缺氧分数的变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验(抗体处理) | B20-4.1.1抗体 | Genentech | -- |
| 抗PD-L1抗体(10F.9G2) | Bio X Cell | BE101 | |
| 抗SPP1抗体(103D6) | Bio X Cell | BE0373 | |
| 抗CSF1R抗体(AFS98) | Bio X Cell | BE0213 | |
| 缺氧检测 | 盐酸哌莫硝唑 | Hypoxyprobe Kit | HP1-1000Kit |
| 细胞培养 | 基质胶 | Corning | -- |
| 细胞迁移实验 | 血管内皮生长因子A | Preprotech | 450-32 |
| 骨桥蛋白 | Biotechne | 441-OP-050/CF | |
| 细胞毒性实验 | 小鼠CD45磁珠 | Miltenyi Biotec | 130-052-301 |
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Gibco | 11875085 |
| 细胞毒性实验 | CellTiter-Glo发光法细胞活力检测试剂盒 | Promega | G7570 |
| 细胞分选 | BD FACSAria流式细胞分选仪 | BD Biosciences | -- |
| 单细胞测序 | 3'端CellPlex试剂盒A | 10x Genomics | 1000261 |
| Chromium系统 | 10x Genomics | -- | |
| Illumina Nextseq 550测序仪 | Illumina | -- | |
| 临床样本处理 | RNeasy FFPE试剂盒 | Qiagen | 73504 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型和分组 | 确切的小鼠品系、周龄、肿瘤细胞系和注射剂量 阅读提示:见Methods下的'Mouse models'和'Animal treatments and tumor measurements' |
| 抗VEGF治疗 | B20-4.1.1的剂量、给药频率、给药途径及对照抗体的选择 阅读提示:见Methods下的'Animal treatments and tumor measurements' |
| 缺氧评估 | pimonidazole的剂量、给药时间、缺氧染色和定量方法 阅读提示:见Methods下的'Animal treatments and tumor measurements'及Figure 1图注 |
| 免疫细胞分析 | 流式细胞术的抗体克隆、荧光标记、门控策略和数据分析方法 阅读提示:见Supplemental Methods,或参考Figure 2和Figure 3的图注 |
| SPP1和巨噬细胞操作 | 抗SPP1和抗CSF1R抗体的剂量、给药方案及遗传敲除或骨髓嵌合体的具体构建方法 阅读提示:见Methods下的'Animal treatments and tumor measurements'及Supplemental Methods |