验证ALDH1A1表达上调
检测ALDH1A1在ADPKD中的表达变化。
通过Western blot和qRT-PCR检测Pkd1突变细胞和小鼠肾脏及人ADPKD肾脏中ALDH1A1的表达,并利用免疫组化观察其定位。
Aldehyde dehydrogenase 1 A1 regulates the transcription of PD-L1 and its targeting with disulfiram together with PD-L1 immunotherapy synergistically delays cyst growth in ADPKD
包含细胞系、两种Pkd1突变小鼠模型、基因敲除和药物抑制实验,并进行了Western blot、qRT-PCR、免疫组化、流式、ChIP和CUT&Tag等多层级验证,以及功能验证和机制验证。
Pkd1 nl/nl 小鼠模型(快速进展型) Pkd1 RC/RC 小鼠模型(缓慢进展型) Pkd1 条件敲除小鼠模型(Pkd1flox/flox:Aldh1A1−/−:Ksp-Cre) Pkd1 突变肾上皮细胞系(PN24细胞)
模型:Pkd1nl/nl、Pkd1RC/RC、Pkd1flox/flox:Aldh1A1−/−:Ksp-Cre小鼠 ALDH1A1抑制剂量:DSF 50 mg/kg,腹腔注射,每两天一次 PD-L1抗体剂量:10F.9G2 10 mg/kg,每周三次 处理时间:Pkd1nl/nl小鼠从PN8至PN27,Pkd1RC/RC小鼠从1月龄至90天 关键对照:DMSO或PBS对照,以及Pkd1flox/flox:Aldh1A1+/+:Ksp-Cre和野生型小鼠
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测ALDH1A1在ADPKD中的表达变化。
通过Western blot和qRT-PCR检测Pkd1突变细胞和小鼠肾脏及人ADPKD肾脏中ALDH1A1的表达,并利用免疫组化观察其定位。
确定ALDH1A1对囊肿生长的因果作用。
生成Pkd1flox/flox:Aldh1A1−/−:Ksp-Cre小鼠,比较其与对照小鼠的囊肿指数、KW/BW、BUN、细胞增殖和凋亡。
评估DSF对囊肿生长的治疗效果。
分别用DSF或溶剂处理Pkd1nl/nl和Pkd1RC/RC小鼠,检测囊肿指数、KW/BW、BUN、增殖和凋亡。
探究ALDH1A1抑制对免疫细胞浸润和分化的影响。
通过F4/80染色和流式细胞术检测巨噬细胞和T细胞亚群比例。
解析ALDH1A1调控细胞增殖、凋亡和免疫应答的分子机制。
通过Western blot检测信号通路蛋白磷酸化变化;通过ChIP和CUT&Tag验证ALDH1A1作为转录因子直接结合靶基因。
验证ALDH1A1抑制联合PD-L1抗体是否具有协同效应。
用DSF、抗PD-L1抗体、两者联合或溶剂处理Pkd1小鼠,比较囊肿指数、KW/BW、BUN、增殖和凋亡。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 双硫仑 | -- | -- |
| 细胞凋亡检测 | BAY-11-7085 | -- | -- |
| 免疫治疗 | PD-L1抗体10F.9G2 | -- | -- |
| 细胞因子处理 | 肿瘤坏死因子α | -- | -- |
| 细胞培养 | 二甲基亚砜 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型及处理 | 小鼠品系(Pkd1nl/nl、Pkd1RC/RC)、遗传背景(129S/6)、DSF剂量(50 mg/kg)、给药途径(腹腔注射)、给药频率(每两天一次)、处理时间(Pkd1nl/nl从PN8至PN27;Pkd1RC/RC从1月龄至3月龄)、抗PD-L1剂量(10 mg/kg)、频率(每周三次) 阅读提示:Methods: Mouse strains and treatments |
| 基因敲除模型 | 敲除策略(Pkd1flox/flox:Aldh1A1−/−:Ksp-Cre)、对照(Pkd1flox/flox:Aldh1A1+/+:Ksp-Cre)、分析时间(PN10)、动物来源(Aldh1A1−/−小鼠由Vasilis Vasiliou提供) 阅读提示:Methods: Mouse strains and treatments; Figure 2 legends |
| 细胞增殖与凋亡检测 | Ki67染色定量方法(统计每1000个核中的阳性核数)、TUNEL实验条件、样本量(n=3) 阅读提示:Figure 3e and f legends; Methods |
| 免疫分析 | 流式细胞术的细胞制备、抗体组合(F4/80、CD11b、CD4、CD8、CD69、CD62L)、门控策略、样本量 阅读提示:Figure 4, 8 and Supplementary Figure S12 legends |
| 分子机制分析 | ChIP实验条件(抗体、IgG对照)、CUT&Tag条件(抗体、数据分析参数)、Western blot抗体及浓度 阅读提示:Figure 5f, 6 legends; Supplementary Methods |