组织病理学和免疫组化分析
确认肿瘤的SCLC形态和免疫表型,并评估Rb表达状态
对FFPE肿瘤组织进行H&E染色和免疫组化,检测神经内分泌标志物、细胞角蛋白、TTF-1、Napsin A、SMARCA4/BRG1、Ki67和Rb。
Clinically actionable molecular alterations in Rb-retained small cell lung carcinoma variants
文献为两例病例报告,包含组织病理学、免疫组化、综合基因组分析和低深度全基因组测序,并有一例患者接受靶向治疗及随访,但缺少功能验证和机制实验。
案例1:54岁女性患者的SCLC肿瘤组织 案例2:55岁女性患者的SCLC肿瘤组织
Rb蛋白表达保留(IHC) KRAS p.G12C突变(VAF 44.5%) IKZF2::ERBB4融合(RNA-based) 拷贝数变异谱(低深度全基因组测序)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认肿瘤的SCLC形态和免疫表型,并评估Rb表达状态
对FFPE肿瘤组织进行H&E染色和免疫组化,检测神经内分泌标志物、细胞角蛋白、TTF-1、Napsin A、SMARCA4/BRG1、Ki67和Rb。
识别驱动突变、拷贝数改变、融合及基因组特征
使用Oncomine Comprehensive Assay Plus (DNA/RNA)检测517个基因的变异、TMB和MSI,并进行低深度全基因组测序评估拷贝数变异。
评估可操作驱动突变对应的靶向治疗反应
对病例1在二线给予KRASG12C抑制剂sotorasib,并随访影像学反应。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 分子分析 | Oncomine Comprehensive Assay Plus | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 组织病理学和免疫组化 | 肿瘤组织类型(FFPE)、IHC抗体清单及其克隆号、染色条件 阅读提示:Materials and methods: Histopathology and immunohistochemistry |
| 分子分析 | 基因panel版本、测序平台、DNA/RNA起始量、TMB和MSI计算方法 阅读提示:Materials and methods: Molecular profiling |