构建KM小鼠肺腺癌模型并诱导肿瘤发生
模拟KRAS驱动的肺腺癌发生过程,观察Eif4a2缺失对肿瘤起始的影响。
使用KrasLSL-G12D/WT; Rosa26LSL-MYC/LSL-MYC小鼠,通过鼻内给予Ad5-SPC-CRE腺病毒诱导肿瘤发生,同时敲除Eif4a2基因。
Increased mRNA translation delays tumour initiation and exposes a therapeutic vulnerability in lung cancer
包含转基因小鼠模型、细胞系模型、CRISPR敲除、核糖体足迹、代谢组学、空间转录组学、药物干预等多个独立证据层级,并进行了功能验证和机制验证。
KRASLSL-G12D/WT; Rosa26LSL-MYC/LSL-MYC 小鼠肺腺癌模型 KM细胞系(KMNTC和KM4A2cr) 患者来源的肺腺癌组织微阵列(LATTICe-A队列)
Eif4a2敲除方式:条件性敲除(Eif4a2fl/fl)或CRISPR介导的敲除(KM4A2cr) 雷帕霉素处理:剂量10 mg/kg,每日腹腔注射,时间窗口(7-28天或62-84天) 曲美替尼处理:剂量1 mg/kg,每日腹腔注射 模型:KM小鼠(KRASG12D和MYC过表达) 检测指标:肿瘤负荷、p21表达、衰老标志物、MAPK信号
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
模拟KRAS驱动的肺腺癌发生过程,观察Eif4a2缺失对肿瘤起始的影响。
使用KrasLSL-G12D/WT; Rosa26LSL-MYC/LSL-MYC小鼠,通过鼻内给予Ad5-SPC-CRE腺病毒诱导肿瘤发生,同时敲除Eif4a2基因。
确定Eif4a2缺失是否影响肿瘤起始和进展。
通过H&E染色、免疫组化检测p21、KRASG12D免疫荧光、iRFP成像监测肿瘤生长,比较Eif4a2wt/wt和Eif4a2fl/fl小鼠的肿瘤负荷和生存期。
在细胞水平研究Eif4a2缺失对衰老和肿瘤细胞行为的影响。
从KM小鼠肺肿瘤中分离细胞,使用CRISPR-Cas9敲除Eif4a2(KM4A2cr)或用非靶向对照(KMNTC)。
验证Eif4a2缺失是否诱导细胞衰老。
通过免疫荧光检测p21、RCAS1,测量核面积、β-半乳糖苷酶活性、氧消耗率和ROS水平。
揭示eIF4A2缺失如何改变翻译景观和代谢。
进行核糖体足迹分析、LC-MS代谢组学检测细胞内和培养基中代谢物水平,并用雷帕霉素和eFT226处理细胞观察对OCR和代谢的影响。
确定抑制mRNA翻译是否能逆转衰老并恢复肿瘤生长。
在小鼠模型中,于肿瘤早期(7-28天)或后期(62-84天)给予雷帕霉素,检测肿瘤负荷和p21表达。
阐明Eif4a2缺失肿瘤如何绕过衰老并生长。
利用空间转录组学分析eIF4A2阴性肿瘤的基因表达谱,用Western blot检测MAPK和PI3K信号通路,并用vemurafenib处理细胞观察对衰老标志物和球体形成的影响。
确定eIF4A2缺失肿瘤是否对MEK抑制剂敏感。
在细胞水平用trametinib处理KMA2+/+和KMA2-/-细胞检测增殖;在体内给予KM-Eif4a2fl/fl小鼠trametinib处理检测肿瘤数量。
评估eIF4A2低表达是否在人类肺癌中与MAPK信号增强相关。
使用LATTICe-A队列组织微阵列进行多重免疫荧光检测eIF4A1、eIF4A2、pERK、pAKT,分析表达相关性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 胎牛血清 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 药物处理 | 雷帕霉素 | MedChemExpress | -- |
| eFT226 | MedChemExpress | -- | |
| 曲美替尼 | MedChemExpress | -- | |
| 威罗菲尼 | MedChemExpress | -- | |
| 细胞染色 | CellROX绿色荧光染料 | Invitrogen | -- |
| 细胞衰老绿色检测试剂盒 | Invitrogen | -- | |
| 免疫组织化学 | eIF4A1抗体 | Abcam | ab31217 |
| eIF4A2抗体 | Abcam | ab31218 | |
| pERK1/2抗体 | Cell Signaling | 4370 | |
| p21抗体 | Abcam | ab107099 | |
| 免疫荧光 | KRASG12D抗体 | Cell Signaling | 14429 |
| RCAS1抗体 | Cell Signaling | 12290 | |
| 核糖体足迹 | 核糖核酸酶I | Thermo Fisher Scientific | -- |
| SUPERaseIn RNA酶抑制剂 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 代谢组学 | Q Exactive Plus轨道阱质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Ultimate 3000高效液相色谱系统 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| ZIC-pHILIC色谱柱 | SeQuant | -- | |
| 海马细胞外流量分析仪 | Agilent | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠模型诱导 | 小鼠品系、年龄、性别、体重、病毒滴度、给药方式 阅读提示:Methods: Mice |
| 药物处理 | 雷帕霉素和曲美替尼的剂量、溶剂、给药途径、给药时间窗口、时长 阅读提示:Methods: Mice |
| 细胞培养 | 细胞来源、培养基、血清浓度、培养条件(37°C,5% CO2)、处理浓度和时长 阅读提示:Methods: Cell lines, antibodies and reagents |
| 核糖体足迹 | 细胞密度、裂解液成分、RNase I浓度和消化时间、蔗糖梯度离心参数 阅读提示:Methods: Ribosome footprinting |
| 代谢组学 | 细胞数量、提取溶剂、LC-MS参数、内标 阅读提示:Methods: Metabolomics |
| 空间转录组学 | 组织切片制备、探针、UV切割区域、测序平台 阅读提示:Methods: Spatial transcriptomics |