癌症基因型基础模型实现治疗反应的精准预测

尽管基因测序在癌症诊疗中已成为常规，但将肿瘤复杂的突变谱转化为可操作的治疗决策仍是一个核心挑战。MutationProjector通过从30,000多个肿瘤的大规模基因组改变语料库中进行预训练，并与广泛的分子知识整合而构建。该模型产生的投影揭示了肿瘤改变的分子通路，便于模型解释，并能准确重建未见的突变，展示了模型的泛化能力。当应用于预测多种癌症类型和队列的免疫治疗或化疗耐药性时，MutationProjector在所有情境下均达到或超越了最先进的性能。它识别出了意想不到的生物标志物，包括免疫治疗敏感性中的KMT2D突变以及免疫治疗耐药性中SMARCA4和STK11的联合改变。这些结果建立了一个连接肿瘤基因型、生物学机制和治疗结果的统一框架。