发现高转移性肿瘤诱导内皮SLIT2表达
鉴定由高转移性肿瘤诱导的内皮细胞表达的促转移因子。
使用RiboTag技术标记内皮细胞核糖体,免疫沉淀后进行RNA-seq,比较B16F10(高转移)和B16F0(低转移)肿瘤的内皮基因表达差异;用qPCR和免疫荧光验证SLIT2在内皮中的上调;用条件培养基处理内皮细胞确认其诱导作用。
Tumoural activation of TLR3-SLIT2 axis in endothelium drives metastasis
包含RiboTag测序、条件性基因敲除小鼠、多种肿瘤模型、体外迁移实验、人组织样本分析等多层级验证,并明确功能与机制验证。
小鼠乳腺癌模型(4T1、MMTV-PyMT) 小鼠黑色素瘤模型(B16F10/B16F0) 小鼠肺癌模型(LLC) 人乳腺癌组织微阵列及PDX模型
内皮特异性Slit2敲除(ecSLIT2 KO)对转移的影响 肿瘤条件培养基中RNA(尤其是dsRNA)对内皮SLIT2的诱导作用 TLR3信号通路在SLIT2诱导中的必要性(TLR3 KO和抑制剂) 肿瘤细胞ROBO1在SLIT2诱导迁移和血管内渗中的功能 poly(I:C)处理对CTC和血管SLIT2表达的影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定由高转移性肿瘤诱导的内皮细胞表达的促转移因子。
使用RiboTag技术标记内皮细胞核糖体,免疫沉淀后进行RNA-seq,比较B16F10(高转移)和B16F0(低转移)肿瘤的内皮基因表达差异;用qPCR和免疫荧光验证SLIT2在内皮中的上调;用条件培养基处理内皮细胞确认其诱导作用。
确定内皮SLIT2是否促进癌症转移。
利用内皮特异性诱导敲除(Cdh5-CreERT2;Slit2fl/fl)小鼠,在多种肿瘤模型中评估SLIT2缺失对转移的影响,包括自发乳腺肿瘤模型(MMTV-PyMT)、原位移植4T1和皮下LLC模型;统计肺转移结节数和生存期。
探讨内皮SLIT2是否通过促进肿瘤细胞迁移和血管内渗来驱动转移,并鉴定可能的受体。
利用transwell迁移实验检测重组SLIT2对肿瘤细胞趋化性的影响;使用shRNA敲低肿瘤细胞中的Robo1,观察其对SLIT2导向迁移的影响;通过检测循环肿瘤细胞(CTC)评估血管内渗。
确定肿瘤细胞释放的何种信号诱导内皮SLIT2表达。
对4T1条件培养基进行不同大小过滤(10和50 kDa)、RNase和DNase处理,评估对内皮SLIT2诱导的影响;测试合成dsRNA poly(I:C)和TLR激动剂对内皮SLIT2的作用;使用TLR3敲除内皮细胞和药理学抑制剂验证TLR3必要性。
检验肿瘤细胞自身SLIT2的表达对转移的影响,并解释其与内皮SLIT2的相反作用。
通过MMTV-Cre介导的Slit2敲除(tuSLIT2 KO)在MMTV-PyMT肿瘤中敲除肿瘤SLIT2,观察转移表型;分析SLIT2启动子甲基化状态和基因表达。
评估内皮和肿瘤SLIT2表达差异及ROBO1表达与人类乳腺癌转移和预后的关联。
对人乳腺癌组织微阵列(TMA)进行SLIT2免疫染色,比较淋巴结阳性和阴性原发肿瘤的内皮SLIT2;分析原发肿瘤和转移淋巴结内皮SLIT2;利用公共数据集分析肿瘤SLIT2和ROBO1表达与预后的关系;在PDX模型和细胞系中验证。
寻找肿瘤细胞中导致内皮TLR3激活的dsRNA来源,并验证其与转移能力相关。
使用J2抗体免疫荧光检测肿瘤组织中的dsRNA水平;用RNA-seq分析细胞、条件培养基和血浆中ERV的表达;通过J2抗体免疫沉淀dsRNA后进行RNA-seq鉴定ERV序列。
探究临床在研的TLR3激动剂poly(I:C)是否可能通过SLIT2轴促进肿瘤转移。
在免疫缺陷NSG小鼠中,用poly(I:C)处理荷瘤小鼠,检测循环肿瘤细胞数量和肿瘤血管SLIT2表达;同时敲低肿瘤ROBO1,观察poly(I:C)作用是否依赖ROBO1。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Sigma | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | -- | |
| 两性霉素B | Lonza | -- | |
| MLEC培养基 | -- | -- | |
| 4-羟基他莫昔芬 | Sigma | -- | |
| 条件培养基处理 | Opti-MEM培养基 | Gibco | -- |
| RNase A | Ambion | -- | |
| DNase I | Worthington | -- | |
| 聚肌苷酸-聚胞苷酸 | Sigma | -- | |
| CU CPT 4a | Tocris | -- | |
| Dynasore水合物 | Sigma | -- | |
| CpG寡脱氧核苷酸 | Invivogen | -- | |
| RiboTag/RNA-seq | 抗HA磁珠 | Dynabeads, Invitrogen | -- |
| RNeasy Micro Plus试剂盒 | Qiagen | -- | |
| ScriptSeq RNA-Seq文库制备试剂盒 | Epicentre | -- | |
| TruSeq链式总RNA文库制备试剂盒 | Illumina | -- | |
| Western blot | 抗SLIT2抗体 | Abcam | ab134166 |
| 抗HSC70抗体 | Santa Cruz Biotechnology | B-6 | |
| 抗Flag抗体 | Cell Signaling | 2368S | |
| 磷酸化p44/42 MAPK抗体 | Cell Signaling | 4370S | |
| p44/42 MAPK抗体 | Cell Signaling | 4695S | |
| 免疫荧光 | 抗endonucin抗体 | Santa Cruz | SC-65495 |
| 抗SLIT2抗体 | Proteintech | 20217-1-AP | |
| 抗裂解caspase 3抗体 | Cell Signaling | 9661S | |
| 抗MCP1抗体 | Thermo Fisher Scientific | MA5-17040 | |
| 抗netrin 1抗体 | Novus Biologicals | NB100-1605 | |
| 抗SDF1抗体 | Proteintech | 17402-1-AP | |
| J2抗体 | Scicons | 10010200 | |
| 动物实验 | 基质胶 | Corning | -- |
| 他莫昔芬 | Sigma | -- | |
| D-荧光素 | Perkin Elmer | P/N122796 | |
| Hoechst染料 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 迁移实验 | 重组小鼠SLIT2 | R&D Systems | -- |
| Transwell小室 | Falcon | -- | |
| RNA提取 | Norgen总RNA提取试剂盒 | Norgen Biotek | -- |
| DNeasy血液和组织试剂盒 | Qiagen | 69506 | |
| qPCR | Fast SYBR Green预混液 | Thermo Fisher | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 肿瘤细胞系来源(4T1、B16F10等),内皮细胞分离和永生化方法,培养基配方(MLEC、D10F),他莫昔芬处理浓度(500 nM) 阅读提示:Methods:Endothelial and tumour cell culture |
| 条件培养基处理 | 肿瘤细胞接种密度(1×10^6),处理时间(12小时),过滤孔径(10 kDa、50 kDa),RNase/DNase处理浓度,poly(I:C)浓度(2.5 μg/ml),CU CPT 4a浓度(27 μM),dynasore浓度(5 μM) 阅读提示:Methods:Conditioned medium treatment of endothelial cells |
| RiboTag分析 | 他莫昔芬注射剂量和时间,肿瘤接种数量(100,000个细胞),肿瘤生长时间(12天),IP缓冲液成分 阅读提示:Methods:Immunoprecipitation of polysomes and RiboTag profiling |
| 小鼠模型 | 肿瘤细胞注射量(4T1、LLC各100,000),注射部位(乳腺脂肪垫、皮下),肿瘤切除体积(4T1约200 mm³,LLC约150 mm³),肺转移评估时间(4T1手术后19天,LLC术后20天) 阅读提示:Methods:Tumour growth, metastasis and circulating tumour cell assays |
| 迁移实验 | 重组SLIT2浓度(100、300 ng/ml),transwell孔径(3.0 μm),肿瘤细胞数(50,000),孵育时间(20小时) 阅读提示:Methods:Tumour migration assays and endothelial and tumour cell chemotaxis assays |
| 血管内渗检测 | 4T1-Luc-zsGreen构建,肿瘤生长天数(32天),血液采集和红细胞裂解步骤 阅读提示:Methods:Tumour growth, metastasis and circulating tumour cell assays |
| TLR3验证 | TLR3敲除小鼠品系,CU CPT 4a浓度(27 μM),RNase A浓度(25 μg/ml) 阅读提示:Methods:Conditioned medium treatment of endothelial cells;Extended Data Fig. 1 |