PCSK9缺失抑制肿瘤生长
验证PCSK9缺失对肿瘤生长的影响及其免疫依赖性。
使用CRISPR/Cas9在B16F10、4T1、MC38和CT26细胞中敲除PCSK9,皮下接种至同系小鼠,观察肿瘤大小和生存期。在免疫缺陷小鼠(NCG和Rag1-/-)中重复实验。
Inhibition of PCSK9 potentiates immune checkpoint therapy for cancer
研究包含体外细胞实验、小鼠肿瘤模型、患者样本数据分析等多个独立证据层级,并明确进行了功能验证和机制验证。
小鼠黑色素瘤细胞系B16F10 小鼠乳腺癌细胞系4T1 小鼠结肠癌细胞系MC38和CT26 同系小鼠移植瘤模型
使用CRISPR/Cas9敲除PCSK9的四种鼠源肿瘤细胞系(B16F10、4T1、MC38、CT26) 肿瘤细胞皮下注射剂量:1×10^5细胞/鼠 抗PD1抗体处理方案:100 μg/鼠,在肿瘤接种后第5天和第8天腹腔注射 抗PCSK9抗体(evolocumab或alirocumab)处理方案:200 μg/鼠,在接种后第3、5、8、11天腹腔注射 免疫细胞耗竭方案:抗CD4、抗CD8、抗NK1.1抗体,特定剂量和时间点
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证PCSK9缺失对肿瘤生长的影响及其免疫依赖性。
使用CRISPR/Cas9在B16F10、4T1、MC38和CT26细胞中敲除PCSK9,皮下接种至同系小鼠,观察肿瘤大小和生存期。在免疫缺陷小鼠(NCG和Rag1-/-)中重复实验。
验证PCSK9缺失或抗体抑制能否增强抗PD1免疫检查点治疗的疗效。
将PCSK9敲除的肿瘤细胞接种至同系小鼠,用抗PD1单抗治疗;或用抗PCSK9抗体(evolocumab或alirocumab)单独或联合抗PD1处理,观察肿瘤生长和生存期。
评估PCSK9缺失对肿瘤微环境中免疫细胞浸润和功能的影响。
通过免疫荧光和流式细胞术分析肿瘤内CD45+、CD8+、CD4+、γδT、NK细胞等免疫细胞的数量和功能状态,并检测IFNγ和Granzyme B表达。
分析PCSK9缺失对肿瘤浸润T细胞受体多样性和克隆扩增的影响。
提取肿瘤组织DNA,进行TCRB CDR3测序,分析TCR总数、独特TCR数、克隆性等。
验证PCSK9缺失增强CTL对肿瘤细胞的杀伤能力。
用OT-1 T细胞体外共培养实验,评估PCSK9缺失对OVA特异性CTL杀伤肿瘤细胞的影响。
阐明PCSK9调节MHC I表面表达的分子机制。
检测PCSK9缺失或抗体处理后MHC I表面表达变化;通过Co-IP、免疫荧光和Western blot分析PCSK9与MHC I的相互作用及溶酶体降解途径。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Sigma | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 基因编辑 | LentiCRISPRv2载体 | Addgene | -- |
| BsmBI限制酶 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 嘌呤霉素 | -- | -- | |
| G418 | -- | -- | |
| 蛋白质检测 | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Sigma | -- | |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| ECL发光液 | -- | -- | |
| 流式细胞术 | FITC标记抗小鼠CD45抗体 | Biolegend | 103108 |
| Pacific Blue标记抗小鼠CD3ε抗体 | Biolegend | 100334 | |
| AF647标记抗小鼠CD4抗体 | Biolegend | 100424 | |
| APC/Fire750标记抗小鼠CD8a抗体 | Biolegend | 100766 | |
| PE标记抗小鼠NK1.1抗体 | Biolegend | 108707 | |
| PE标记抗小鼠Foxp3抗体 | Biolegend | 126403 | |
| APC标记抗小鼠TCRγδ抗体 | Biolegend | 118115 | |
| PE标记抗小鼠Gzmb抗体 | Biolegend | 372207 | |
| AF647标记抗小鼠IFNγ抗体 | Biolegend | 505816 | |
| FITC标记抗人HLA-A2抗体 | Biolegend | 343322 | |
| FITC标记抗小鼠H-2Kb/Db抗体 | Biolegend | 114605 | |
| PE标记抗小鼠H-2Kb/Db抗体 | Biolegend | 114608 | |
| FITC标记抗小鼠H-2Kd/Dd抗体 | Biolegend | 114706 | |
| PE/Cy7标记抗小鼠H-2Kb结合SIINFEKL抗体 | Biolegend | 141607 | |
| AF647标记抗小鼠PD1抗体 | Biolegend | 135229 | |
| PE标记抗小鼠TIGIT抗体 | Biolegend | 142103 | |
| PE标记抗小鼠CTLA4抗体 | Biolegend | 106305 | |
| PE标记抗小鼠TNFα抗体 | Biolegend | 506305 | |
| APC标记抗小鼠I-A/I-E抗体 | Biolegend | 107613 | |
| PE/Cy7标记抗小鼠PD-L1抗体 | Biolegend | 124313 | |
| TruStain FcX(抗小鼠CD16/32) | Biolegend | 101319 | |
| APC标记抗小鼠TCRVβ5.1/5.2抗体 | Biolegend | 139505 | |
| PE/Cy7标记抗Cas9单克隆抗体 | ThermoFisher | 25-6499-82 | |
| 免疫荧光 | 纯化抗小鼠CD45抗体 | Biolegend | 103101 |
| 纯化大鼠抗小鼠CD8a抗体 | BD | 550281 | |
| 蛋白质检测 | 小鼠/大鼠PCSK9抗体 | R&D Systems | AF3985 |
| 小鼠/人/大鼠PCSK9抗体 | Proteintech | 55206-1-AP | |
| 小鼠LDLR抗体 | R&D | AF2255 | |
| 抗HLA I类ABC抗体 | Proteintech | 15240-1-AP | |
| 免疫沉淀 | 抗Flag抗体 | Sigma | F1804 |
| 抗HA标签抗体 | Cell Signaling Technology | 3724T | |
| 蛋白质检测 | LAMP2抗体 | Proteintech | 66301-1-lg |
| Pan-cadherin抗体 | Novus Biologicals | NB200-592 | |
| GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-Ig | |
| Actin单克隆抗体 | ThermoFisher | MA5-11869 | |
| 分子克隆 | pLEX-MCS载体 | Thermo Fisher | -- |
| Gibson组装试剂盒 | New England Biolabs | -- | |
| 动物实验 | evolocumab(依洛尤单抗) | Amgen | -- |
| alirocumab(阿利西尤单抗) | Sanofi/Regeneron | -- | |
| 抗PD1抗体(克隆RMP1-14) | BioXcell | -- | |
| 人IgG2同型对照 | BioXcell | -- | |
| 免疫耗竭 | 抗CD4抗体(克隆GK1.5) | BioXcell | -- |
| 抗CD8β抗体(克隆53-5.8) | BioXcell | -- | |
| 抗NK1.1抗体(克隆PK136) | BioXcell | -- | |
| MHC I表达分析 | 重组PCSK9蛋白 | Prospec-Tany TechoGene Ltd | -- |
| 牛血清白蛋白 | Sigma | -- | |
| 肿瘤浸润淋巴细胞分析 | DNase I | Sigma | -- |
| 胶原酶P | Sigma | -- | |
| Live/Dead可固定Aqua染料 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| RT-qPCR | RNeasy Mini试剂盒 | Qiagen | -- |
| Superscript II逆转录酶 | Invitrogen | -- | |
| QuantiTest SYBR Green PCR预混试剂盒 | Qiagen | -- | |
| TCR测序 | DNeasy血液和组织试剂盒 | Qiagen | -- |
| OT-1 T细胞培养 | RPMI1640培养基 | Sigma-Aldrich | -- |
| 胎牛血清 | Corning | -- | |
| 青霉素-链霉素 | ThermoFisher Scientific | -- | |
| SIINFEKL肽 | GenScript | -- | |
| 小鼠重组IL2 | ThermoFisher Scientific | -- | |
| 细胞共培养分析 | 蔡司Axio Observer.Z1荧光显微镜 | Carl Zeiss Microscopy GmbH | -- |
| 细胞分离 | 溶酶体富集试剂盒 | Thermo Scientific | -- |
| 免疫荧光 | Lyso-Tracker(深红色) | Thermo Fisher | -- |
| 麦胚凝集素(CF488 WGA) | -- | -- | |
| DAPI | Vector Laboratories | -- | |
| 免疫共沉淀 | Protein A/G琼脂糖珠 | Santa Cruz Biotechnology | -- |
| 蛋白质降解分析 | 巴佛洛霉素A1 | Sigma | -- |
| 统计分析 | GraphPad Prism 6 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源:B16F10、CT26、4T1、MDA-MB-231购自Duke University School of Medicine的Cell Culture Facility;MC38购自Kerafast;293T购自ATCC。培养基:DMEM+10%FBS+1%青霉素/链霉素。 阅读提示:Methods 细胞系部分 |
| 基因敲除 | sgRNA序列:针对小鼠PCSK9、人PCSK9、小鼠LDLR、小鼠H2-K1的sgRNA序列。敲除方法:LentiCRISPRv2载体,嘌呤霉素筛选浓度(B16F10/CT26/MC38/MDA-MB-231: 1μg/ml, 4T1: 4μg/ml),筛选时间7-10天。 阅读提示:Methods CRISPR/Cas9介导的基因敲除部分 |
| 肿瘤生长实验 | 小鼠品系:C57BL/6J、Balb/c、NCG、Rag1-/-、LDLR-/-、OT-1;年龄6-8周;接种细胞数:1×10^5;注射部位:侧腹皮下。 阅读提示:Methods 肿瘤生长实验部分 |
| 抗PD1和抗PCSK9抗体治疗 | 抗PD1剂量:100 μg/鼠,接种后第5、8天;抗PCSK9抗体剂量:200 μg/鼠,接种后第3、5、8、11天;给药途径:腹腔注射。 阅读提示:Methods 肿瘤生长实验部分及图2图注 |
| 免疫细胞耗竭 | 抗CD4、抗CD8、抗NK1.1给药剂量和时间:分别在-3、0、3、8天给药150、100、200 μg。 阅读提示:Methods 淋巴细胞耗竭部分 |