体外抗病毒活性筛选
评估JNJ-1802对DENV以及相关黄病毒和其他病毒的抑制活性与选择性。
在Vero、Huh-7、C6/36、THP-1/DC-SIGN细胞中测定JNJ-1802对DENV-2/16681/eGFP和DENV-2/RL的EC50/EC90,并测试对多种DENV临床分离株及黄病毒和其他RNA/DNA病毒的活性,同时测量细胞毒性。
Blocking NS3-NS4B interaction inhibits dengue virus in non-human primates
包含体外抗病毒活性与耐药筛选、免疫共沉淀机制验证、小鼠四个血清型体内疗效、非人灵长类药效与药代动力学等多个独立证据层级。
AG129小鼠感染模型 恒河猴(非人灵长类)感染模型 Vero、Huh-7、C6/36、THP-1/DC-SIGN细胞系
JNJ-1802剂量:0.01、0.18、3 mg/kg/天(DENV-2 NHP),6 mg/kg/天(DENV-1 NHP)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估JNJ-1802对DENV以及相关黄病毒和其他病毒的抑制活性与选择性。
在Vero、Huh-7、C6/36、THP-1/DC-SIGN细胞中测定JNJ-1802对DENV-2/16681/eGFP和DENV-2/RL的EC50/EC90,并测试对多种DENV临床分离株及黄病毒和其他RNA/DNA病毒的活性,同时测量细胞毒性。
鉴定JNJ-1802作用靶点并评估耐药屏障。
在Vero细胞中梯度增加JNJ-1802浓度传代DENV-2,通过全基因组测序鉴定NS4B中的耐药突变,并在亚基因组复制子中验证突变对JNJ-1802敏感性的影响。
验证JNJ-1802是否通过阻断NS3-NS4B相互作用发挥机制。
在稳定表达NS2B-NS3的Huh-7细胞中瞬时表达NS4A-2K-NS4B野生型或突变体,通过免疫共沉淀和Western blot检测JNJ-1802对NS3-NS4B相互作用的影响,并比较不同时间点加药效果。
评估JNJ-1802在AG129小鼠中对四种DENV血清型的预防和治疗效果。
在AG129小鼠中建立DENV-2高/低病毒载量模型、致死模型和延迟治疗模型,测定病毒RNA载量和生存率;同时使用DENV-1、DENV-3、DENV-4感染模型评估广谱抗病毒活性。
验证JNJ-1802在非人灵长类中对DENV-1和DENV-2的预防效果。
恒河猴预防性口服JNJ-1802后感染DENV-2或DENV-1,通过RT-qPCR检测病毒RNA,ELISA检测NS1和IgM/IgG,TCID50测定感染性病毒滴度,并分析药代动力学参数。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | Eagle最低必需培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 杜氏改良Eagle培养基 | -- | -- | |
| RPMI培养基 | Lonza | -- | |
| Leibovitz L-15培养基 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 潮霉素B | Roche | -- | |
| 化合物处理 | JNJ-1802 | -- | -- |
| 聚乙二醇400 | -- | -- | |
| Western blot | 抗GAPDH抗体 (G-9) | Santa Cruz Biotechnology | sc-365062 |
| 抗β-肌动蛋白抗体 (AC-15) | Sigma-Aldrich | A5441 | |
| 免疫共沉淀 | 抗HA琼脂糖珠 | Sigma-Aldrich | A2095 |
| Western blot | 抗HA.11表位标签抗体 (16B12) | BioLegend | 901502 |
| 抗NS3多克隆抗体 | -- | -- | |
| 抗NS4B多克隆抗体 | -- | -- | |
| 动物实验 | 抗黄病毒群体单克隆抗原抗体 (4G2) | Millipore/Merck | MAB10216 |
| ELISA | 登革病毒IgM捕获DxSelect ELISA检测试剂盒 | Focus Diagnostics | EL1500M |
| 登革病毒IgG DxSelect ELISA检测试剂盒 | Focus Diagnostics | EL1500G | |
| NS1检测 | Alere Panbio登革热早期ELISA试剂盒 | Alere | 01PE40 |
| 病毒RNA提取 | QIAamp病毒RNA小提试剂盒 | Qiagen Benelux | -- |
| RT-qPCR | Brilliant II QRT-PCR核心试剂盒(一步法) | Agilent | -- |
| Superscript III Platinum一步法定量RT-PCR试剂盒 | Invitrogen, Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 细胞培养 | L-谷氨酰胺 | -- | -- |
| 庆大霉素 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 杀稻瘟菌素 | -- | -- | |
| 嘌呤霉素 | -- | -- | |
| 非必需氨基酸 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| HEPES缓冲液 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 病毒纯化 | Minimate切向流过滤系统 | Pall Life Sciences | -- |
| 细胞活力检测 | ATPLite试剂盒 | PerkinElmer | -- |
| MTS/PMS试剂 | Promega | -- | |
| 数据采集 | QuantStudio 12K Flex实时荧光定量PCR系统 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Bio-Rad CFX Connect实时荧光定量PCR仪 | Bio-Rad | -- | |
| ABI 7500DX Fast实时荧光定量PCR仪 | Applied Biosystems | -- | |
| 病毒滴度测定 | Bio-Rad iMark酶标仪 | Bio-Rad | -- |
| 药代动力学分析 | API 5500液相色谱-质谱联用系统 | Applied Biosystems | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源和培养基成分 阅读提示:Methods中的Cells部分 |
| 体外抗病毒实验 | 病毒株、细胞系、JNJ-1802浓度范围、培养时间、检测方法 阅读提示:Methods中的Antiviral assays部分 |
| 耐药筛选 | JNJ-1802浓度梯度、传代次数、传代方式、测序方法 阅读提示:Methods中的DENV-2 in vitro resistance selection experiments部分 |
| 免疫共沉淀 | 转染质粒、JNJ-1802浓度、处理时间、抗体、检测方法 阅读提示:Methods中的Immunoprecipitation experiments部分 |
| 小鼠感染实验 | AG129小鼠品系、年龄、性别、病毒感染株和剂量、给药方案(剂量、频率、时间)、检测时间点 阅读提示:Methods中的DENV-2 infection studies in mice和DENV-1, DENV-3 and DENV-4 infection in mice部分 |
| 非人灵长类感染实验 | 恒河猴来源、年龄、体重、病毒感染株和剂量、给药方案(剂量、频率、时间)、检测时间点 阅读提示:Methods中的DENV-2 study in NHPs和DENV-1 study in NHPs部分 |
| 药代动力学分析 | 给药剂量、给药途径、采样时间点、分析方法 阅读提示:Methods中的Pharmacokinetics studies部分 |