饮食诱导的体重变化评估
比较去除不同氨基酸对小鼠体重的影响,确定半胱氨酸缺乏的特异性效应。
给Cse+/−和Cse−/−小鼠饲喂去除单个必需氨基酸或半胱氨酸的饮食,监测体重变化和食物摄入。
Unravelling cysteine-deficiency-associated rapid weight loss
包含小鼠模型(Cse-KO)、饮食干预、代谢笼、组织学、RNA-seq、代谢组学、13C-葡萄糖追踪和AAV介导的基因回复实验等多项独立证据层。
Cse基因敲除小鼠(Cse-/-) Cse杂合小鼠(Cse+/-) C57BL/6小鼠
确认Cse-/-小鼠在无半胱氨酸饮食下的基因型效应 无半胱氨酸饮食的持续时间(如2天、7天) 热量限制(CR)的对照和每日食物摄入量 体重、脂肪含量和代谢参数的测量 血清GDF15和FGF21水平的测定
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
比较去除不同氨基酸对小鼠体重的影响,确定半胱氨酸缺乏的特异性效应。
给Cse+/−和Cse−/−小鼠饲喂去除单个必需氨基酸或半胱氨酸的饮食,监测体重变化和食物摄入。
评估半胱氨酸缺乏引起的体重下降的性质(脂肪 vs 肌肉)及能量代谢变化。
使用代谢笼、DEXA扫描、组织学染色等方法检测呼吸交换率、脂肪含量、脂肪细胞形态、肌肉和肝脏组织学等。
探究半胱氨酸缺乏引起的分子机制,特别是应激反应相关通路。
对肝脏、肌肉和脂肪组织进行RNA-seq分析,并通过Western blot检测相关蛋白磷酸化水平。
验证CoA减少导致的代谢低效,并追踪葡萄糖碳流向。
使用代谢组学分析尿液和肝脏代谢物,并用13C-葡萄糖进行体内示踪。
验证GDF15和FGF21在体重下降中的作用以及肝脏CSE表达的保护效应。
使用Gdf15-KO和Fgf21-KO小鼠观察体重下降;通过AAV8-TBG-CSE在肝脏过表达CSE观察对表型的拯救。
证实半胱氨酸缺乏导致CoA下降,并评估CoA下降对能量代谢的影响。
测量肝脏和肌肉中CoA水平;在饮用水中仅提供半乳糖或葡萄糖作为能量来源,观察小鼠存活和耗氧量;给予B5缺乏饮食后观察体重恢复。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | Seahorse XFe24分析仪 | Seahorse | -- |
| 基因分型 | Cse基因敲除小鼠 | -- | -- |
| 饮食处理 | 5CC7纯化饲料 | TestDiet | -- |
| D-半乳糖 | Sigma-Aldrich | G0750 | |
| D-葡萄糖 | Sigma-Aldrich | G8270 | |
| 组织处理 | cOmplete蛋白酶抑制剂 | Roche | -- |
| PhosSTOP磷酸酶抑制剂 | Roche | -- | |
| 组织匀浆 | IKA Ultra Truemax T8匀浆器 | IKA | -- |
| 代谢物检测 | 谷胱甘肽检测试剂盒 | Cayman | 703002 |
| 辅酶A检测试剂盒 | Abcam | ab102504 | |
| 血清指标检测 | GDF15 ELISA试剂盒 | Abcam | ab216947 |
| FGF21 ELISA试剂盒 | R&D Systems | MF2100 | |
| 甘油三酯检测试剂盒 | Cayman | 10010303 | |
| 游离脂肪酸检测试剂盒 | Sigma-Aldrich | MAK466 | |
| RNA-seq | NEBNext Poly(A) mRNA磁分离模块 | NEB | E7490S |
| NEBNext Ultra文库制备试剂盒 | NEB | E7530S | |
| Illumina NextSeq 200测序仪 | Illumina | -- | |
| 蛋白质免疫印迹 | 抗p-eIF2α抗体 | Cell Signaling Technology | 3597 |
| 抗eIF2α抗体 | Cell Signaling Technology | 2103 | |
| 抗p-ACC抗体 | Cell Signaling Technology | 3661 | |
| 抗ACC抗体 | Cell Signaling Technology | 3662 | |
| 抗β-微管蛋白抗体 | Proteintech | 10068-1-AP | |
| 抗β-肌动蛋白-过氧化物酶抗体 | Sigma-Aldrich | A3854 | |
| 代谢组学 | 液相色谱-串联质谱 | Thermo Q Exactive HF | -- |
| ZIC-pHILIC色谱柱 | Millipore | -- | |
| 代谢组学氨基酸标准品混合物 | Cambridge Isotopes Laboratory | -- | |
| BeadBlaster匀浆器 | Benchmark Scientific | -- | |
| 组织化学 | Leica BOND聚合物精炼检测系统 | Leica | DS9800 |
| 免疫组化 | 抗UCP1抗体 | Cell Signaling Technology | 72298S |
| 抗CASP3抗体 | Cell Signaling Technology | 9579S | |
| 抗NQO1抗体 | Sigma-Aldrich | HPA007308 | |
| 抗NRF2抗体 | -- | -- | |
| 细胞分离 | Cell-Tak细胞粘附剂 | Corning | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | Cse-/-小鼠的基因型、性别、年龄、饲养温度 阅读提示:Methods - Mice |
| 饮食处理 | 无半胱氨酸饮食的成分、对照组饮食、热量限制与否 阅读提示:Methods - Diets |
| 体重和代谢测量 | 体重监测频率、时间点;代谢笼参数;脂肪含量测定方法 阅读提示:Results and Methods |
| 组织学和免疫组化 | 固定、包埋、切片厚度;抗体稀释比例;抗原修复条件 阅读提示:Methods - Histology and immunohistochemistry |
| 分子分析 | RNA-seq样本量和测序深度;Western blot抗体和稀释;代谢物提取和LC-MS方法 阅读提示:Methods - Sequencing, Western blotting, MS analysis |