SP140-RESIST通路调控干扰素mRNA稳定性与抗病毒免疫

SP140-RESIST pathway regulates interferon mRNA stability and antiviral immunity

作者信息Kristen C Witt, Adam Dziulko, Joohyun An, Filip Pekovic, Arthur Xiuyuan Cheng, Grace Y Liu, Ophelia Vosshall Lee, David J Turner, Azra Lari, Moritz M Gaidt, Roberto Chavez, Stefan A Fattinger, Preethy Abraham, Harmandeep Dhaliwal, Angus Y Lee, Dmitri I Kotov, Laurent Coscoy, Britt A Glaunsinger, Eugene Valkov, Edward B Chuong, Russell E Vance
PMID40500448
期刊Nature
发布时间2025-07
DOI10.1038/s41586-025-09152-2

摘要

I型干扰素对于抗病毒免疫至关重要,但其表达必须受到严格调控。保守的转录抑制因子SP140通过未知机制抑制干扰素-β的表达。本文报道,SP140并不直接抑制Ifnb1的转录,而是通过直接抑制一个先前未表征的、我们称之为RESIST的调节因子表达,从而负调控Ifnb1 mRNA的稳定性。RESIST通过拮抗由RNA结合蛋白TTP家族和CCR4-NOT去腺苷化酶复合物介导的Ifnb1 mRNA去稳定化,来促进Ifnb1 mRNA的稳定。SP140定位于称为核体的点状结构中,这些结构在细胞核内沉默DNA病毒基因表达中具有重要作用。与此观察一致,我们发现SP140抑制γ疱疹病毒MHV68的复制。SP140的抗病毒活性独立于其调控Ifnb1的能力。我们的结果确立了SP140兼具抗病毒和干扰素调控的双重功能。我们提出,SP140和RESIST参与了抗病毒效应因子触发的免疫。

实验方法

产品清单

名称品牌货号
Alt-R CRISPR-Cas9 crRNAIDT--
Alt-R HDR供体寡核苷酸IDT--
QuickExtract裂解缓冲液----
Q5 2× PCR预混液----
Phusion GC富集PCR组分----
FastAP----
ExoI----
Snapgene--v.7.0.1
Lumikine Xpress mIFN-β 2.0试剂盒----
Omega Biotek Total RNA II试剂盒Omega Biotek--
QiagenQiagen79254
RQ1PromegaM6101
Superscript III逆转录酶Invitrogen18080093
Power SYBR Green PCR预混液Thermo Fisher Scientific43-676-59
4-硫尿苷Cayman Chemicals16373
N-乙基马来酰亚胺Sigma-Aldrich04259-5G
RNAClean磁珠Beckman CoulterA63987
ProtoScript II逆转录酶----
TURBO DNaseThermo Fisher ScientificAM2238
QIAseq FastSelect–HMR rRNA去除试剂盒Qiagen--
NEBNext RNA Ultra试剂盒NEB--
Illumina HiSeq流动池Illumina--
KAPA HyperPrep试剂Roche--
Illumina NovaSeq流动池Illumina--
Ampure XP磁珠Beckman Coulter--
Epicypher CUTANA ChIC/CUT&RUN试剂盒Epicypher14-1048
Epicypher CUTANA CUT&RUN文库制备试剂盒Epicypher14-1001
Branson Ultrasonics Sonifier SFX550超声波破碎仪Branson UltrasonicsSFX550
HisTrap层析柱Cytiva--
Superdex 200 26/600层析柱Cytiva--
HiLoad Superdex 200 16/600层析柱Cytiva--
StrepTrap XT层析柱Cytiva--
StrepTactin Sepharose树脂Cytiva28935599
Lipofectamine 2000----
Infusion试剂Takara--
Retronectin处理板Takara--
抗HA磁珠Thermo Fisher Scientific88836
4–12% Bis-Tris蛋白质凝胶Invitrogen--
PVDF膜----
Odyssey Licor PBS封闭缓冲液----
抗Flag M2琼脂糖珠Sigma AldrichM8823
Alt-R Cas9电穿孔增强剂IDT1075916
Lonza P3缓冲液LonzaV4XP-3032
Lonza 4D-Nucleofector核心单元LonzaAAF-1002B
Primestar PCR试剂----
HiScribe T7高产RNA合成试剂盒NEB--
Superdex 200 increase 10/300 GL层析柱----
SYBR GoldThermo Fisher Scientific--
FiJi--79
BD Cytofix Cytoperm试剂盒BD--
FlowJo----
Zeiss LSM 880 NLO AxioExaminer显微镜Zeiss--
Imaris文件转换器--v.10.0.1
Imaris拼接器--v.9.9.1
GraphPad Prism--v.10.0.2