检测CK2α'在疾病中的表达变化
明确CK2α'在tau蛋白病中是否特异性升高。
分析Allen脑图谱RNA-seq数据,检测人额叶皮层FTD样本和PS19小鼠海马中CK2α'蛋白和mRNA水平,并定位表达细胞类型。
Protein kinase CK2α' as a dual modulator of neuroimmune signaling and synaptic dysfunction in tauopathy
包含体外细胞实验(N2a)、原代神经元、PS19小鼠模型、人类样本、RNA-seq、电生理和行为学等,并有功能验证(siRNA、单倍剂量不足)和机制验证。
Neuro-2a细胞转染Tau-P301L-EGFP 原代皮层神经元转染Tau-P301L-EGFP PS19 tau蛋白病小鼠模型 PS19;CK2α'单倍剂量不足小鼠 人类痴呆患者额叶皮层样本
CK2α'特异性高表达于PS19小鼠海马神经元和小胶质细胞(Figure 1) siCK2α'降低N2a细胞Tau-P301L-EGFP中AT8水平,而siCK2α无效(Figure 2) PS19;CK2α'单倍剂量不足小鼠在症状期海马和皮层AT8、AT100阳性面积降低(Figure 3) PS19;CK2α'单倍剂量不足小鼠小胶质细胞CD68和Clec7a水平降低,PSD-95吞噬减少(Figure 6) PS19;CK2α'单倍剂量不足小鼠LTP改善,巴恩斯迷宫空间记忆恢复(Figure 7, 8)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
明确CK2α'在tau蛋白病中是否特异性升高。
分析Allen脑图谱RNA-seq数据,检测人额叶皮层FTD样本和PS19小鼠海马中CK2α'蛋白和mRNA水平,并定位表达细胞类型。
验证敲低CK2α'是否能特异性地减少病理tau的磷酸化。
在N2a细胞中转染siRNA敲低CK2α或CK2α',再转染Tau-P301L-EGFP,检测AT8水平。
测定CK2α'基因部分缺失能否减轻PS19小鼠的tau病理。
将PS19小鼠与CK2α'+/-小鼠杂交,获得4种基因型,在前驱期和症状期分析AT8、AT100和总tau的免疫组化和免疫印迹。
揭示CK2α'减少引起的转录变化是否涉及神经免疫和突触相关通路。
对7月龄小鼠海马进行RNA-seq,分析差异表达基因、WGCNA模块和通路富集。
测定CK2α'缺失是否减轻小胶质细胞反应性和吞噬活性。
通过Iba1染色计数小胶质细胞,分析形态,检测CD68、Clec7a表达,以及神经元标记PSD-95小胶质细胞吞噬。
测定CK2α'缺失是否改善突触密度、突触可塑性和记忆行为。
免疫染色检测VGlut1和PSD-95共定位;急性脑片记录LTP;进行巴恩斯迷宫测试。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| siRNA转染 | DharmaFECT 1转染试剂 | Horizon Discovery | -- |
| 质粒转染 | jetOptimus转染试剂 | Polyplus-transfection | -- |
| siRNA | 靶向CK2α'的siRNA | Qiagen | -- |
| 靶向CK2α的siRNA | Qiagen | -- | |
| siRNA对照 | 乱序RNA | -- | -- |
| 免疫染色 | ProLong Gold封片剂 | -- | -- |
| 原代细胞培养 | Hibernate-A培养基 | BrainBits LLC | -- |
| NbActiv4培养基 | BrainBits | -- | |
| 质粒转染 | LTX DNA转染试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | #15338030 |
| 质粒 | DsRed质粒 | Clonetech | -- |
| 免疫印迹 | Criterion TGX无染凝胶 | BioRad | -- |
| SuperSignal化学发光底物 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 抗CK2α'抗体 | Novus | NB100-379 | |
| 抗CK2α抗体 | Abcam | ab76040 | |
| 抗Clec7a抗体 | invivoGen | mabg-mdect | |
| 抗AT8抗体 | Invitrogen/Thermo Fisher Scientific | MN1020 | |
| 抗AT100抗体 | Invitrogen/Thermo Fisher Scientific | MN1060 | |
| 抗PHF1抗体 | -- | RRID: AB_2315150 | |
| 抗Tau-5抗体 | Abcam | ab80579 | |
| 抗Actin抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-8432 | |
| 抗GAPDH抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-365062 | |
| 细胞因子检测 | 小鼠细胞因子蛋白组芯片 | R&D Systems | ARY006 |
| 组织裂解 | Halt蛋白酶抑制剂混合物/磷酸酶抑制剂 | Fisher Scientific | -- |
| Triton X-100 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 免疫组化 | 阿佛丁(三溴乙醇) | -- | -- |
| OCT包埋剂 | Tissue-Tek; Sakura Finetek USA | -- | |
| 免疫荧光 | 抗GFAP抗体 | Millipore Sigma | AB5541 |
| 抗Iba1抗体(兔) | Fujifilm Wako | 019-19741 | |
| 抗Iba1抗体(山羊) | Fujifilm Wako | 011-27991 | |
| 抗NeuN抗体 | MilliporeSigma | MAB377 | |
| 抗PSD-95抗体 | Invitrogen/Thermo Fisher Scientific | 51-6900 | |
| 抗VGlut1抗体 | MilliporeSigma | AB5905 | |
| DAB染色 | Tris-EDTA pH9.0抗原修复液 | Biolegend | 422703 |
| Rodent Decloaker抗原修复液 | Biocare Medical | RD913 | |
| VECTASTAIN Elite ABC-HRP试剂盒 | Vector Laboratories | -- | |
| Permount封片剂 | Fisher Scientific | -- | |
| 抗pTau(Ser202, Thr205)AT8抗体 | Invitrogen/Thermo Fisher Scientific | Mn1020 | |
| 抗pTau(Ser214, Thr212)AT100抗体 | Invitrogen/Fisher Scientific | MN1060 | |
| 抗CD68 [RM1031]抗体 | Abcam | ab303565 | |
| 原位杂交 | RNAscope原位杂交检测 | ACDbio | -- |
| 电生理 | pCLAMP 10.2软件 | Molecular Devices | RRID: SCR_011323 |
| 行为实验 | ANYmaze软件 | Stoelting Co. | -- |
| 巴恩斯迷宫 | San Diego Instruments | -- | |
| RNA提取 | RNeasy提取试剂盒 | Qiagen | -- |
| 逆转录 | SuperScript第一链合成系统 | Invitrogen/Thermo Fisher Scientific | -- |
| qPCR | qPCRBIO SyGreen Blue Mix Lo-ROZ | PCR Biosystems | 17-505B |
| LightCycler 480系统 | Roche | -- | |
| 显微成像 | Leica Stellaris 8共聚焦显微镜 | Leica Microsystems | -- |
| Echo Revolve R4 FL显微镜 | Echo Laboratories | -- | |
| EasyScan One扫描仪 | Motic | -- | |
| 图像分析 | Imaris软件 | Bitplane | -- |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Pierce, Thermo Fisher | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与siRNA处理 | 细胞系(N2a,ATCC CCL-131);siRNA浓度(25 nM);转染试剂(DharmaFECT 1);质粒(Tau-P301L-EGFP) 阅读提示:Materials and methods: Cell culture, Figure 2 legend |
| 原代神经元培养与转染 | 小鼠品系(P0-P2);海马或皮层组织;转染试剂(LTX);质粒(DsRed, Tau-P301S-EGFP);siRNA转染时间点(9 DIV和21 DIV) 阅读提示:Materials and methods: Primary cell culture |
| 小鼠模型构建 | PS19品系(Jackson #008169);CK2α'单倍剂量不足小鼠(Taconic TF3062);杂交方案;年龄分组(前驱期6-7月龄,症状期10-12月龄) 阅读提示:Materials and methods: Mouse lines, Figure 3 legend |
| tau病理检测 | 抗体(AT8, AT100);组织处理(灌注、固定、切片厚度);图像分析(阳性面积百分比) 阅读提示:Materials and methods: Immunohistochemistry, Figure 3 legend |
| RNA-seq | 样本量(n=4-7/组);基因型比例;差异分析软件(DESeq2);显著阈值(FDR≤0.05) 阅读提示:Materials and methods: RNA-Seq analysis |
| 小胶质细胞表型分析 | Iba1计数区域(CA1, CA3, DG);形态量化方法(骨架分析);CD68和Clec7a检测(抗体、定量方式) 阅读提示:Materials and methods: Immunohistochemistry, Image quantification, Figure 5-6 legends |
| 突触分析和电生理 | 突触标记(VGlut1, PSD-95);共定位分析(PunctaAnalyzer插件);LTP诱导协议(TBS参数);记录温度 阅读提示:Materials and methods: Synapse analysis, Electrophysiology, Figure 7 legend |
| 行为学测试 | 巴恩斯迷宫规格(20孔);光照强度(450-500 lx);训练天数(5天);每日试用次数(4次);探查试验条件 阅读提示:Materials and methods: Behavior, Figure 8 legend |