病例选择与样本收集
确定符合研究条件的HD患儿和对照组患儿的结肠组织样本。
通过内部数据库检索2015-2021年间接受一期拖出术的HD患儿,排除分期造口和全结肠/小肠HD;对照组为非HD但接受全层结直肠切除的患儿。收集福尔马林固定石蜡包埋结肠标本。
Tight Junction Defects in Aganglionic and Ganglionic Colon in Children With Hirschsprung Disease
病例对照研究,采用定量免疫荧光检测蛋白表达,有明确实验方法和结果,但未进行功能实验,属中等完整度。
先天性巨结肠患儿手术切除结肠组织 非HD患儿全层结直肠手术切除组织
样本类型:HD患儿手术切除结肠(有神经节和无神经节段),对照组为全层结直肠切除标本 样本量:HD组29例,对照组16例 检测方法:定量免疫荧光显微镜检测紧密连接蛋白表达 统计方法:Mann-Whitney检验比较组间差异,Wilcoxon符号秩检验比较个体内有/无神经节段差异
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定符合研究条件的HD患儿和对照组患儿的结肠组织样本。
通过内部数据库检索2015-2021年间接受一期拖出术的HD患儿,排除分期造口和全结肠/小肠HD;对照组为非HD但接受全层结直肠切除的患儿。收集福尔马林固定石蜡包埋结肠标本。
将结肠组织样本整合到组织芯片上,以便统一进行免疫荧光染色和分析。
从原始石蜡块中取3mm核心构建组织芯片,制备5μm切片用于免疫染色。
检测结肠组织中紧密连接蛋白的表达。
对组织切片进行漂白、封闭,然后使用针对紧密连接蛋白的特异性一抗和二抗进行染色,包括claudin-1、2、3、4、7、15、ZO-1、ZO-2和occludin,并用Hoechst染料标记细胞核。
定量评估组织中紧密连接蛋白的荧光强度。
使用荧光显微镜自动扫描整个组织标本,通过MetaMorph和CellProfiler进行图像处理和分析,测量每个感兴趣区域的荧光中位强度,并归一化到E-cadherin表达。
比较不同组间紧密连接蛋白表达的差异。
使用GraphPad Prism 9.0进行统计分析,比较HD组与对照组、有神经节段与无神经节段之间的蛋白表达差异。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 组织芯片构建 | Nationwide Histology | -- | -- |
| 免疫荧光染色 | 抗体稀释液 (Agilent) | Agilent | #S0809 |
| Hoechst 33342 | Biotium | -- | |
| 自动染色仪 (Dako) | Dako | -- | |
| 图像采集 | Leica DM4000荧光扫描显微镜 | Leica | -- |
| 图像分析 | MetaMorph 7.10 | -- | -- |
| CellProfiler | -- | -- | |
| 统计分析 | GraphPad Prism 9.0 | GraphPad Software, Inc. | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 样本收集 | 纳入标准:HD患儿需接受原发性拖出术(CPT代码45100、45120或44322);排除分期造口、全结肠或小肠HD;对照组为非HD需全层结直肠切除;排除囊性纤维化和炎症性肠病。 阅读提示:Materials and Methods, section 'Ethics statement and tissue collection' |
| 组织芯片构建 | 组织芯片使用3mm核心,切片厚度5μm;需要验证核心直径和切片厚度。 阅读提示:Materials and Methods, section 'Tissue Microarray Construction' |
| 免疫荧光染色 | 抗体浓度:文中未明确说明;漂白条件:24 mM NaOH含4.5% H2O2,孵育1小时;一抗孵育8小时,二抗孵育2小时;Hoechst 33342浓度0.1 ng/ml。 阅读提示:Materials and Methods, section 'Immunofluorescence staining' |
| 图像采集和定量 | 使用Leica DM4000显微镜和特定滤光片;阈值设定方法未明确说明;强度归一化到E-cadherin;分析设盲。 阅读提示:Materials and Methods, section 'Immunofluorescence imaging and quantification' |
| 统计分析 | 组间比较用Mann-Whitney检验,配对比较用Wilcoxon符号秩检验,显著性水平p<0.05。 阅读提示:Materials and Methods, section 'Statistical Analysis' |