鉴定BCL10结合位点
确定MALT1中与BCL10结合的具体区域,为抑制剂设计提供靶点。
通过共免疫沉淀(co-IP)和表面等离子体共振(SPR)分析MALT1片段与BCL10的结合,并通过点突变和丙氨酸扫描确定关键氨基酸残基。
A small-molecule inhibitor of BCL10-MALT1 interaction abrogates progression of diffuse large B cell lymphoma
包含体外蛋白结合、细胞功能验证、体内异种移植模型、药代动力学与毒性研究,并验证了机制。
ABC-DLBCL细胞系TMD8和OCI-Ly3 GCB-DLBCL细胞系OCI-Ly1、OCI-Ly7和BJAB Jurkat T细胞和原代小鼠脾细胞 小鼠异种移植模型(TMD8和OCI-Ly3)
BCL10结合位点突变(如V189R)对MALT1与BCL10结合的影响 M1i-124在体外和细胞内抑制BCL10-MALT1相互作用的IC50差异 M1i-124在细胞中诱导BCL10和MALT1蛋白降解的时间与剂量依赖性 M1i-124对ABC-DLBCL细胞增殖和凋亡的选择性影响 M1i-124在异种移植模型中的给药剂量与肿瘤生长抑制作用
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定MALT1中与BCL10结合的具体区域,为抑制剂设计提供靶点。
通过共免疫沉淀(co-IP)和表面等离子体共振(SPR)分析MALT1片段与BCL10的结合,并通过点突变和丙氨酸扫描确定关键氨基酸残基。
通过虚拟筛选识别能结合MALT1凹槽并抑制BCL10-MALT1相互作用的小分子化合物。
使用LibDock对300万化合物进行筛选,经Ro5过滤后获得9个候选物,其中7个可商业获得,通过凋亡和活力实验筛选出活性化合物M1i-124。
验证化合物能否同时抑制MALT1的两种功能活性。
在Jurkat T细胞和TMD8细胞中检测M1i-124对RelB、N4BP1裂解(蛋白酶活性)和IKKα/β磷酸化(支架活性)的影响。
探究化合物是否通过破坏BCL10-MALT1相互作用导致蛋白降解。
在TMD8和OCI-Ly3细胞中,用M1i-124处理72小时,检测BCL10和MALT1蛋白水平、mRNA水平的变化。
检测化合物对ABC-DLBCL细胞的选择性毒性。
用M1i-124处理ABC-DLBCL和GCB-DLBCL细胞,评估增殖、细胞周期、凋亡和活力。
评估M1i-124的体内抗肿瘤活性、药代动力学性质和安全性。
在NOD-SCID和NSG小鼠中建立TMD8和OCI-Ly3异种移植模型,腹腔注射M1i-124,监测肿瘤生长、体重及毒性指标;进行PK研究、CYP抑制筛选和28天毒性研究。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 蛋白相互作用检测 | Biacore 2000系统 | Cytiva | -- |
| Biacore T200 | Cytiva | -- | |
| 蛋白样品 | 全长GST-BCL10蛋白 | Abnova | H00008915-P01 |
| 全长GST标签MALT1蛋白 | Novus | H00010892-P01 | |
| 细胞培养与刺激 | CD3/CD28 | Stemcell Technologies | 10971 |
| Western blot裂解液 | RIPA裂解液 | Millipore | 20-188 |
| Western blot蛋白酶抑制剂 | 蛋白酶和磷酸酶抑制剂混合物 | Pierce | 78446 |
| Western blot | MG-132 | Cell Signaling Technology | 2194s |
| 异种移植实验 | Cultrex基底膜提取物 | R&D Systems | 3632-010-02 |
| 凋亡检测 | CellTrace Violet | Thermo Fisher Scientific | -- |
| SYTOX Blue | Thermo Fisher Scientific | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 蛋白结合实验 | MALT1片段和BCL10蛋白的纯化方法、浓度和缓冲液;SPR实验中固定蛋白和流动相条件 阅读提示:Methods中Surface plasmon resonance部分及Supplemental Methods |
| 细胞培养和化合物处理 | 细胞系来源、培养条件;化合物处理浓度、时间和溶剂(DMSO) 阅读提示:Methods中Cell lines and cell culture部分;相关图注 |
| Western blot检测 | 抗体种类、稀释比例;裂解液成分;MG-132处理时间 阅读提示:Methods中Western blotting部分;相关图注 |
| 异种移植模型 | 小鼠品系、细胞注射数量、基质胶用量、给药剂量和频率 阅读提示:Methods中Xenograft models of DLBCL部分;图8图注 |
| 统计分析 | 每组样本量(n)、统计方法、误差条类型(SEM) 阅读提示:Methods中Statistics部分及图注 |