ATG-101 的分子构建和结合特性验证
验证 ATG-101 能够同时结合 PD-L1 和 4-1BB,且对 PD-L1 具有更高亲和力。
通过 ForteBio 和 Biacore 测定 ATG-101 与 PD-L1 和 4-1BB 的结合动力学;流式细胞术检测与过表达 PD-L1 或 4-1BB 的细胞结合;竞争实验评估 PD-1/PD-L1 阻断能力。
ATG-101 Is a Tetravalent PD-L1×4-1BB Bispecific Antibody That Stimulates Antitumor Immunity through PD-L1 Blockade and PD-L1-Directed 4-1BB Activation
包括体外结合、报告基因、原代 T 细胞功能、多种小鼠肿瘤模型、单细胞测序和 NHP 毒性研究,层级完整且含机制验证。
MC38 结肠癌荷瘤 h4-1BB 敲入小鼠模型 B16F10 黑色素瘤荷瘤 h4-1BB 敲入小鼠模型 Pan02 胰腺癌荷瘤 h4-1BB 敲入小鼠模型 MC38 肿瘤进展后转用 ATG-101 的获得性耐药模型
h4-1BB 敲入小鼠的品系来源(北京百奥赛图或上海南方模式生物) MC38 模型中肿瘤起始体积(60 mm3 或 239 mm3)及给药方案(剂量和频率) 体外 4-1BB 激活实验中 PD-L1 阳性细胞的存在及 PD-L1 表达水平 NHP 毒性研究中 ATG-101 的给药剂量(10、50、100 mg/kg) 计算模型中预测的最佳生物剂量约 2 mg/kg
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证 ATG-101 能够同时结合 PD-L1 和 4-1BB,且对 PD-L1 具有更高亲和力。
通过 ForteBio 和 Biacore 测定 ATG-101 与 PD-L1 和 4-1BB 的结合动力学;流式细胞术检测与过表达 PD-L1 或 4-1BB 的细胞结合;竞争实验评估 PD-1/PD-L1 阻断能力。
验证 ATG-101 是否通过 PD-L1 交联依赖方式激活 4-1BB 信号并增强 T 细胞功能。
使用 NF-κB 荧光素酶报告基因实验检测 4-1BB 信号激活;将 ATG-101 与 PD-L1 阳性细胞和 T 细胞共培养,检测 IL2、IFNγ 和 TNFα 释放;用反复刺激诱导 T 细胞耗竭并测试 ATG-101 的恢复作用。
评估 ATG-101 在多种同系小鼠肿瘤模型中的抗肿瘤活性,包括对抗 PD-L1 耐药或难治的模型。
在 h4-1BB 敲入小鼠中建立 MC38、B16F10、Pan02 和 EL-4 肿瘤模型,给予 ATG-101 或其他对照抗体,监测肿瘤生长和生存期。
分析 ATG-101 治疗对肿瘤微环境中免疫细胞组成和功能的影响。
通过流式细胞术分析肿瘤浸润淋巴细胞(TIL)中 CD8+ T 细胞、Treg、效应记忆 T 细胞等;使用单细胞 RNA 测序(scRNA-seq)分析 TIL 的转录组。
验证 ATG-101 在获得性耐药肿瘤模型中的抗肿瘤活性。
MC38 荷瘤小鼠先用 atezolizumab 治疗,当疾病进展后改用 ATG-101,评估肿瘤生长和生存期,并通过多重免疫组化分析 TIL。
评估 ATG-101 在食蟹猴中的安全性和耐受性,特别是肝毒性。
进行 4 周重复给药毒性研究,设置 0、10、50、100 mg/kg 剂量组,检测血清 ALT/AST、细胞因子水平,并进行组织病理学检查。
预测 ATG-101 的最佳生物学剂量,指导临床试验设计。
建立三室药理学模型,模拟 ATG-101 在体内的分布、结合和受体占有率,预测三聚体形成和 PD-L1 占有率。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM 培养基 | GIBCO | -- |
| F12K 培养基 | GIBCO | -- | |
| 胎牛血清 | GIBCO | -- | |
| NK92MI 专用培养基 | Procell | CM-0533 | |
| 蛋白纯化 | ExpiCHO 表达系统 | Invitrogen | -- |
| 蛋白 A 层析 | GE | -- | |
| 分子结合检测 | 生物素标记试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | A39257 |
| 脱盐柱 | Thermo Fisher Scientific | 89890 | |
| BCA 蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific (Pierce) | 23225 | |
| 人 PD-L1-Fc 融合蛋白 | Sino Biology | 10377-H05H | |
| 人 4-1BB-Fc 融合蛋白 | ACROBiosystems | 41B-H5258 | |
| Biacore 系统 | GE Healthcare | -- | |
| HBS-EP+ 缓冲液 | GE Healthcare | BR-1006-69 | |
| 抗人 IgG Fc 抗体 | GE Healthcare | BR-1003-50 | |
| CM5 芯片 | GE Healthcare | 29-1496-03 | |
| 人 PD-L1 单体蛋白 | ACROBiosystems | PD1-H5229 | |
| 人 4-1BB 单体蛋白 | ACROBiosystems | 41B-H5227 | |
| 甘氨酸 pH 1.5 | GE Healthcare | BR-1003-54 | |
| 流式细胞术 | 人 Fc 受体阻断液 | BioLegend | 422302 |
| PE 标记抗人 IgG 二抗 | Abcam | ab98596 | |
| APC 标记抗人 IgG 二抗 | BioLegend | 410712 | |
| PD-1/PD-L1 阻断实验 | 链霉亲和素-藻红蛋白 | BioLegend | 405204 |
| T 细胞分离与刺激 | CD3+ T 细胞分选磁珠 | Stemcell | 17951 |
| CD3/CD28 磁珠 | Gibco | 11161D | |
| 流式细胞术 | PD-1 抗体 | BioLegend | 367412 |
| LAG3 抗体 | BioLegend | 369312 | |
| Tim3 抗体 | BioLegend | 345052 | |
| TOX 抗体 | eBioscience | 12-6502-82 | |
| ELISA | 人 IL2 ELISA 试剂盒 | BD Pharmingen | 555190 |
| 人 IFNγ ELISA 试剂盒 | BD Pharmingen | 555142 | |
| 人 TNFα ELISA 试剂盒 | BD Pharmingen | 555212 | |
| 动物实验 | h4-1BB 敲入小鼠 | -- | -- |
| 流式细胞术 | CD45 抗体 | BioLegend | 103188 |
| CD3 抗体 | BioLegend | 100210 | |
| CD4 抗体 | BioLegend | 100438 | |
| CD8 抗体 | BioLegend | 100759 | |
| CD25 抗体 | BioLegend | 102008 | |
| Foxp3 抗体 | eBioscience | 25-5773-82 | |
| 人 CD45 抗体 | BioLegend | 103138 | |
| CD3 抗体 (BD) | BD Biosciences | 740268 | |
| CD8 抗体 (BioLegend) | BioLegend | 100705 | |
| CD25 抗体 (BioLegend) | BioLegend | 102012 | |
| CD69 抗体 | BioLegend | 104536 | |
| CD44 抗体 | BioLegend | 103032 | |
| CD62L 抗体 | BioLegend | 104440 | |
| Ki67 抗体 | eBioscience | 56-5698-82 | |
| CD335 抗体 | BioLegend | 137619 | |
| 多重免疫组化 | CD8 抗体 (CST) | Cell Signaling Technology | 98941 |
| CD4 抗体 (CST) | Cell Signaling Technology | 25229 | |
| F4/80 抗体 | Cell Signaling Technology | 70076 | |
| MHCII 抗体 | Invitrogen | 14-5321-82 | |
| FoxP3 抗体 (CST) | Cell Signaling Technology | 12653 | |
| PD-L1 抗体 (Abcam) | Abcam | ab174838 | |
| DAPI | Sigma | 28718-90-3 | |
| 山羊抗兔 IgG | Leica | DS9800 | |
| 山羊抗兔 IgG | Vector | MP-7444 | |
| Vectra Polaris 自动成像系统 | Akoyabio | -- | |
| scRNA-seq | gentleMACS C 管 | Miltenyi Biotec | -- |
| 酶混合物 | Miltenyi Biotec | 130-096-730 | |
| 死细胞去除试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-090-101 | |
| CD45 (TIL) 磁珠 | Miltenyi Biotec | 130-110-618 | |
| 毒性研究 | 0.9% 氯化钠注射液 | -- | -- |
| 临床生化检测 | 日立-7180 自动临床分析仪 | Hitachi | -- |
| 细胞因子检测 | U-PLEX TH17 Combo 1 (NHP) SECTOR (25PL) | -- | -- |
| 受体占有率测定 | AF647 标记的 YN035 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞系来源 | 细胞系(如 MC38、B16F10、Pan02、EL-4、MCF7、RKO、NCI-H358)的来源和培养条件 阅读提示:Materials and Methods 中的 Cell line 部分 |
| ATG-101 的构建与生产 | ATG-101 的基因序列(来自专利 WO2019196309A1)、表达系统(ExpiCHO)和纯化方法(蛋白 A 层析) 阅读提示:Materials and Methods 中的 Antibody 部分 |
| 体外 4-1BB 激活实验 | 报告基因细胞系(293T-h41BB-NFκB-Luc)和 PD-L1 阳性细胞(CHO-hPDL1)的构建和培养条件,以及 ATG-101 的浓度范围 阅读提示:Results 中“ATG-101 potently activates 4-1BB signaling”部分及相应图注 |
| T 细胞功能实验 | 人 PBMC 供体、T 细胞分离方法、CD3/CD28 刺激条件、PD-L1 阳性细胞类型及 ATG-101 处理浓度 阅读提示:Materials and Methods 中的 Exhausted T-cell induction and reactivation 部分 |
| 体内肿瘤模型 | h4-1BB 敲入小鼠的品系来源(Biocytogen 或 Model Organisms Center)、肿瘤细胞接种数量、起始治疗时肿瘤体积、给药剂量和时间表 阅读提示:Materials and Methods 中的 In vivo efficacy study 各个模型的具体描述 |
| 免疫细胞分析 | 流式细胞术所用抗体克隆号、荧光标记、以及细胞亚群的圈门策略;scRNA-seq 的数据处理参数和参考基因组 阅读提示:Materials and Methods 中的 Drug pharmacodynamic effect 部分和 scRNA-seq data analysis 部分 |
| 非人灵长类毒性研究 | 食蟹猴的品系、每组动物数(5 公 5 母)、给药途径、剂量(0, 10, 50, 100 mg/kg)、给药频率和恢复期长度 阅读提示:Materials and Methods 中的 Toxicity study of ATG-101 in cynomolgus monkeys 部分 |
| 计算建模 | 模型参数(如靶点浓度、内化率、交叉连接速率等)的校准数据来源 阅读提示:Materials and Methods 中的 Computational semimechanistic pharmacology modeling 部分 |