ZEB1通过转录激活PHGDH促进肝细胞癌的癌变和进展

ZEB1 Transcriptionally Activates PHGDH to Facilitate Carcinogenesis and Progression of HCC

作者信息Huihui Wang, Furong Lin, Zhenzhen Xu, Shengnan Yu, Guannan Li, Shan Liao, Wentao Zhao, Fengqiong Zhang, Jinyang Wang, Shijie Wang, Cong Ouyang, Cixiong Zhang, Hailong Xia, Yufei Wu, Bin Jiang, Qinxi Li
PMID37331567
发布时间2023
DOI10.1016/j.jcmgh.2023.06.006

实验完整度

包含体外细胞功能实验、体内原位异种移植和基因敲除小鼠模型、代谢示踪及临床样本分析等多层级验证。

主要模型

MHCC-97H细胞系 肝脏特异性Zeb1敲除小鼠 原位异种移植裸鼠模型

重点核对

ZEB1与PHGDH表达的相关性 ZEB1对PHGDH启动子的非经典结合 ZEB1-PHGDH轴对SSP代谢通量的影响 ZEB1-PHGDH轴对细胞增殖、迁移、侵袭和凋亡抗性的影响 体内肿瘤生长和转移的差异

摘要

磷酸甘油酸脱氢酶(PHGDH)是新生丝氨酸合成途径(SSP)的限速酶,由于其过度表达和促进SSP,与肝细胞癌(HCC)的癌变和转移有关。在以前的实验中,我们发现敲低锌指E-box结合同源盒1(ZEB1)可减少SSP通量,而ZEB1是HCC转移的刺激因子,但其潜在机制仍 largely 未知。本研究旨在确定ZEB1如何调节SSP通量,以及这种调节对HCC癌变和进展的贡献。方法:我们使用肝脏特异性Zeb1基因敲除的转基因小鼠来确定Zeb1缺乏是否影响致癌物二乙基亚硝胺加CCl4诱导的HCC。我们使用均匀标记的[13C]-葡萄糖示踪分析、液相色谱-质谱联用、实时定量聚合酶链反应、荧光素酶报告实验和染色质免疫沉淀实验探讨了ZEB1在SSP通量中的调控机制。我们通过细胞计数实验、甲基噻唑基四唑(MTT)实验、划痕实验、Transwell实验和体外软琼脂实验,以及原位异种移植、生物发光和H&E实验,确定了ZEB1–PHGDH调控轴对HCC癌变和转移的贡献。我们通过分析公开数据集和48对HCC临床标本,研究了ZEB1和PHGDH的临床相关性。结果:我们发现ZEB1通过结合其启动子区域内的非经典结合位点来激活PHGDH转录。上调的PHGDH增强SSP通量,使HCC细胞更具侵袭性、增殖性,并对活性氧和索拉非尼具有抗性。原位异种移植和生物发光实验表明,ZEB1缺陷显著损害HCC的肿瘤发生和转移,而这种损害可以通过外源性PHGDH表达得到很大程度的挽救。这些结果通过以下观察得到证实:小鼠肝脏中ZEB1的条件性敲除显著阻碍了二乙基亚硝胺/CCl4诱导的HCC的癌变和进展,以及PHGDH的表达。此外,对癌症基因组图谱数据库和临床HCC样本的分析显示,ZEB1–PHGDH调控轴预测HCC预后不良。结论:ZEB1通过激活PHGDH转录和随后的SSP通量在刺激HCC癌变和进展中发挥关键作用,加深了我们对ZEB1作为转录因子通过重编程代谢途径促进HCC发展的认识。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
ZEB1如何调控SSP通量,以及这种调控对肝细胞癌癌变和进展的贡献。
核心机制
ZEB1通过结合PHGDH启动子区的非经典结合位点,转录激活PHGDH,增强SSP通量,进而促进GSH和嘧啶合成,赋予HCC细胞ROS和索拉非尼抗性,并促进肿瘤生长和转移。
主要证据
基因敲除小鼠模型显示Zeb1缺失显著抑制DEN/CCl4诱导的HCC发生;体外实验表明ZEB1敲低降低PHGDH表达和SSP通量,PHGDH回补可恢复;原位异种移植实验进一步验证了ZEB1-PHGDH轴对肿瘤生长和转移的作用;临床样本和TCGA数据显示ZEB1与PHGDH表达正相关且预示不良预后。
研究意义
研究揭示ZEB1通过转录激活PHGDH重编程丝氨酸代谢促进HCC进展的新机制,并提出干扰ZEB1对PHGDH的转录调控可能是治疗HCC的新策略。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

验证ZEB1对HCC肿瘤发生的体内作用

通过肝脏特异性Zeb1敲除小鼠模型,验证ZEB1缺乏是否影响DEN/CCl4诱导的HCC发生。

将Zeb1flox/flox小鼠与Alb-Cre小鼠杂交获得肝脏特异性Zeb1敲除小鼠及其野生型同窝仔,给予DEN/CCl4处理,观察肿瘤发生率。

2

探索ZEB1对SSP通量的影响

确定ZEB1是否通过影响SSP代谢通量来发挥作用。

在MHCC-97H细胞中敲低ZEB1并进行LC-MS代谢组学分析,检测SSP代谢物变化。

3

验证ZEB1对PHGDH表达的调控

确定ZEB1是否调控PHGDH的表达和活性。

检测ZEB1敲低后SSP相关酶的表达,并通过Western blot和酶活性实验验证PHGDH的变化。

4

阐明ZEB1转录激活PHGDH的分子机制

确定ZEB1如何转录激活PHGDH,包括结合位点和转录活性。

构建PHGDH启动子荧光素酶报告基因,进行截短和突变分析,结合ChIP-qPCR验证ZEB1的结合。

5

验证ZEB1-PHGDH轴对代谢产物及细胞功能的影响

验证PHGDH上调对GSH和嘧啶合成、ROS水平及细胞增殖、迁移、侵袭的影响。

使用[U-13C]-葡萄糖示踪检测GSH和dTMP的合成,测量ROS水平,并评估细胞增殖、迁移、侵袭和软琼脂集落形成。

6

体内验证ZEB1-PHGDH轴对肿瘤生长和转移的作用

在体内模型中验证ZEB1-PHGDH轴对HCC肿瘤发生和转移的影响。

将稳定表达荧光素酶的MHCC-97H细胞(对照、ZEB1敲低、ZEB1回补、PHGDH回补)原位注射到裸鼠肝脏,8周后通过生物发光成像监测肿瘤生长和转移。

7

临床样本和数据库验证

评估ZEB1-PHGDH表达与HCC预后的临床相关性。

分析TCGA LIHC数据库中ZEB1和PHGDH mRNA水平的相关性,通过IHC和Western blot检测48对HCC组织中蛋白质表达,并分析生存曲线。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
杜氏改良Eagle培养基GEMINIA24G00J
胎牛血清GEMINIA24G00J
支原体检测试剂盒SigmaMP0035-1KT
Hieff Trans脂质体转染试剂YEASEN40802ES03
聚凝胺Merck MilliporeTR-1003-G
G418SigmaPP2374-1KT
荧光素酶检测试剂盒YEASEN11401ES76
TRIzol试剂Invitrogen15596026
Revert Aid逆转录试剂盒Thermo ScientificEP0441
SYBR Green Power 预混液Applied Biosystems4367659
CFX384 TouchBio-Rad--
聚偏二氟乙烯膜Roche--
抗ZEB1抗体Proteintech21544-1-AP
抗PHGDH抗体Proteintech14719-1-AP
抗PSAT1抗体Proteintech10501-1-AP
抗PSPH抗体Proteintech14513-1-AP
抗ZEB2抗体Proteintech14026-1-AP
抗IgG抗体Proteintech14678-1-AP
抗Flag抗体Proteintech66008-4-Ig
抗Actin抗体ProteintechAC-15
[U-13C]-葡萄糖CIL110187-42-3
Waters Acquity BEH C18色谱柱Waters--
D-荧光素----
MaxVision DAB试剂盒MaximKIT-0014
DCFH-DASigmaD6883
碘化丙啶SigmaP4170
Count StarALITIC 1000
CCK-8试剂盒YEASEN40203ES76
基质胶Corning356237
Motic VM1Motic1.0.8.21
ImageJNational Institutes of Health1.4.3.67
全景数字切片扫描系统Leica Aperio Versa 200--
FlowJoBD bioscience14.0.0.0

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
动物模型
小鼠品系:Zeb1flox/flox; Alb-Cre+(肝脏特异性敲除)及野生型对照;DEN/CCl4处理剂量和时间;肿瘤发生率
阅读提示:Methods: Animal Experiments;图1A和B
细胞培养与处理
细胞系:MHCC-97H;培养基DMEM+10%FBS;ZEB1敲低和回补的稳定性;PHGDH回补
阅读提示:Methods: Cell Culture and Stable Cell Line Construction;图1L-M
代谢物检测
[U-13C]-葡萄糖浓度和处理时间(10mM, 20小时);LC-MS条件(色谱柱、流动相)
阅读提示:Methods: LC-MS;图1K-N
转录调控
PHGDH启动子片段(-2093到+87bp);报告基因载体;ChIP抗体和引物;ZEB1结合位点(NCBS)位置
阅读提示:Methods: Luciferase Reporter Assay, Chromatin Immunoprecipitation Assay;图2
功能实验
细胞接种密度(增殖:1×10^5;CCK-8:2×10^3);划痕实验时间(60小时);Transwell中细胞数(2×10^5)和侵袭时间(48小时);软琼脂集落形成(1000细胞,20天)
阅读提示:Methods: Cell Proliferation and Cell Viability, Wound Healing Assay, Cell Invasion Assay, Soft Agar Colony Formation Assay;图4
体内实验
细胞注射密度(1×10^7 cells/50μL PBS);注射位点(左肝叶);生物发光成像(D-luciferin 150mg/kg,ip);肿瘤取材时间(8周)
阅读提示:Methods: Animal Experiments;图5
临床样本分析
样本数量(48对IHC,14对WB);数据库(TCGA LIHC);Kaplan-Meier分析
阅读提示:Methods: HCC Sample, Statistical Analysis;图6