验证PCa细胞系中B7-H3表达
确认B7-H3在前列腺癌细胞系中表达,以支持后续EV检测。
通过免疫荧光(IF)染色检测22Rv1、PC-3和LNCaP细胞系中B7-H3的表达,结果显示B7-H3主要定位在细胞膜上。
B7-H3-liquid biopsy for the characterization and monitoring of the dynamic biology of prostate cancer
该研究包含细胞系模型(22Rv1、PC-3、LNCaP)验证B7-H3表达,合成血浆样本的线性研究,以及临床队列(mCSPC n=43,mCRPC n=103)的定量分析,并具有功能验证(生存分析)和机制验证(配对进展分析)。
22Rv1、PC-3和LNCaP人前列腺癌细胞系 mCSPC和mCRPC患者血浆样本
血浆样本体积:100 μL mCSPC患者数:43,mCRPC患者数:103 B7-H3抗体(Cat. # AF1027,R&D Systems)和TCO-PEG4-NHS酯(点击化学工具) EV Click Beads(mTz-grafted微珠)的制备及点击化学富集条件 RT-qPCR检测ACTB基因(引物序列见补充表S4)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认B7-H3在前列腺癌细胞系中表达,以支持后续EV检测。
通过免疫荧光(IF)染色检测22Rv1、PC-3和LNCaP细胞系中B7-H3的表达,结果显示B7-H3主要定位在细胞膜上。
评估PCa EVs的特性,并验证B7-H3+ EV Assay的定量线性。
从22Rv1细胞培养上清中通过超速离心获得EVs,并进行NTA、TEM和SEM表征。在合成血浆样本中,将已知数量的22Rv1 EVs掺入EV耗尽的健康供体血浆中,然后通过B7-H3+ EV Assay检测ACTB,评估线性相关性。
比较不同疾病状态(mCSPC vs mCRPC)以及健康供体之间的B7-H3+ EV水平。
对来自mCSPC(n=43)和mCRPC(n=103)患者的100 μL血浆样本进行B7-H3+ EV Assay,计算B7-H3+ EV score(40-Ct),并进行组间比较。
评估B7-H3+ EV score对前列腺癌患者总生存期的预测价值。
根据B7-H3+ EV score的中位数,将转移性PCa患者(n=115)和mCRPC患者(n=103)分为高低两组,进行Kaplan-Meier生存分析。
评估同一患者从mCSPC进展到mCRPC时B7-H3+ EV score的变化。
对31名具有配对mCSPC和mCRPC血浆样本的患者进行B7-H3+ EV score比较,分析进展过程中的变化。
评估B7-H3+ EV score在患者疾病自然史中的动态变化,并关联治疗反应和疾病进展。
对5名患者(MID 17, MID 265, MID 109, MID 203, MID 591)的系列血浆样本进行B7-H3+ EV score测定,并与血清PSA和影像学结果进行比较。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| RT-qPCR | CFX Duet实时荧光定量PCR系统 | Bio-Rad Laboratories, Inc., USA | #12016265 |
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Thermo Fisher Scientific, USA | -- |
| DMEM/F-12培养基 | Thermo Fisher Scientific, USA | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Thermo Fisher Scientific, USA | -- | |
| 免疫荧光 | DAPI | Invitrogen | -- |
| 抗山羊IgG(FITC) | Invitrogen | -- | |
| EV富集 | 人B7-H3抗体 | R&D Systems, USA | Cat. # AF1027 |
| TCO-PEG4-NHS酯 | Click Chemistry Tools | -- | |
| EV Click Beads(mTz修饰微珠) | -- | -- | |
| APTES | -- | -- | |
| mTz-PEG-NHS酯 | -- | -- | |
| RT-qPCR | XpressAmp™裂解缓冲液 | Promega, USA | -- |
| PrimeDirect™探针RT-qPCR预混液 | Takara, Japan | -- | |
| 血样采集 | BD Vacutainer塑料采血管 | BD | Cat. #366643 |
| EV表征 | ZetaView PMX-120 | Particle-Metrix, Germany | -- |
| Supra 40VP扫描电镜 | Zeiss, Germany | -- | |
| Tecnai 12 Quick冷冻电镜 | FEI, USA | -- | |
| Nikon Eclipse 90i荧光显微镜 | Nikon | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本处理 | 血浆样本体积(100 μL),离心条件(500 g 10 min,4600 g 10 min),储存条件(-80°C) 阅读提示:请参阅Materials and Methods中的“Clinical Blood Sample Processing”和“Patient enrollment”部分。 |
| EV富集 | EV Click Beads的制备条件,TCO-anti-B7-H3的制备条件(浓度、孵育时间),点击化学富集条件(孵育时间45分钟,离心13000 g 1.5分钟) 阅读提示:请参阅Materials and Methods中的“Fabrication of EV Click Beads”、“Preparation of TCO-grafted B7-H3 antibody”和“Preparation of Synthetic Plasma Samples”部分。 |
| RT-qPCR定量 | RT-qPCR反应条件(90°C 3分钟,60°C 5分钟,45个循环),ACTB引物和探针序列,使用的试剂盒(PrimeDirect™ Probe RT-qPCR Mix)和仪器(CFX Duet) 阅读提示:请参阅Materials and Methods中的“Quantification of ACTB gene expression from enriched B7-H3+ EVs by RT-qPCR”部分和补充表S4。 |
| 统计分析与生存分析 | 分组方法(基于中位数),统计检验(Mann Whitney检验,卡方检验,ANOVA),生存分析中的排除标准(对于配对样本,仅使用mCRPC样本以避免过度代表) 阅读提示:请参阅Materials and Methods中的“Statistical Analysis”部分和结果中的Figure 4 legend。 |
| 配对样本分析 | 配对样本的定义(同一患者mCSPC和mCRPC样本),用于比较的统计方法(配对t检验或Wilcoxon),排除标准 阅读提示:请参阅Materials and Methods中的“Comparison of B7-H3+ EV scores in paired samples of mCSPC and mCRPC”部分和Figure 5 legend。 |