化疗药物处理与表型观察
确定何种化疗药物能引起厌食和体重减轻
对野生型小鼠给予DOX、Cis或PTX,监测食物摄入和体重变化。
Hepatic IRE1α-XBP1 signaling promotes GDF15-mediated anorexia and body weight loss in chemotherapy
包含体外细胞实验、小鼠基因敲除模型、肿瘤移植模型、患者样本及转录组分析,进行了功能验证和机制验证。
C57BL/6小鼠 Huh7人肝癌细胞系 Hepa1-6小鼠肝癌细胞系 原发性小鼠肝细胞
化疗药物类型(DOX、Cis、PTX)及剂量 肝细胞特异性Ern1敲除(LKO)小鼠 AAV介导的肝脏Gdf15敲低 4μ8C处理(IRE1α抑制剂) GDF15水平检测
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定何种化疗药物能引起厌食和体重减轻
对野生型小鼠给予DOX、Cis或PTX,监测食物摄入和体重变化。
鉴定化疗后肝脏中变化的信号通路
对处理小鼠肝脏进行RNA-seq,并进行GSEA分析。
确证肝脏IRE1α-XBP1通路被化疗选择性激活
通过Western blot检测磷酸化IRE1α和XBP1s水平,qPCR检测Xbp1剪接和靶基因表达。
评估肝脏IRE1α缺失对化疗引起的厌食和体重减轻的影响
利用LKO小鼠(肝细胞特异性Ern1敲除)给予DOX或Cis,监测食物摄入和体重。
在病理条件下评估肝脏IRE1α的作用
皮下接种Hepa1-6细胞形成肿瘤,手术切除后给予DOX,监测体重变化。
确证肝脏来源的GDF15在化疗诱导厌食中的作用
使用Gdf15敲除小鼠和肝脏特异性敲低Gdf15的AAV载体。
验证IRE1α-XBP1s直接调控Gdf15转录
在Huh7细胞中过表达IRE1α或XBP1s,敲低ERN1,进行荧光素酶报告基因和ChIP实验。
测试药理学抑制IRE1α活性是否能缓解化疗副作用
使用4μ8C(IRE1α抑制剂)与化疗药物联合处理体外细胞和体内小鼠。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基 | Gibco | C11995500BT |
| 胎牛血清 | Procell | 164210 | |
| 青霉素/链霉素 | Gibco | 15140122 | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000 | Invitrogen | 11668027 |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | T9424 |
| RT-qPCR | SYBR Green PCR系统 | Applied Biosystems | 4309155 |
| 免疫印迹 | SuperSignal West Pico化学发光底物 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Immunobilon Western化学发光HRP底物 | Millipore | -- | |
| 免疫荧光 | 含DAPI的抗淬灭封片剂 | Biosharp | BL739A |
| 动物实验 | 聚氧乙烯蓖麻油 | Sigma-Aldrich | -- |
| 药物处理 | 阿霉素 | Selleck | S1208 |
| 紫杉醇 | Selleck | S1150 | |
| 顺铂 | Sigma-Aldrich | C2210000 | |
| 药理学抑制 | 4μ8C | Selleck | S7272 |
| ELISA | 小鼠/大鼠GDF15 ELISA试剂盒 | R&D | DY6385 |
| 人GDF15 ELISA试剂盒 | R&D | DGD150 | |
| 荧光素酶报告基因 | 双荧光素酶报告基因检测试剂盒 | Beyotime Biotechnology | RG027 |
| 活体成像 | D-荧光素钾盐 | Yeasen Biotechnology | 40902ES03 |
| 免疫荧光 | 抗c-Fos抗体 | Cell Signaling Technology | 2250 |
| 抗GFRAL抗体 | Thermo Fisher Scientific | PA5-47769 | |
| 抗兔IgG-Alexa Fluor 555 | Thermo Fisher Scientific | A32732 | |
| 抗绵羊IgG-Alexa Fluor 488 | Abcam | ab150177 | |
| Western blot | 抗磷酸化IRE1α (Ser724)抗体 | Novus Biologicals | NB100-2323 |
| 抗IRE1α抗体 | Cell Signaling Technology | 3294 | |
| 抗XBP1抗体 | Abcam | ab220783 | |
| 抗α-微管蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 3873 | |
| 抗BiP抗体 | Cell Signaling Technology | 3182 | |
| 抗ATF6抗体 | Cell Signaling Technology | 65880 | |
| 抗磷酸化eIF2α抗体 | Cell Signaling Technology | 9721 | |
| 抗eIF2α抗体 | Cell Signaling Technology | 9722 | |
| 抗ATF4抗体 | Cell Signaling Technology | 11815 | |
| 抗CHOP抗体 | Cell Signaling Technology | 2895 | |
| ChIP | 蛋白G Sepharose 4 Fast Flow | GE Healthcare Biosciences | 17-0618-01 |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Sigma-Aldrich | P8340 | |
| 核糖核酸酶 | Roche | 11119915001 | |
| 蛋白酶K | Thermo Fisher Scientific | EO0491 | |
| ChIP DNA纯化浓缩试剂盒 | Zymo Research | D5201 | |
| 动物实验 | Hepa1-6细胞 | -- | -- |
| 质粒构建 | pGL3载体 | Promega | -- |
| 细胞培养 | HepatoZYME-SFM培养基 | Gibco | -- |
| 肝细胞洗涤培养基 | Gibco | -- | |
| I型胶原酶 | Worthington | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 化疗药物处理 | 药物剂量、给药途径、给药时间点 阅读提示:Methods - Chemotherapy drugs |
| 肝脏IRE1α敲除小鼠 | 小鼠基因型(flox/flox vs LKO)、Cre重组酶表达 阅读提示:Methods - Animals |
| GDF15水平检测 | ELISA试剂盒型号、样本来源(血清/血浆)、处理时间点 阅读提示:Methods - GDF15 protein measurement |
| AAV注射 | AAV血清型、剂量、注射途径、注射时间 阅读提示:Methods - AAV |
| 4μ8C处理 | 4μ8C剂量、溶剂、给药方案 阅读提示:Methods - Mouse studies |