复发性无色杆菌血流感染患者的基因组异质性与谱系特异性β-内酰胺酶研究

由于抗菌药物耐药性和宿主内进化，复发性无色杆菌感染带来了重大的临床挑战。本研究利用新一代测序技术调查了无色杆菌分离株的遗传和表型变化。我们回顾性分析了台湾一家三级医院2016年至2023年间的65例无色杆菌感染病例。使用牛津纳米孔技术对来自复发性血流感染患者的12株分离株进行了全基因组测序。鉴定了耐药基因和β-内酰胺酶，并使用平均核苷酸一致性评估基因组相似性以进行系统发育分析。复发性感染与血流和尿路感染显著相关（p < 0.01）。全基因组测序在物种鉴定上优于基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱，从而发现了一个新的无色杆菌物种，并首次鉴定出A. insuavis作为一种菌血症病原体。β-内酰胺酶根据系统发育分支进行分组，表明了谱系特异性耐药模式。siaT、rapA、atzEa1、AL523_09115和clpA等基因的错义突变与抗菌药物耐药谱的变化相关，提示了复发性感染过程中的体内进化。本研究加深了对无色杆菌基因组异质性的理解，并强调了全基因组测序对于准确物种鉴定和耐药性检测的重要性。研究结果强调需要进行更大规模的研究以监测新出现的变异并评估其临床影响。