跨细胞系转录组分析揭示猴痘病毒感染中的宿主-病毒相互作用

猴痘病毒（MPXV）是一种再度出现的正痘病毒，已引发前所未有的全球疫情。尽管其公共卫生威胁日益严重，但MPXV与宿主相互作用的分子机制仍未得到充分阐明。本研究系统探讨了MPXV Clade IIb感染对不同细胞系宿主转录组的影响，揭示了保守的以及细胞类型特异性的转录组变化。我们的分析显示，与免疫反应、细胞周期调控、代谢、蛋白质合成和表观遗传修饰相关的通路受到显著干扰。此外，我们评估了两种广泛用于MPXV转录组分析的mRNA测序方法，证明与poly(A)尾富集法相比，核糖体RNA去除法能更全面地呈现病毒mRNA。通过跨细胞系比较及在A549细胞中进行时序转录组分析，我们发现了MPXV基因表达的阶段特异性调控。利用时序宿主转录组谱，我们预测并验证了潜在的治疗靶点，证明靶向mTOR通路和生长因子受体的抑制剂能有效抑制MPXV感染。总之，这些发现为理解MPXV与其宿主之间复杂的相互作用提供了关键见解，为开发抗病毒策略和增进对猴痘发病机制的认识奠定了基础。