脂质储存与侵袭能力的关系验证
验证外源性脂肪酸能否促进PDAC细胞侵袭和迁移。
使用油酸(OA)处理PDAC细胞系(mKPC、BxPC3、Panc04.03),检测LD积累、伤口愈合迁移、transwell侵袭、基质降解和invadopodia形成。
KRAS Controls Pancreatic Cancer Cell Lipid Metabolism and Invasive Potential through the Lipase HSL
包含体外细胞实验(迁移、侵袭、LD检测)、基因操作(过表达/敲低)、代谢分析(Seahorse、光学氧化还原比率)、体内原位移植模型及人组织样本验证。
胰腺癌细胞系(mKPC、iKRAS、Panc1、MiaPaCa2、BxPC3、CFPAC、Panc04.03、HPDE) 小鼠原位胰腺癌模型(C57BL/6J小鼠) 基因工程小鼠模型(Ptf1a-Cre;KRAS G12D) 人胰腺组织样本(10例患者匹配的正常、原发和转移组织)
HSL表达与KRAS突变状态的相关性(细胞系及TCGA数据) iKRAS系统中KRASG12D对HSL表达和LD含量的影响 HSL过表达对LD含量、侵袭和迁移的影响 药物抑制ATGL/HSL/MGL或CPT1对侵袭和迁移的影响 体内原位模型中HSL过表达对转移和肿瘤重量的影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证外源性脂肪酸能否促进PDAC细胞侵袭和迁移。
使用油酸(OA)处理PDAC细胞系(mKPC、BxPC3、Panc04.03),检测LD积累、伤口愈合迁移、transwell侵袭、基质降解和invadopodia形成。
验证脂滴储存和脂解活性是否为侵袭所必需。
使用DGAT1/2抑制剂阻断LD形成,使用ATGL抑制剂Atglistatin及HSL/MGL抑制剂CAY10499阻断脂解,检测对transwell侵袭的影响。
验证KRAS是否调控HSL表达及其信号通路。
利用iKRAS细胞系(可诱导KRASG12D表达)检测HSL mRNA和蛋白水平;使用MEK抑制剂U0126处理;比较野生型和KRAS突变细胞系及KC小鼠胰腺组织中的HSL表达。
验证HSL表达水平是否影响脂滴积累和体外侵袭能力。
在mKPC和iKRAS细胞中过表达或敲低HSL,检测LD含量和transwell侵袭;外源OA处理观察能否恢复侵袭。
验证HSL过表达是否能体内抑制胰腺癌转移。
将过表达HSL或对照的mKPC细胞原位注射至C57BL/6J小鼠胰腺,6周后分析原发肿瘤重量和转移数量。
验证HSL表达是否改变肿瘤细胞的代谢模式。
使用Seahorse测定OCR,乳酸生成测定糖酵解,光学氧化还原比率(FAD/(NADH+FAD))检测迁移过程中的代谢状态。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Corning | -- |
| RPMI-1640培养基 | Corning | -- | |
| 胎牛血清 | Sigma | -- | |
| 角质形成细胞无血清培养基 | -- | -- | |
| 多西环素盐酸盐 | Sigma | D9891 | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| 抑制剂处理 | Atglistatin | Cayman Chemical | 15284 |
| CAY10499 | Cayman Chemical | 10007875 | |
| U0126 | Calbiochem | 662005 | |
| H89 | Sigma-Aldrich | B1427 | |
| DGAT1抑制剂 | Sigma-Aldrich | PZ0207 | |
| DGAT2抑制剂 | Sigma-Aldrich | PZ0233 | |
| 依托莫昔 | -- | -- | |
| 转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | 11668-027 |
| Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | -- | 13778-150 | |
| 聚凝胺 | -- | -- | |
| 杀稻瘟菌素 | -- | -- | |
| Western blot | NP-40裂解缓冲液 | -- | -- |
| cOmplete蛋白酶抑制剂混合物 | Roche | 11873580001 | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Pierce | 23225 | |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| HSL抗体 | Cell Signaling | 4107 | |
| 磷酸化HSL抗体 | Cell Signaling | 4139 | |
| ATGL抗体 | Cell Signaling | 2439 | |
| MGL抗体 | Santa Cruz | sc-398942 | |
| 磷酸化ERK抗体 | Cell Signaling | 4377 | |
| ERK抗体 | Cell Signaling | 9102 | |
| 波形蛋白抗体 | Cell Signaling | 5741 | |
| Claudin-1抗体 | Cell Signaling | 13255 | |
| ZO-1抗体 | Cell Signaling | 8193 | |
| Snail抗体 | Cell Signaling | 3879 | |
| E-钙黏蛋白抗体 | BD Biosciences | 610182 | |
| N-钙黏蛋白抗体 | BD Bioscience | 610921 | |
| CPT1抗体 | Cell Signaling | 12252 | |
| PLIN-2抗体 | LSBio | 3121 | |
| PLIN-3抗体 | Proteintech | 10694 | |
| PLIN-5抗体 | Invitrogen | 46215 | |
| 肌动蛋白抗体 | Sigma | A2066 | |
| GAPDH抗体 | Cell Signaling | 5174 | |
| SuperSignal West Pico化学发光底物 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| SuperSignal West Femto化学发光底物 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 免疫组化 | 抗兔HRP-DAB组织染色试剂盒 | R&D Systems | CTS005 |
| HSL抗体 | Sigma | SAB4501762 | |
| αSMA抗体 | Abcam | ab5694 | |
| Ki67抗体 | Cell Signaling | 12202 | |
| 油红O | -- | -- | |
| 侵袭迁移 | Transwell小室 | Millipore | MCEP06H48 |
| 基质胶 | Corning | 356231 | |
| Hoechst 33342 | Invitrogen | H3570 | |
| CellTiter 96 AQueous非放射性细胞增殖检测试剂盒 | Promega | G5421 | |
| 碘化丙啶 | Sigma | P4864 | |
| 荧光显微镜 | 鬼笔环肽-TRITC | Sigma | P1951 |
| 皮层肌动蛋白抗体4F11 | Upstate Biotechnology | 05-180 | |
| Cy5二抗 | Jackson ImmunoResearch | 115-175-166 | |
| C12-BODIPY | Thermo Fisher | D3822 | |
| Zeiss LSM 780共聚焦显微镜 | Zeiss | -- | |
| qPCR | RNeasy Plus微型试剂盒 | Qiagen | 74134 |
| Super Script III第一链合成试剂盒 | Invitrogen | 18080-51 | |
| SYBR Green荧光染料 | -- | -- | |
| LightCycler 480实时荧光定量PCR仪 | Roche | 04707516001 | |
| 动物实验 | C57BL/6J小鼠 | The Jackson Laboratory | -- |
| Ptf1a-Cre小鼠 | The Jackson Laboratory | 023329 | |
| KRAS LSL-G12D小鼠 | The Jackson Laboratory | 008179 | |
| 代谢分析 | Seahorse XF24分析仪 | Agilent | -- |
| Seahorse XF细胞线粒体压力测试试剂盒 | Agilent | 103015-100 | |
| Seahorse XF24 FluxPak耗材 | Agilent | 100867-100 | |
| 糖酵解细胞检测试剂盒 | Cayman Chemical | 600450 | |
| ATP检测试剂盒 | Cayman Chemical | 700410 | |
| Zeiss LSM 510共聚焦显微镜 | Zeiss | -- | |
| Celigo细胞成像分析仪 | Nexcelom Bioscience | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 脂质负荷实验 | 油酸(OA)浓度:200 μM;处理时间;细胞密度;LD染色方法(ORO、BODIPY)。 阅读提示:Results 图1A-B及图例 |
| 侵袭实验 | 细胞数量:3×10^5;Transwell孔径:8 μm;基质胶浓度:1 mg/mL;血清浓度:上室0.1%,下室10%;侵袭时间:16小时;染色计数方法。 阅读提示:Materials and Methods: Migration, invasion, and proliferation analysis |
| KRAS诱导系统 | iKRAS细胞系培养条件(doxycycline浓度1 μg/mL);去除doxycycline的时间(24-72小时);验证KRAS状态的方法(p-ERK)。 阅读提示:Materials and Methods: Cell culture; Results 图3C |
| HSL过表达和敲低 | 质粒构建(HSL-GFP、pLenti6.3);转染试剂(Lipofectamine 2000、RNAiMAX);筛选抗生素(Blasticidin 5 μg/mL,14天);siRNA靶点(siGENOME SMARTpool)。 阅读提示:Materials and Methods: Transfections and establishment of stable cell lines |
| 代谢分析 | Seahorse实验耗材和试剂盒(Mito Stress Test Kit、XF24 FluxPak);细胞数量;归一化方法(Hoechst阳性细胞数);OCR测定条件。 阅读提示:Materials and Methods: Metabolic analyses |
| 体内实验 | 小鼠品系和性别:C57BL/6J雌性,6周龄;细胞数量:1×10^4;注射部位:胰腺尾部;观察时间:6周或体重下降>10%;样本量:每组10只。 阅读提示:Materials and Methods: In vivo experiments |
| 人类样本分析 | 样本来源:Mayo Clinic SPORE;样本类型:正常、原发、转移组织;样本量:10例患者;IHC评分方法。 阅读提示:Materials and Methods: Immunohistochemistry (IHC) |