生化激酶活性测定
评估NVL-520对野生型ROS1和ROS1 G2032R的抑制活性
使用PhosphoSens测定对纯化的ROS1和ROS1 G2032R激酶域进行IC50测定
NVL-520 Is a Selective, TRK-Sparing, and Brain-Penetrant Inhibitor of ROS1 Fusions and Secondary Resistance Mutations
包含生化激酶实验、细胞活力实验、体内异种移植模型、颅内模型及临床病例验证,并对TRK选择性进行多种分析。
Ba/F3细胞系(表达野生型或突变ROS1融合) 患者来源异种移植模型(PDX;CTG-0848、Lu01-0414、MGH9018-1、CTG-2532) Ba/F3 CD74–ROS1 G2032R细胞系异种移植(CDX)模型 颅内Ba/F3 CD74–ROS1 G2032R荧光素酶异种移植(CDX)模型
模型:Ba/F3细胞系、患者来源异种移植模型(CTG-0848、Lu01-0414、MGH9018-1、CTG-2532)、Ba/F3 CD74–ROS1 G2032R异种移植模型、颅内Ba/F3 CD74–ROS1 G2032R荧光素酶异种移植模型 处理药物及剂量:NVL-520(0.04、0.2、1、2、5、15 mg/kg b.i.d.,口服) 对照药物:repotrectinib(CTG-2532和Ba/F3模型中15及75 mg/kg b.i.d.) 检测终点:肿瘤体积变化、中位总生存期(mOS)、ROS1信号通路抑制(p-ROS1等) 统计设计:各组小鼠数量(每组4至8只;颅内实验每组7至10只)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估NVL-520对野生型ROS1和ROS1 G2032R的抑制活性
使用PhosphoSens测定对纯化的ROS1和ROS1 G2032R激酶域进行IC50测定
评估NVL-520对335种激酶的选择性
使用放射性标记[γ-33P]-ATP进行激酶活性抑制测定,检测NVL-520对335种激酶的抑制效果
评估NVL-520对ROS1驱动细胞系增殖的抑制活性
使用细胞活力测定(CellTiter-Glo或WST-8)评估NVL-520对表达野生型或突变ROS1融合的细胞系的IC50
评估NVL-520对TRK的选择性
通过生化激酶测定、细胞活力测定(表达TPM3–TRKA、ETV6–TRKB、ETV6–TRKC的Ba/F3细胞)和细胞磷酸化测定(BDNF刺激的TRKB Ba/F3细胞)测定TRK抑制效力
评估NVL-520在携带ROS1融合肿瘤(野生型或G2032R)小鼠模型中的抗肿瘤活性
在皮下异种移植模型中,口服给予NVL-520,测量肿瘤体积变化,并进行Western blot分析肿瘤p-ROS1水平
评估NVL-520对颅内ROS1驱动肿瘤的活性
建立颅内Ba/F3 CD74–ROS1 G2032R荧光素酶模型,通过生物发光成像监测肿瘤负荷,并评估总生存期(mOS)
评估NVL-520在ROS1融合阳性肺癌患者中的初步临床活性
在ARROS-1临床试验剂量递增阶段,对三名TKI难治性患者给予NVL-520治疗,并通过影像学评估肿瘤反应
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 生化激酶活性测定 | 克唑替尼 | Combi-Blocks, MedChemExpress, SelleckChem | -- |
| 恩曲替尼 | Ark Pharm Inc., Advanced Chemblocks, SelleckChem | -- | |
| 洛拉替尼 | Ark Pharm Inc., eNovation Chemicals, SelleckChem | -- | |
| 他雷替尼 | MedChemExpress | -- | |
| 瑞普替尼 | Ark Pharm Inc., MedChemExpress, SelleckChem, DC Chemicals | -- | |
| NVL-520 | 文中未明确说明 | -- | |
| ROS1激酶域 | Carna | 08-163 | |
| ROS1 G2032R激酶域 | SignalChem | R14-12BG | |
| TRKA激酶域 | BPS Bio | 40280 | |
| TRKB激酶域 | SignalChem | N17-11G | |
| TRKC激酶域 | BPS Bio | 40282 | |
| AQT0101 | AssayQuant Technologies | AQT0101 | |
| AQT0104 | AssayQuant Technologies | AQT0104 | |
| 细胞活力测定 | CellTiter-Glo试剂 | Promega | -- |
| WST-8检测 | Bimake | -- | |
| 细胞磷酸化测定 | 磷酸化TRKA/TRKB AlphaLISA试剂 | PerkinElmer | ALSU-PTRKAB |
| Western blot | Pierce BCA蛋白测定 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Laemmli样品缓冲液 | -- | -- | |
| 4-20%预制梯度Bis-tris凝胶 | Invitrogen | -- | |
| 磷酸化ROS1 Y2274抗体 | Cell Signaling Technology | 3078 | |
| DYKDDDDK [Flag]抗体 | Invitrogen | 8H8L17 | |
| 磷酸化SHP2抗体 | Bimake | A5278 | |
| 磷酸化ERK1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 9101 | |
| ERK2抗体 | Santa Cruz | sc-1647 | |
| 磷酸化S6抗体 | Cell Signaling Technology | 4858 | |
| S6抗体 | Cell Signaling Technology | 2216 | |
| 磷酸化Akt抗体 | Cell Signaling Technology | 4060 | |
| Akt抗体 | Cell Signaling Technology | 9272 | |
| 肌动蛋白抗体 | Developmental Studies Hybridoma Bank | JLA-20 | |
| 磷酸化ROS1 Y2274抗体 | Cell Signaling Technology | 3078 | |
| ROS1抗体 | Cell Signaling Technology | 3287 | |
| 磷酸化AKT S473抗体 | Cell Signaling Technology | 4060 | |
| AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 4691 | |
| 磷酸化ERK1/2 T202/Y204抗体 | Cell Signaling Technology | 9101 | |
| ERK1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 9102 | |
| 磷酸化S6 S240/244抗体 | Cell Signaling Technology | 5364 | |
| S6抗体 | Cell Signaling Technology | 2217 | |
| β-肌动蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 4970 | |
| 菌株构建 | QuickExtract DNA提取液 | Lucigen | -- |
| Biotool DNA转染试剂 | Biotool | -- | |
| ABM PCR支原体检测试剂盒 | ABM | G238 | |
| Lonza MycoAlert检测试剂盒 | Lonza | LT07-710 | |
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清(FBS) | -- | -- | |
| 二甲亚砜 | -- | -- | |
| 细胞活力测定 | 星孢菌素 | -- | -- |
| 动物实验 | NVL-520 | 文中未明确说明 | -- |
| 瑞普替尼 | DC Chemicals | -- | |
| 克唑替尼 | -- | -- | |
| 20%羟丙基-β-环糊精(HP-β-CD) | -- | -- | |
| 0.5%羧甲基纤维素 | -- | -- | |
| 1%吐温-80 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 生化激酶活性测定 | ROS1、ROS1 G2032R、TRKA、TRKB、TRKC激酶域浓度(分别为0.25、1、0.5、1.5、0.5 nmol/L);ATP浓度(1 mmol/L);底物肽(AQT0101或AQT0104) 阅读提示:Methods: PhosphoSens assay |
| 激酶组筛选 | 激酶数量(335种);NVL-520浓度(100 nmol/L和1 μmol/L) 阅读提示:Methods: Kinase Panel Screening |
| 细胞活力测定 | 细胞系类型(Ba/F3、MGH193-1等);处理时间(72小时或5天);起始细胞数(Ba/F3 1000/weel;MGH193-1 4000/well);重复次数(n≥2) 阅读提示:Methods: Cell Viability Assay |
| TRK选择性分析 | TRK生化激酶浓度(0.5、1.5、0.5 nmol/L);细胞活力用Ba/F3表达TPM3–TRKA、ETV6–TRKB、ETV6–TRKC;BDNF浓度(100 ng/mL) 阅读提示:Methods: Biochemical Kinase Activity Assay, Cell Viability Assay, Cellular Phosphorylation Assay |
| 体内异种移植研究 | 动物品系(Nude-Foxn1nu、Balb/c nude等);细胞或肿瘤片段植入数量(1×10^6或30 mm³);给药剂量(0.04-15 mg/kg b.i.d.);治疗时长(20-42天) 阅读提示:Methods: In Vivo Studies (Subcutaneous Xenograft Studies) |
| 颅内异种移植研究 | 细胞植入数量(1×10^5);给药剂量(2 mg/kg b.i.d.);治疗时间(61天);每组动物数(7-10) 阅读提示:Methods: Kp,uu and Intracranial Studies |