病毒感染性和受体表达评估
评估AT/RT和PNET细胞对Delta-24-RGD感染的允许性
通过生物信息学分析患者数据集中病毒受体(ITGAV、ITGB3、ITGB5、CXADR)的表达,并在细胞系中用流式细胞术检测受体表达;用携带GFP的Delta-24-RGD感染细胞,通过荧光显微镜和流式细胞术测定感染效率。
Delta-24-RGD, an Oncolytic Adenovirus, Increases Survival and Promotes Proinflammatory Immune Landscape Remodeling in Models of AT/RT and CNS-PNET
研究包含体外细胞实验(感染、复制、细胞毒性、DAMP释放)、多种原位小鼠模型(早期、已建立、弥散性)以及人源化免疫活性模型,并进行了功能验证和机制验证(免疫细胞浸润分析),证据层级多样。
AT/RT细胞系(BT-12、CHLA-06、CHLA-266) PNET细胞系(PFSK-1) 同位移植小鼠模型(纹状体、小脑、脑室) 人源化小鼠模型(hCD34+-NSG-SGM3)
病毒受体(CAR、整合素αvβ3/αvβ5)在肿瘤细胞中的表达水平 E2F1转录活性(肿瘤细胞复制许可性) 病毒剂量(10^7或10^8 PFU/只,单次瘤内注射) 治疗时间点(肿瘤建立早期或30天后已建立) 免疫细胞浸润(CD8+ T细胞、CD68+巨噬细胞、Iba-1+小胶质细胞)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估AT/RT和PNET细胞对Delta-24-RGD感染的允许性
通过生物信息学分析患者数据集中病毒受体(ITGAV、ITGB3、ITGB5、CXADR)的表达,并在细胞系中用流式细胞术检测受体表达;用携带GFP的Delta-24-RGD感染细胞,通过荧光显微镜和流式细胞术测定感染效率。
验证Delta-24-RGD在肿瘤细胞中的复制能力
通过E2F1启动子活性测定验证复制许可性;感染后检测病毒蛋白E1A和fiber表达,并在72小时测定病毒滴度。
评估Delta-24-RGD对肿瘤细胞的杀伤效果
用不同MOI感染细胞,在不同时间点用MTS或台盼蓝染色测定细胞活力。
评估Delta-24-RGD是否诱导免疫原性细胞死亡
感染后72小时检测培养上清中DAMPs(Hsp90α、HMGB1、ATP)浓度;感染后4小时检测细胞表面CRT转位。
评估Delta-24-RGD在体内对肿瘤的治疗效果
在多种原位小鼠模型(纹状体、小脑、脑室)中接种肿瘤细胞,并进行单次瘤内注射Delta-24-RGD或PBS,监测生存期。
在免疫活性环境中评估Delta-24-RGD的疗效和免疫反应
在hCD34+-NSG-SGM3人源化小鼠中建立肿瘤模型,单次注射病毒,监测生存期、体重变化,并通过多光谱免疫荧光分析肿瘤免疫微环境。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 病毒受体表达检测 | FACSCantoII流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| FlowJo V10软件 | BD Biosciences | -- | |
| E2F1活性检测 | Fugene 6转染试剂 | Promega | E2691 |
| pRL-CMV质粒 | Promega | E2261 | |
| 双荧光素酶报告基因检测系统 | Promega | E1910 | |
| Western blot | 蛋白质测定染料试剂 | Bio-Rad Laboratories | -- |
| 细胞活力检测 | CellTiter 96 Aqueous One Solution细胞增殖检测试剂盒 | Promega | G3581 |
| DAMP检测 | Hsp90α ELISA试剂盒 | Enzo Life Sciences Inc. | ADI-EKS-895 |
| HMGB1 ELISA试剂盒 | IBL International | ST51011 | |
| ENLITEN ATP检测系统 | Promega | FF2000 | |
| CRT转位检测 | 4%无甲醇甲醛 | Thermo Fisher Scientific | 28906 |
| 组织学染色 | 抗六邻体抗体 | Merck Millipore | AB1056 |
| 抗E1A抗体 | Santa Cruz | sc-430 | |
| 抗CD3抗体 | Thermo Fisher | RM9107 | |
| 抗Iba-1抗体 | Wako | 019-19741 | |
| 抗GFP抗体 | Abcam | ab6556 | |
| Vectastain ABC试剂盒 | Vector Laboratories Inc. | -- | |
| 多重免疫荧光 | Opal荧光染料 | Akoya Biosciences | -- |
| Vectra-Polaris自动定量病理成像系统 | Akoya Biosciences | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 病毒感染性测定 | 细胞系(BT-12、CHLA-06、CHLA-266、PFSK-1),MOI(0.1-100 PFU/cell),感染时间(48小时) 阅读提示:Materials and Methods: Infectivity assays; Figure 1D |
| 病毒复制验证 | 细胞系,MOI(10 PFU/cell),时间点(16和72小时) 阅读提示:Materials and Methods: Viral replication assays; Figure 2C |
| 细胞毒性测定 | 细胞系,MOI(0.1-50 PFU/cell),时间点(3和5天) 阅读提示:Materials and Methods: Cell viability assays; Figure 2D |
| 体内生存实验 | 动物品系(裸鼠、Balb/c-Rag2-/-Il2rg-/-、hCD34+-NSG-SGM3),细胞接种数量(PFSK-1: 1e5,CHLA-06: 2e6,CHLA-266: 2e6,BT-12: 1e6),接种部位(纹状体、小脑、脑室),治疗剂量(10^7或10^8 PFU),治疗时间(接种后7-29天) 阅读提示:Materials and Methods: Animal procedures and in vivo tumor models; Figures 3-5 |
| 免疫微环境分析 | 抗体(CD3、CD8、CD20、CD68、CD11b、Iba-1),成像系统(Vectra-Polaris) 阅读提示:Materials and Methods: Multiplexed immunofluorescence; Figure 5C-5E |